AI面临的五个蛋白质设计问题,Nature找了一群专家来讨论

直到几年前,研究人员还通过将蛋白质克隆到细菌或酵母中,诱导微生物变异,直到产生所需的产物来改变蛋白质。科学家也可以通过故意改变其氨基酸序列来手动设计蛋白质,但这是一个费力的过程,可能会导致蛋白质折叠错误或阻止细胞产生蛋白质。机器学习算法彻底改变了游戏规则。研究人员可以使用人工智能(AI)驱动的工具(例如...

科学家开发非天然氨基酸eFSY,能在活细胞中鉴定直接的蛋白质相互作用

所以,杨兵希望能在多氨基酸反应性的交联非天然氨基酸FSY的基础上,开发可富集的非天然氨基酸eFSY。通过开发eFSY他希望:能在活细胞中以原位方式捕获蛋白质之间较弱的、瞬时相互作用;能区分直接蛋白质与间接蛋白质相互作用;能鉴定蛋白质相互作用的界面;能提高蛋白质相互作用鉴定的灵敏度;能鉴定出在其它技...

他开创了AI蛋白质结构领域,现在要做比诺奖更大的事

蛋白质分子的直径经常也就几纳米或者几十纳米,胰岛素只有51个氨基酸;助消化的胰蛋白酶有281个氨基酸;运氧气的血红蛋白有574个氨基酸;再大一点的有免疫系统用来对抗细菌病毒的抗体蛋白(1316个氨基酸),以及线粒体里提供能量的ATP合成酶(1125个氨基酸)。蛋白质是由氨基酸构成的。想象一下,你有20种不同形状和颜色的柔...

技术变革还是炒作噱头?AI for Bio到底能做什么|AI驱动科学

从制药的角度来看,我们关心这个问题,因为大多数药物通过与蛋白质(有时是DNA/RNA等核酸)发生化学相互作用而起效,并且相互作用取决于所讨论的生物大分子的结构。此外,一些药物本身就是生物大分子(蛋白质、肽、核酸序列等),了解它们的结构对于预测它们在体内的作用非常重要。从基础研究的角度来看,结构生物学有助于我们...

吃什么增加抵抗力好和免疫力?优选可增强免疫力的蛋白粉

抵抗力低吃什么能提高抵抗力?优质蛋白有助于免疫力那么,补充蛋白质提高免疫力吃什么呢?相信大多数人都听过优质蛋白的说法。蛋白质的基本单位是氨基酸,自然界中常见的氨基酸有20种,大部分氨基酸可以在人体内合成,但赖氨酸、色氨酸、苏氨酸等九种氨基酸是人体无法合成,只能从食物中获取的,这九种氨基酸就叫做必需氨...

甘氨酸合成新路径!有关生命起源猜想

在日常生产生活中,甘氨酸的用处也很大(www.e993.com)2024年11月16日。作为构成蛋白质的基本结构单元之一,甘氨酸在体内参与多种代谢过程,对于维持细胞功能和组织修复至关重要,在食品、医药等多个领域得到了广泛的应用。关于甘氨酸的制备,目前有多种方法,常见的有化学合成法和生物转化法。

地球生命源于外太空?到底是先有DNA,还是先有蛋白质?

根据上文我们知道,米勒实验证实了早在几十亿年前地球就可以通过雷电等作用将各种无机物合成氨基酸。那么,现在面临下一个问题。照理说,生命能够延续,核心实际上是遗传物质的自我复制。而大多数生物利用的是DNA作为遗传物质,并且DNA需要通过指导RNA合成蛋白来实现生命必须的活动。

氨基酸深度研究:助益粮食安全,借力合成生物

氨基酸是分子内含有氨基和羧基的一类有机化合物,是构建生物体蛋白质的基础物质,氨基酸/蛋白质几乎参与生物体内的每个化学反应,被机体用于制造抗体蛋白、血红蛋白、酶和激素等,以维持和调节新陈代谢。按照人体是否可自主合成,氨基酸分为必需氨基酸和非必需氨基酸两类,其中必需氨基酸主要包括赖氨酸、苏氨酸、蛋氨酸、缬氨酸、...

了解一下身体蛋白质的基本构件:氨基酸

蛋氨酸:蛋氨酸有助于身体的组织生长、新陈代谢和解毒。蛋氨酸还有助于吸收必需矿物质,包括锌和硒。苯丙氨酸:苯丙氨酸是产生大脑化学信使所必需的,包括多巴胺、肾上腺素和去甲肾上腺素。它对于其他氨基酸的生产也很重要。苏氨酸:苏氨酸在胶原蛋白和弹性蛋白中起着重要作用。这些蛋白质为您的皮肤和结缔组织提供结构。

为什么说想了解AI+合成生物学,必须先搞懂蛋白质?

RoseTTAFold是一个“三轨”神经网络,这意味着它同时考虑一维蛋白质中的氨基酸序列、二维蛋白质的氨基酸如何相互作用以及蛋白质可能的三维结构。不仅能如AlphaFold2般计算数百种新的蛋白质结构,还能生成与人类健康直接相关的蛋白质结构,包括与非正常脂质代谢、炎症障碍和癌细胞生长相关的蛋白质结构。