人工智能助力破解蛋白质神奇结构密码

蛋白质通常由20种不同的氨基酸组成。在蛋白质中,氨基酸以长链连接在一起,折叠起来形成独特的三维结构,这对蛋白质的功能至关重要。要了解生命如何运作,首先就需要了解蛋白质的形状和结构。自19世纪以来,化学家就已了解蛋白质对生命过程的重要性。但直到20世纪50年代,随着研究工具精度的提高,研究人员才开始借助仪器解...

人工智能助力破解蛋白质神奇结构密码——2024年诺贝尔化学奖成果...

蛋白质通常由20种不同的氨基酸组成。在蛋白质中，氨基酸以长链连接在一起，折叠起来形成独特的三维结构，这对蛋白质的功能至关重要。要了解生命如何运作，首先就需要了解蛋白质的形状和结构。自19世纪以来，化学家就已了解蛋白质对生命过程的重要性。但直到20世纪50年代，随着研究工具精度的提高，研究人员才开始借助仪...

AI蛋白质折叠:在生命宇宙中漫游,远眺生物经济的流光

人类现在已知组成蛋白质的氨基酸有20余种,如果它们可以以任意顺序和长度链接、并折叠形成不同的蛋白质,那么理论上可能存在的蛋白质数量会达到约10^1300,比整个宇宙中的原子数量还要多很多倍,功能更是因此丰富而复杂。换言之,理想的情况下,如果我们可以测清氨基酸在组成蛋白质时折叠构成的三维结构,就可以了解清楚蛋白...

了解一下身体蛋白质的基本构件:氨基酸

含有全部九种必需氨基酸的食物被称为完全蛋白质。这些食物包括牛肉、家禽、鱼、鸡蛋、乳制品、大豆、藜麦和荞麦。含有部分但不是全部必需氨基酸的食物被称为不完全蛋白质。这些食物包括坚果、种子、豆类和一些谷物。比如我们民族先人淮南王刘安的伟大发明--豆腐,其蛋白质含量非常丰富,但缺少一种人体必需的氨基酸———...

不只是 AlphaFold!一文读懂蛋白质折叠的前世今生:从“不可能”到...

Anfinsen假设,应该有一种方法可以根据氨基酸序列预测蛋白质的形状。这就是后来广为人知的蛋白质折叠问题。一旦多肽链组装完成,蛋白质就可以在千分之一秒内折叠成自己的结构——这让分子生物学家CyrusLevinthal感到困惑。在他于1969年发表的论文HowtoFoldGraciously中,他计算出,如果一个蛋白质要尝试每...

模拟5亿年自然进化史,全新蛋白质大模型ESM3诞生!前Meta老将力作Le...

在另一组96个候选样本中,发现了几种亮度与天然GFP相似的蛋白质,其中一种亮度最高的蛋白质被命名为esmGFP,与最接近的天然荧光蛋白相比有96个突变(在229个氨基酸组成的序列中,有58%的相似部分)(www.e993.com)2024年11月12日。左侧是与所有已知GFP都相差较大的生成物B8,从B8开始,ESM3生成了右图的esmGFP...

不只是 AlphaFold!一文读懂蛋白质折叠的前世今生_腾讯新闻

Anfinsen假设,应该有一种方法可以根据氨基酸序列预测蛋白质的形状。这就是后来广为人知的蛋白质折叠问题。一旦多肽链组装完成,蛋白质就可以在千分之一秒内折叠成自己的结构——这让分子生物学家CyrusLevinthal感到困惑。在他于1969年发表的论文HowtoFoldGraciously中,他计算出,如果一个蛋白质要尝试每一种...

Nature: 一种基于宏基因组序列空间生成无参考的蛋白质家族的计算...

我们分析了26,931个宏基因组,识别出11.7亿个长度超过35个氨基酸的蛋白质序列,这些序列与102,491个参考基因组或Pfam数据库中的任何序列都不相似。利用基于大规模并行图的聚类方法,我们将这些蛋白质归入了106,198个超过100个成员的新序列群,比利用相同方法从参考基因组聚类得到的蛋白质家族数量翻...

小分子肽-最为优越的营养物质|细胞|活性|多肽|氨基酸|蛋白质_网易...

氨基酸是组成蛋白质的基本单位,如果说,时间最小的单位是“秒”,那么氨基酸就是这个“秒”,蛋白质就是“小时”。肽是介于氨基酸与蛋白质之间的一种生化物质,是由两个或两个以上的氨基酸以肽键相连的方式组成的化合物。它比蛋白质的分子量小,又比氨基酸的分子量大,是一个蛋白质的片段,也就是我们上述举例所说的...

...Baker,西湖大学卢培龙团队精确从头设计镜像结合蛋白

在这项最新研究中,研究团队从头设计了由50-65个氨基酸残基组成的D型蛋白质,旨在靶向L型蛋白质或L型多肽的特定表面区域。从头设计靶向L型蛋白质的D型蛋白质该研究设计的D型蛋白质结合物对人工L型多肽以及两种具有治疗意义的天然蛋白质(人TrkA蛋白的D5结构域、人IL-6蛋白)表现出纳摩尔级(nmol)亲和力。值得注意...