AlphaFold为什么能精准预测蛋白质结构? | 返朴
蛋白质是美食的代名词,更是生命功能的物质基础,处处发挥作用:负责运送氧气的血红蛋白是蛋白质;帮助我们消化食物的消化酶是蛋白质;胰岛素、甲状腺素等激素是蛋白质;参加免疫反应的抗体也是蛋白质……据估计,人体内至少存在2万种不同类型的蛋白质,这些蛋白质的结构和功能千差万别,但构成它们的基本元素是一样的——由...
不只是 AlphaFold!一文读懂蛋白质折叠的前世今生:从“不可能”到...
它们承担着各种各样的功能:血红蛋白和肌红蛋白将氧气运输到肌肉和全身;角蛋白为头发、指甲和皮肤提供结构;胰岛素使葡萄糖进入细胞,转化为能量。蛋白质可以呈现出看似无穷多的形状,从而匹配它们在生命活动中执行的看似无穷多的任务。“从原子到生态系统,(蛋白质结构)就像是一种通用语言,”AlQuraishi说道。“所有事情...
汇集结构质谱尖兵,开拓蛋白质结构生物学的新天地——第十四届质谱...
为将蛋白结构质谱技术的应用拓展至生物样本乃至临床样本中,我们针对背景基质复杂、糖基化等修饰异质性高、超大分子量颗粒结构层次多样等问题,以非变性质谱等质谱手段为核心工具开发了一系列组合策略,提供生物样本乃至临床样本中的蛋白高级结构和相互作用关系信息。报告人:中国科学院大连化学物理研究所研究员王方军报...
科学家解析光合玫瑰菌反应中心-捕光复合体结构,助推原核生物光合...
而蛋白X和Y的氨基酸序列,在光合玫瑰菌的蛋白质数据库中都未被定义,却在维持反应中心-捕光复合体结构的稳定,以及形成醌的穿梭通道中发挥着重要作用。并且,为了探究类胡萝卜素的组装对反应中心-捕光复合体结构和光化学功能的影响,他们还用类胡萝卜素的生物合成抑制剂二苯胺,对光合玫瑰菌进行了处理。其中,二...
【科学家掠影】江山代有才人出:中国新生代结构生物学家 |...
结构生物学囊括了核磁共振、X射线和冷冻电镜等多种技术,我有幸实践了所有这些方法。这一领域的精髓在于揭示原子之间错综复杂的舞蹈,探索将原子转化为功能性蛋白质的微妙联系。此外,结构生物学还要将这些复杂结构传达给更广泛受众,为人们深入了解蛋白质内部运作提供洞见。对我来说,结构生物学是科学与艺术之间的动态互动,...
解锁蛋白质科学新领域:北大团队提出拓扑改造新方法,助力迈向高...
“本次工作解锁了蛋白质科学的新领域,从化学意义上大大打开了蛋白质拓扑结构的边界(www.e993.com)2024年7月24日。”北京大学教授张文彬表示。日前,他和团队打造出一款具有一定普适性的蛋白质拓扑改造方法,可以在不改变蛋白质三维结构和功能的前提下,对其化学拓扑结构进行改造,从而提升其稳定性。这提示着对于大自然中的线型蛋白质来说,都可能存在...
结构生物学:我们用一百年改变了什么?
蛋白质的折叠方式与空间构象对于蛋白质的功能有着决定性的作用。掌握了蛋白的三维结构,就掌握了开启和关闭蛋白功能的钥匙。在接下来的几十年里,一个又一个重要的蛋白质结构被解析出来,核糖体、肌动蛋白、ATP酶、氧化还原酶、RNA聚合酶……结构生物学的黄金时期一直持续到本世纪,以至于2006年诺贝尔化学奖获得者罗杰...
...表型组学前沿论坛第68期—周耀旗教授:序列、结构、功能和表型...
生物高分子的序列与表型的关系,是通过它所折叠的结构及结构所承载的功能而体现出来。虽然有60多年的努力,在2018年前,蛋白质结构预测的进展甚少---这是从1994年起,每两年一次的国际蛋白质结构预测竞赛(CASP)所得到的结论。然而,在2018年CASP13中出现的AlphaFold第一次体现出预测精确度的质的飞跃;而2020年CASP...
表型组学前沿论坛第68期:序列、结构、功能和表型:从结构预测谈起
生物高分子的序列与表型的关系,是通过它所折叠的结构及结构所承载的功能而体现出来。虽然有60多年的努力,在2018年前,蛋白质结构预测的进展甚少---这是从1994年起,每两年一次的国际蛋白质结构预测竞赛(CASP)所得到的结论。然而,在2018年CASP13中出现的AlphaFold第一次体现出预测精确度的质的飞跃;而2020年CASP...
天津医科大学2025研究生考试大纲:《618生物化学与分子生物学》
●掌握蛋白质结构与功能的关系●掌握蛋白质的分离纯化的原则和方法2.核酸化学考试内容●核酸的种类和分布及核酸的生物功能●核苷酸的结构●DNA和RNA一级结构的概念和二级结构要特点;DNA的三级结构●核酸的主要理化特性●核酸的研究方法考试要求