从结构准确预测蛋白质功能,东北大学「CNN+GCN」统一框架

当前预测蛋白质功能的方法主要集中在三个领域:蛋白质序列、蛋白质结构和蛋白质-蛋白质相互作用网络。当前针对蛋白质结构的方法很少,通常单独使用卷积神经网络(CNN)或图卷积网络(GCN)。单独使用CNN或GCN存在以下问题:使用CNN时可能会发生信息丢失,因为它们的局部接受场可能无法捕捉蛋白质的整体结构。如果关键...

中国农业科学院植物蛋白结构与功能调控创新团队探明了不同来源...

核心提示:近日,中国农业科学院农产品加工研究所植物蛋白结构与功能调控创新团队通过比较不同来源蛋白的组成、结构、理化性质和发泡特性,揭示了蛋白气-水界面及泡沫功能特性与其理化、结构性质的关联机制。近日,中国农业科学院农产品加工研究所植物蛋白结构与功能调控创新团队通过比较不同来源蛋白的组成、结构、理化性质和发...

...AI:颁给DeepMind哈萨比斯和大卫·贝克等三位,表彰蛋白质结构...

他的研究重点是蛋白质结构的预测和设计、蛋白质折叠机制、蛋白质-蛋白质相互作用、蛋白质-核苷酸相互作用以及蛋白质-配体相互作用。他通过实验来理解这些问题背后的基本原理,并基于这些见解开发简单的计算模型,还通过结构预测和设计来测试模型。近年来,Baker团队开发了可用于蛋白质结构预测的RoseTTAFold,该算法已扩展到...

中国科大在人类癌症细胞的多药耐药蛋白的结构和功能研究领域取得...

结构分析表明,apo-formABCC3结构呈现向细胞质基质开口(inward-facing)的构象:两个核苷酸结合结构域(NBD)彼此分开,两个跨膜结构域(TMD)形成一个朝向细胞质基质开放的“V形”底物转运通道。与经典的ABC转运蛋白不同,其N端有一个额外的五股跨膜螺旋组成的TMD0结构域。TMD0的五股跨膜螺旋聚拢在一起,形...

超越蛋白质结构,全面预测蛋白质与所有生命分子相互作用

AlphaFold3的强大功能源于其新一代的架构和训练,涵盖了生命中所有分子。AlphaFold3的核心是一个改进版的Evoformer模块(一种蛋白质语言模型),在处理输入后,AlphaFold3使用扩散(diffusion)网络进行预测(类似于AI绘图或ChatGPT生成文字),扩散过程从一团原子云开始,经过许多步骤后,最终生成最准确的分子结构。其对分子相互...

体育教师资格笔试-运动解刨学《人体组成的结构基础》

一、细胞和细胞间质细胞是组成人体结构和功能的基本单位(www.e993.com)2024年11月8日。(一)细胞的形态细胞的形态多种多样,有扁平形、立方形、柱形、梭形、球形和星形等。例如:红细胞为圆盘形,以便于在血液中运输氧气;肌细胞为圆柱形和长梭形,以利于长度变化,完成收缩功能;神经细胞常有许多长短...

蛋白质的热量以及营养功效

2.结构物质。人的身体由百兆亿个细胞组成,细胞可以说是生命的最小单位,它们处于永不停息的衰老、死亡、新生的新陈代谢过程中。例如年轻人的表皮28天更新一次,而胃黏膜两三天就要全部更新。所以一个人如果蛋白质的摄入、吸收、利用都很好,那么皮肤就是光泽而又有弹性的。反之,人则经常处于亚健康状态。组织受损后...

2024年诺贝尔化学奖揭晓!揭开蛋白质折叠的秘密

插图:一个蛋白质可以由几十个氨基酸到几千个氨基酸组成。氨基酸链折叠成一个三维结构,这个结构对于蛋白质的功能是决定性的。三位科学家的具体贡献时间标尺继续下划,就到了2024年诺贝尔化学奖的区间。下文就重点讲解此次获奖的三位科学家各自的贡献:戴维·贝克(DavidBaker)在“计算蛋白质设计”方面到底作出了哪些...

中国科大首次解析人类溶酶体维生素B12外排蛋白ABCD4的电镜结构

作者经过大量的摸索,成功表达并纯化得到了状态良好的人类ABCD4蛋白,利用单颗粒冷冻电镜技术解析了该蛋白与ATP(三磷酸腺苷)结合状态的高分辨率三维结构,分辨率达到3.6埃(0.36纳米)。该蛋白由606个氨基酸残基组成,以同源二聚体的形式在人体内行使功能。本次解析的结构为生理状态下ABCD4二聚体复合物的结构,包含两个六次...

关注2024诺奖|借助计算机模拟“上帝之手”,蛋白质设计不负众望...

我们现在可以预测蛋白质结构并设计自己的蛋白质，这给人类带来了极大的益处。郑鹏教授科普道，蛋白质是生命执行各类生理功能最重要生物大分子,例如维持身体结构、促进代谢、支持免疫系统等方面发挥着至关重要的作用。“比如用于消化的酶、抵御病毒的抗体、人体的肌肉都是由蛋白组成的。”郑鹏表示，蛋白质设计与人类可以说...