从结构准确预测蛋白质功能,东北大学「CNN+GCN」统一框架

这表明结合了GCN和CNN的TAWFN可以更全面地学习蛋白质结构内的特征。此外,AGCN中的多头注意力机制(MHA)通过图池化有效地学习蛋白质图特征,而MCNN中的MCAM则捕获蛋白质序列的全局特征。这些因素有助于TAWFN在蛋白质功能预测中的有效性。消融研究针对MCNN和AGCN,研究人员设计了消融实验来验证二者...

因为一个“很难,很重要的问题”,我从计算机转向研究蛋白质

所以,我们需要另外想出方法去获得定蛋白质的三维构型,这也是为什么我们想做蛋白质结构预测——我们想通过计算技术去把蛋白质的三维结构给算出来,而不是用实验仪器测出来。计算机预测蛋白质结构这个问题本身的定义很简单:假设我们有了一个蛋白质的氨基酸序列,能不能把它输入到计算机里面去,让计算机输出每个原子的三维坐...

2024年诺贝尔化学奖官方解读:他们通过计算和AI揭示“蛋白质奥秘”

与其在Rosetta中输入氨基酸序列并输出蛋白质结构,他们应该能够输入所需的蛋白质结构并获得其氨基酸序列的建议,这将使他们能够创建全新的蛋白质。Baker成为蛋白质构造者蛋白质设计领域——研究人员创建具有新功能的定制蛋白质——始于20世纪90年代末。在许多情况下,研究人员调整了现有的蛋白质,以便它们能够分...

AI蛋白质折叠:在生命宇宙中漫游,远眺生物经济的流光

2016年夏天,许锦波教授开发出的算法RaptorX-Contact,证明了深度残差卷积神经网络可以大幅度提高蛋白质结构预测的性能,并在当年的全球蛋白质结构预测比赛(CASP12)中,在蛋白质接触矩阵的预测上得分居首位,引发学界关注。在此之前,CASP的平均得分一直在30分左右徘徊,而许锦波教授的算法一举将纪录提升到了60分,实现了真正...

tdTomato荧光蛋白质结构和特点,荧光峰值波长,荧光蛋白的定制

结构:tdTomato是由233个氨基酸组成的蛋白质,具有β-桶结构,内部包含荧光色团。与其他红色荧光蛋白相比,tdTomato在温度和酸碱条件下都相对稳定。荧光特性:tdTomato的荧光峰值波长约为581纳米,适合用于红色荧光成像和实验。tdTomato常被用作细胞标记的荧光标记物,在活细胞成像和追踪实验中发挥作用。

关于举办“蛋白质结构解析与智能设计专题 (线上)培训班”的通知

关于举办“蛋白质结构解析与智能设计专题(线上)培训班”的通知各有关单位:蛋白质通常被称为生命的基石,它们几乎参与了细胞内的每一个过程,包括生长、分裂和修复(www.e993.com)2024年11月8日。蛋白质是生命活动的体现者,其结构决定着功能。由线性氨基酸组成的蛋白质需要折叠成特定的空间结构才具有相应的生理活性和生物学功能。解析蛋白质的空间...

...丨2024年诺贝尔化学奖官方解读:他们通过计算和AI揭示“蛋白质...

图1.蛋白质可以由几十个到几千个氨基酸组成。一串串氨基酸折叠成三维结构,对蛋白质的功能起着决定性作用。(来源:ohanJarnestad)随后,研究人员主要使用X射线晶体学(通常需要付出大量努力)成功制作了约20万种不同蛋白质的图像,这为2024年诺贝尔化学奖奠定了基础。

蛋白质结构的丧失导致功能的丧失

如果温度缓慢升高,蛋白质的构象通常会保持完整,直到在狭窄的温度范围内发生结构(和功能)突然丧失(图4-24)。这种突然的变化表明,展开是一个协同过程:蛋白质一部分结构的丧失会破坏其他部分的稳定性。热量对蛋白质的影响可以通过结构来减轻。热稳定蛋白已经进化到可以在温泉的温度下(~100°C)发挥作用。这些蛋白质的...

又一突破性成果!人工智能大模型预测蛋白质结构速度再次提高数百倍!

传统实验室观测蛋白质结构的方法主要有三种,即核磁共振、X射线晶体学、冷冻电镜,但这些方法往往依赖昂贵的设备,还要反复试错,搞清楚每种蛋白质的三维结构都需要花费数年时间。人体内约有10万种以上的蛋白质,被科学家解析过三维结构的少之又少,为了对大量未知的蛋白质展开研究,必须发明全新的方法,比如,在搞清蛋白质...

普洱茶菌丝图片大全,探索神秘的普洱茶世界:菌丝图片大全解析

菌丝是指由微生物(如真菌)所形成的属于细长丝状结构。在普洱茶的绿色发酵过程中,茶叶内部的品质微生物会通过分解茶叶内的香味有机物质,并释放出酶,进而进行发酵。在这个过程中,微生物通过吸收茶叶内的品种营养物质并繁殖,形成了菌丝。由于菌丝具有张力,因此形成了紧密排列且纵横交错的茶饼菌丝图片。