AI+Science新视野:用物理信息引导AlphaFold 2预测蛋白质动力学

Wolynes等人还提出了蛋白质折叠中的阻挫最小原理(principleofminimalfrustration):即蛋白质的序列在进化中不断被优化,使得在能量面上较少出现局部极小值或能量障碍,进而有助于蛋白质更容易地找到其全局能量最低的天然构象[4]。这一原理解释了为什么大多数天然蛋白质可以在细胞环境中迅速且高效地折叠成其特定的...

“科学突破奖”获得者,成功绘制人类主要激酶底物特异性图谱

激酶是催化这一过程的蛋白质，目前已经鉴定出538种蛋白质激酶，已知的磷酸化位点超过10万个。激酶是信号转导的重要介质和多种细胞功能的关键调节器，几乎调节所有的细胞活动，如生长、分裂、代谢等，细胞通路的功能障碍会导致各种疾病。激酶是许多识别参与细胞功能障碍疾病和癌症的药物靶点。但是科学家并不清楚有哪些激酶...

了解癌症中的蛋白质脂质化

在人类中,S-棕榈酰化由ZDHHC家族中的23种蛋白质催化,其去除可由丝氨酸水解酶超家族的多种APT催化,包括APT1、APT2和含有α/β水解酶结构域(ABHD)的蛋白质ABHD17A、ABHD17B、ABHD17C和ABHD10,使S-棕榈酰化成为一类独特的可逆和动态的蛋白质脂质化。在超过100项蛋白质组学和生物化学研究中,超过2400种哺乳动...

蛋白激酶“兼职”功能,决定癌细胞命运,癌症治疗新靶点

通过磷酸化作用参与组蛋白和DNA修饰,从而改变染色质结构并直接调节基因转录。如PKM2的激酶活性通过磷酸化组蛋白H3,调节基因表达。此外,一些激酶还可通过甲基化、乙酰化、琥珀酰化以及糖基化等调节染色质构象,进而影响基因表达。2、调节细胞周期进程和DNA修复糖酵解酶丙酮酸激酶M2(PKM2)可以磷酸化纺锤体组装蛋白Bub3...

...蛋白质相互作用抑制剂,靶向治疗侵袭性癌症 | 瑞士创新100强

F2i是同类首创非激酶小分子蛋白质-蛋白质相互作用抑制剂。传统FGF抑制剂主要针对FGFR的直接或间接小分子激酶,但这种抑制FGF信号传导的方式会导致耐药性和脱靶相关的副作用和毒性。与传统的FGFR激酶抑制剂不同,F2i不靶向或结合任何FGFR,而是通过结合FGF信号下游的独家衔接蛋白,抑制促侵袭性FGF信号,进而阻止FGF信号通路...

Nature 子刊!蛋白激酶「兼职」功能竟能促癌(附激酶新功能汇总)

图3.磷酸化修饰调节染色质构象,进而影响基因表达2.调节细胞周期进程和DNA修复糖酵解酶丙酮酸激酶M2(PKM2)的蛋白激酶活性,可以磷酸化纺锤体组装蛋白Bub3,调节染色体分离和有丝分裂检查点(www.e993.com)2024年11月25日。在细胞核中,PKM2磷酸化CtBP相互作用蛋白(CtIP),增加DNA双链断裂处CtIP的招募,促进DNA断裂末端的损伤...

不只是AlphaFold!一文读懂蛋白质折叠的前世今生:从“不可能”到...

Anfinsen假设,应该有一种方法可以根据氨基酸序列预测蛋白质的形状。这就是后来广为人知的蛋白质折叠问题。一旦多肽链组装完成,蛋白质就可以在千分之一秒内折叠成自己的结构——这让分子生物学家CyrusLevinthal感到困惑。在他于1969年发表的论文HowtoFoldGraciously中,他计算出,如果一个蛋白质要尝试每...

CDK5强效II型激酶抑制剂:开辟胶质母细胞瘤治疗新前沿

在人类基因组中鉴定的518种激酶中，周期蛋白依赖性激酶（cyclin-dependentkinase,CDKs）在细胞周期控制和转录调控中发挥重要作用。CDK5参与大脑发育功能，如神经元细胞存活、突触可塑性和神经元分化。然而，CDK5在胶质瘤组织中的表达大约是正常脑组织的6倍，激酶活性的失调有助于GBM的增殖和转移。先前关于抑制CDK5治疗...

主成分只添加纳豆激酶,iSDG纳豆生活小胶囊大营养

主成分只添加纳豆激酶,iSDG纳豆生活小胶囊大营养作为养生益寿佳品,纳豆已被养生达人列为具有重要保健作用的食品。纳豆,由蒸过的黄豆加上人工培养出的纳豆菌混合后,放在容器中使之发酵而制成的豆制品,具有黏性,气味较臭,味道微甜的特点。它不仅保有黄豆的营养价值,提高蛋白质的消化吸收率,更重要的是发酵过程产生...

陈玲玲:RNA有自己的特点,别把它当蛋白质来“玩” | 走近科学

此外,小于500个核苷酸的短链环形RNA也很容易形成分子内的双链结构,从而折叠为一类特殊结构的分子与蛋白质相互作用,如抑制免疫因子——双链RNA活化的蛋白激酶(PKR),进而参与天然免疫的调控。这些研究提示环形RNA很适合被开发为RNA适配体,有望在生物医药领域应用。