PNAS:颜宁团队以《荷塘月色》为灵感,报道结构生物学研究新范式

CryoSeek的工作流程包括几个步骤:1)从自然来源收集样本;2)用过滤、浓缩等简单程序处理样品;3a)执行标准冷冻样品制备和冷冻电镜数据采集或3b)通过其他方法,如宏基因组测序和质谱分析来表征样品;4)低温电镜数据处理;5)自动建立模型;6)结合步骤3b的其他生物信息学分析结果,根据其结构识别相应的生物实体。为了证明...

考研生物物理学专业简介

通过运用物理学的原理和技术手段,生物物理学研究人员可以揭示生物体内各种生物过程的物理机制,如蛋白质的折叠和功能、细胞的运动和分裂、神经信号的传递等。生物物理学的研究方法多样,包括光谱学、显微镜技术、核磁共振、电生理学等。这些方法可以帮助研究人员观察和测量生物体内的物理现象,从而揭示生物体内各种生物过程的...

ML如何推动结构生物学的发展?哈佛科学家用AI在最小尺度上研究人类...

Farnung:我们的一般方法是从细胞中分离出分子机器,然后使用特定类型的显微镜或X射线束对其进行观察。为此,我们将编码感兴趣的人类分子机器的遗传物质引入昆虫或细菌细胞中,这样细胞就会大量制造这种机器。然后,我们使用纯化技术将机器从细胞中分离出来,以便我们能够单独研究它。然而,这很复杂,因为我们通常不只是对...

JPA中科院1区:天然产物虚拟筛选-相互作用-表型的靶标鉴定策略—以...

这些发现表明,SME可以通过调节神经递质受体表达和影响线粒体生物能量学来积极影响神经元存活和功能,这与TEM分析结果一致。电子显微镜图像显示,在SME治疗后,线粒体损伤得到了部分修复,与OGD/R组相比,所得的形态更接近正常细胞外观,表明潜在的治疗效果(图5)。图5使用PISA方法鉴定SME的直接互作靶蛋白6、通过多...

深圳大学孟思副研究员/孔湉湉教授AFM:多材料数字光处理 (DLP...

1、使用多材料DLP打印并将AAm和PEGDA分别作为水凝胶的软硬结构组分混合来制备水凝胶前体。为了打印水凝胶构建体,使用了一台基于DLP技术的打印机(nanoArchS140,重庆摩方精密科技有限公司),其LED光源波长为405纳米,最大光强约为100毫瓦/平方厘米,用于固化水凝胶前体(见图1)。为了制备DLP打印机的生物墨水,研究者通...

深研细胞力学 创新生物科技——记常州大学生物医学工程与健康科学...

其实,早在海外时,欧阳明星已经在长程生物力作用的研究中取得了具有一定突破性的科研成果,研究团队发现了细胞之间存在远距离的力学交流(www.e993.com)2024年11月22日。基于此前的研究基础,长距离力学通讯作用对体内器官形态的构建可能具有关键的引导作用。2018年,欧阳明星负责主持国家自然科学基金面上项目“细胞长程力在上皮管状结构自组装中的作用...

...系首个在生物分子结构预测方面超越基于物理工具方法的AI系统

AlphaFold3的表现表明，开发正确的深度学习框架可以大量减少在这些任务中获得生物学相关性能所需的数据量，并扩大已经收集的数据的影响。DeepMind预计结构建模将继续改进，这不仅是因为深度学习的进步，而且还因为实验结构确定方法的持续进步，例如低温电子显微镜和断层扫描的巨大改进，将提供丰富的新训练数据，以进一步提高...

【科学家掠影】江山代有才人出:中国新生代结构生物学家 |...

去年十一月,CellPress细胞出版社携手中国生物物理学会,在安徽黄山举办了“CellSymposia:结构生物学-从纳米层面到细胞水平”国际研讨会,几位优秀的中国青年结构生物学家在会上发表了学术演讲。本期Structure期刊Voices栏目邀请这些青年俊杰,回顾他们自身的科研道路并与我们分享那些激动人心的研究课题。

Cell | 结构之美:探索结构生物学的真相与幻象

在当今迅速发展的医药领域中,结构生物学以其独特的视角和方法,为药物发现的过程提供了重要的支持。通过深入分析蛋白质和其他生物大分子的三维结构,研究人员能够揭示出分子间复杂的相互作用机制,从而为设计新药提供了坚实的基础。然而,尽管结构生物学的贡献不可小觑,我们也必须认识到它的局限性,并探索如何超越这些限制。

知耕PI专辑|AlphaFold 3 预测了所有生命分子的结构和相互作用

生物复合物的准确模型对我们理解细胞功能以及合理设计治疗药物至关重要。随着AlphaFold的发展,蛋白质结构预测取得了巨大进展,该领域也随之迅速发展,并有多种后续方法建立在AlphaFold的思想和技术基础之上。几乎在AlphaFold推出后不久,就显示出简单的输入修改能够实现出人意料的准确蛋白质相互作用预测,并且专门针对蛋白...