【前沿进展】Nature丨朱冰课题组发现旁着丝粒异染色质的建立机制
以组蛋白H3K9甲基化修饰为标记的旁着丝粒异染色质(pericentricheterochromatin)是染色质的重要组成部分,其在确保正确的有丝分裂、调控恰当的基因表达以及维持基因组稳定性等方面起着重要作用1-3。异染色质这一名词于1928年由德国科学家EmilHeitz提出,被用来描述细胞中被染料浓密着色的染色质区域4,这类异染色...
【CSCB2024】分会场回顾之发育与疾病中的染色质结构和表观遗传调控
染色质的组装程度是决定细胞核硬度的另一个重要因素,折叠程度高的异染色质会增加细胞核的硬度,反之降低细胞核的硬度。因此,当细胞受到持续的机械拉伸时,异染色质会首先响应力学刺激,通过移除组蛋白H3K9me3修饰,使细胞核变软应对机械拉力,发生amoeboid迁移,促进成纤维细胞重编程,调控细胞命运,但它们也可能是细胞损伤的...
清华团队揭示L1反转录转座子的转录活性调控染色质拓扑结构域边界...
4月10日,清华大学生命科学学院、清华-北大生命科学联合中心刘念团队在《分子细胞》(MolecularCell)在线发表了题为“SAFB抑制能表达L1融合转录本的染色质拓扑结构域边界的形成”(SAFBrestrictscontactdomainboundariesassociatedwithL1chimerictranscription)的研究论文,研究发现转录活跃的L1能够富集RNA聚合酶II(P...
...大学现代农业研究院邓兴旺团队和何航团队发现光调控植物染色质...
近日,北京大学现代农业研究院邓兴旺院士和何航团队在PlantBiotechnologyJournal发表了题为Lightcontrolofthree-dimensionalchromatinorganizationinsoybean的论文,首次揭示了光对染色质高级结构的调控作用。染色质的高级结构对基因组稳定性、转录程序及表观修饰活性等多个生物学过程具有调控作用,但其对植物生长发育...
【会议通知】2024年度染色质生物学与表观遗传学大会第一轮会议通知
2024年度染色质生物学与表观遗传学大会第一轮会议通知12月13日-16日,广东·广州由中国细胞生物学学会染色质生物学分会和中国遗传学会表观遗传专业委员会联合主办,广州国家实验室、生物岛实验室、中山大学联合承办的“2024年度染色质生物学与表观遗传学大会”于2024年12月13日-16日在广东省广州市召开。
李程/孙育杰/黄粤课题组合作揭示异倍体对染色质空间结构和转录组...
基于这些异倍体小鼠ESC细胞株,新研究结合测序技术和成像技术,从三维基因组的角度探索了异倍体对空间染色质组织和基因表达的影响,有助于增加对于异倍体相关疾病的理解和提示干预方案(www.e993.com)2024年10月19日。研究者首先以先前建立的同遗传背景的小鼠野生型二倍体ESC(WT)和多株三体ESC(Ts6、Ts8、Ts11、Ts15)为模型,进行了Hi-C实验及...
南开大学陈盛泉团队:RAINBOW技术革新单细胞染色质数据注释|QB
近日,南开大学数学科学学院陈盛泉课题组开发了一个细胞类型注释方法RAINBOW,通过利用对比学习策略并引入参考集信息,来实现对单细胞染色质可及性数据的细胞类型注释,并在一系列任务中取得优越性能。相关研究成果“Accuratecelltypeannotationforsingle-cellchromatinaccessibilitydataviacontrastivelearningandref...
高精准+低成本,「人科生物」开发基于染色质开放区间技术的肿瘤早...
此外,人科生物基于染色质开放区间技术开发的泛癌筛查产品惠适安??已于2023年启动商业化,灵敏度和特异性指标分别为87%和98%,阳性预测值和溯源准确率达95%和92%,覆盖胃癌、肠癌等8大癌种,均高过同类型产品,且在价格上也具备优势。商业化问题上,针对筛查和临床两类不同的产品应用场景,人科生物采取两种不同...
PRC2和其他广泛报道的染色质蛋白在体内似乎不直接与RNA结合
接下来,作者探讨了某些特定的染色质蛋白在体内是否能直接与RNA结合。研究表明,尽管之前被广泛报告的某些染色质蛋白如PRC2在体内并不直接与RNA结合,但他们确实鉴定到了几种特定的染色质蛋白能够直接与RNA结合,包括SPEN、EWSR1、CHTOP、PSPC1和TET2。总之,作者开发了一种实验方法来明确识别细胞内不可能发生的非特异...
陈玲玲/于洪涛团队综述核内小体与染色质相互作用
2023年11月21日,中国科学院分子细胞科学卓越创新中心陈玲玲研究组与西湖大学于洪涛研究组合作,在TrendsinCellBiology期刊发表了题为:Emergingrolesofnuclearbodiesingenomespatialorganization的综述论文。该综述回顾了不同类型核内小体的研究历史,重点关注核仁、核斑和PML核体这三种小体与染色质空间结构之...