...颁给AI?万字专题详解:计算和人工智能颠覆我们对蛋白质的理解方式
1965年,蛋白质晶体学领域的先驱之一——戴维·菲利普斯(DavidPhillips)首先确定了溶菌酶的结构——这是我们的免疫系统用来攻击细菌的一种蛋白质。使用X射线晶体学方法,牛津大学的生物物理学家绘制出了蛋白质电子密度图谱,图中电子集中的区域可能包含一个原子。桑顿和同事将电子密度图谱打印到塑料薄片上,一张又一张...
2024化学诺奖接力青睐AI,蛋白质结构预测新工具获一半奖项
TBM又称同源建模,它利用新蛋白质初级结构与PDB中已有三维结构蛋白质的氨基酸序列比对结果为基础构建模型,并进一步完善,准确性取决于新蛋白质和PDB中蛋白质的进化距离,如果PDB缺乏新蛋白类似结构域的已知结构,则无法生成准确模型。FM又称从头计算方法,利用能量函数计算氨基酸空间相互作用,最终从所有可能结构中...
Phytomedicine | CETSA和TPP策略用于天然产物的靶点鉴定和药物...
与药物结合的蛋白相对稳定,而未结合的蛋白迅速变性沉淀;(4)细胞裂解(可选步骤):完整的细胞和组织需要裂解;(5)通过高速离心或过滤从可溶性蛋白部分中去除细胞碎片和聚集体;和(6)使用定量技术,如蛋白质印迹(WB)和基于ms的蛋白质组学检测剩余的热稳定或不稳定的蛋白...
Nature重磅综述 |关于RNA-seq,你想知道的都在这
我们会举例说明RNA-seq在RNA生物学关键研究中的应用,包括转录和翻译的动力学分析,RNA结构,RNA-RNA和RNA-蛋白质间相互作用等。最后我们小小地展望一下RNA-seq的未来,如单细胞和空间转录组是否也会是以后的常规分析,在什么情况下longreads会替代shortreadsRNA-seq。不过篇幅有限,本文对RNA-seq分析还是有照顾不到...
...医生还是损害医生的诊断?华人学者顶刊论文表明,这取决于医生自身
:深度学习模型可以预测蛋白质和蛋白质之间的相互作用,从而帮助设计新的蛋白质复合物和抗体。蛋白质功能注释和预测:深度学习可以进行蛋白质功能注释和预测,识别蛋白质的功能域、结构域和功能位点等。这有助于预测蛋白质的功能和相应的生物学作用。蛋白质优化和筛选:深度学习可以用于优化和筛选设计出的蛋白质。通过...
...阿尔茨海默病竟有5种亚型,难怪患者对治疗的反应差异那么大!
04由于此,研究者们认为基于脑脊液确定患者AD亚型或有助于选择个体进行特定的治疗(www.e993.com)2024年10月17日。05同时,某些治疗产生的副作用也可能取决于亚型。以上内容由腾讯混元大模型生成,仅供参考*仅供医学专业人士阅读参考阿尔茨海默病(AD)的病理特征包括大脑中的β-淀粉样蛋白沉积和tau蛋白纤维缠结,即当前药物研发的两个重点方向。就在...
关于内参蛋白Actin,那些你不知道的事儿
肌动蛋白的聚合取决于肌动蛋白单体对细丝末端的亲和力,肌动蛋白单体存在一个临界浓度(CC),当低于该浓度,肌动蛋白不会聚合;当单体浓度高于CC时,肌动蛋白将发生聚合,直到游离单体浓度等于CC。然而,当我们在体外研究肌动蛋白时,它的程度则取决于所使用的条件。举个例子,在4°C条件下,肌动蛋白在2mMM...
蛋白营养的力量!剖析蛋白原料,探究对运动的影响
研究表明,对于大多数运动人群来说,每日摄入1.4-2.0g/kg/d的蛋白质已足够。而对于运动员而言,摄入量取决于年龄和最近的阻力运动情况,一般建议为0.25g/kg的优质蛋白质,或者绝对剂量为20-40克。因此,选择营养价值较高的蛋白质对于运动员来说至关重要。上述蛋白质质量评价方法能够有效地帮助运动员做出更明智的选择。
茶的碳水化合物高吗?女性是否适合饮用?
需要注意的是,普洱茶的碳水化合物含量并不是绝对的数值,可能会受到很多因素的影响,包括树种、产地、采摘时间等。不同、不同批次的普洱茶碳水化合物含量也会有所差异。总结起来,普洱茶的碳水化合物含量主要取决于茶叶的仅占类型和加工工艺。干茶中的碳水化合物含量较低,而陈年普洱茶中的碳水化合物含量较高。虽然普...
益生菌不一定全是“益”,也存在一定的安全风险
不同菌株可以产生非常特定的效果。益生菌特异性取决于剂量、菌种、持续时间、给药途径和适应症等影响因素,还可能因施用对象健康或疾病状况、不同年龄、肠道微生物组成而异