Nat. Methods. 速递:考虑生物背景信息的单细胞蛋白质计算模型
通过结合单细胞转录组数据、蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络、细胞相互作用和组织层次数据,为每个蛋白质生成细胞类型特异的低维表示,该模型生成的结果能够显著增强之前仅通过蛋白三维结构得到的通用表示,进而完成诸如发现靶点、分析特定细胞类型的药物反应等下游任务。
AlphaFold为什么能精准预测蛋白质结构?
甲状腺素等激素是蛋白质;参加免疫反应的抗体也是蛋白质……据估计,人体内至少存在2万种不同类型的蛋白质,这些蛋白质的结构和功能千差万别,但构成它们的基本元素是一样的——由20种氨基酸通过不同的排列组合而构成,譬如胰岛素就是由16种、51个氨基酸构成的。
在这迷人又壮美的科学领域,“中国玩家”能奋起直追吗?
已知的蛋白质结构可以分为四个层次。一级结构可以理解为一条线性的字符串。基本组成单元是一个个的氨基酸,即一个个的字母。常见的氨基酸只有20种,所以一级结构的字符串通常只包含20种字母,不包含的6种字母是BJOUXZ。二级结构就是在一级结构的字符串的基础上,肽链进行折叠变换,形成一种局部的三维结构。三级结构就...
不只是 AlphaFold!一文读懂蛋白质折叠的前世今生:从“不可能”到...
它们承担着各种各样的功能:血红蛋白和肌红蛋白将氧气运输到肌肉和全身;角蛋白为头发、指甲和皮肤提供结构;胰岛素使葡萄糖进入细胞,转化为能量。蛋白质可以呈现出看似无穷多的形状,从而匹配它们在生命活动中执行的看似无穷多的任务。“从原子到生态系统,(蛋白质结构)就像是一种通用语言,”AlQuraishi说道。“所有事情...
追问weekly | 过去一周,脑科学领域有哪些新发现?
结果显示,V-ATPase的转子上有规律地排列着胆固醇分子,并且与突触小泡中最丰富的蛋白质突触蛋白以化学计量比结合。ATP水解过程中,SV膜上的V1复合体解离,表明小泡加载过程足以诱导酶的解离。研究发现,V-ATPase在加载神经递质(Neurotransmitters)到突触小泡后,会自发解体,这一过程控制了神经递质的释放。V-ATPase与突触蛋白...
专访腾讯AI Lab姚建华、杨帆:腾讯 AI Lab 为何瞄准单细胞蛋白质组...
AlphaFold主要分析的是单个蛋白质的结构,例如蛋白质的折叠方式或几个蛋白质之间的相互作用,它关注的是单个蛋白质的三维结构,以及其功能和对人体细胞的作用(www.e993.com)2024年9月16日。而我们的研究则是从另一个角度出发,分析细胞内所有蛋白质的表达模式。我们知道,人体有数以亿计的蛋白质,即使是单个细胞内也有成千上万的蛋白质。我们的...
万字长文:人工智能终结了蛋白质研究吗?| 追问观察
??蛋白质是具有数亿种不同结构的分子。每一种都具有特定的生物功能,有些负责在血液中输送氧气,有些则负责引发化学反应。具体功能通常由其形状或结构决定。上:从左往右依次为SARS-COV-2刺突蛋白、新冠疫苗靶点;5-羟色胺受体、管控情绪与消化;血红蛋白、输送血液中的氧气;细胞因子、调节免疫防御。
专访姚建华、杨帆:腾讯 AI Lab 为何瞄准单细胞蛋白质组学
姚建华:正如杨帆所提到的,蛋白质结构在AI领域中,尤其是AlphaFold这样的技术最为人所熟知。AlphaFold主要分析的是单个蛋白质的结构,例如蛋白质的折叠方式或几个蛋白质之间的相互作用,它关注的是单个蛋白质的三维结构,以及其功能和对人体细胞的作用。而我们的研究则是从另一个角度出发,分析细胞内所有蛋白质的表达...
茶叶是由什么组成的呢,揭秘茶叶:由哪些成分构成?
茶叶作为一种要紧的我们饮料,有着悠久的历和丰富的品种。在结构层次上,茶叶可以分为白茶、绿茶、黄茶、乌龙茶和红茶五大类。首先是白茶,它是指未经任何加工的新茶叶,只是经过简单的干燥应对。白茶的特点是叶茎叶朵毫完整,干燥后叶片和茎呈银白色,色清澈明亮。更具代表性的白茶有福鼎白茶和广西白茶。
夏天这样吃太绝了,好吃减脂贼方便,摆摊人都来向你学!
肉蛋类(大多瘦肉和蛋类在100~300kcal/100g,蛋白质10%~20%)适合:鸡蛋、鹌鹑蛋、鸡胸肉、猪里脊、牛腱子肉、蹄筋、无骨鸡爪不适合:五花肉、肥牛、培根、猪蹄、火腿、鸡翅·豆制品:富含优质植物蛋白、膳食纤维及多种矿物质,热量适中且易于消化,素食者代替肉类的优质来源。