...广州医学检验所双双通过NCCL遗传病高通量测序生信分析室间质评

9月28日,国家卫生健康委临床检验中心(NCCL)公布了2024年遗传病高通量测序检测生物信息学分析室间质评活动的统计结果,诺禾致源天津医学检验所与广州医学检验实验室双双顺利通过测评。此次测评质评样本为人基因组DNA,针对全外显子测序(WES)或临床外显子测序数据(FASTQ文件)的生物信息学分析,评价项目包括与遗传病表型...

iMeta | 北大深圳医院桂耀庭组揭示弱精子症患者精浆微生态的动态...

此外,PCoA分析结果(图1B)发现不同群体之间存在显著的差异,正常组人群和AZS-I组人群精浆的微生物群落组成具有更大的相似性,而AZS-II组人群和AZS-III组人群精浆微生物群落组成的相似性更大,上述结果为后续分析研究提供了重要的参考依据。随后,我们根据物种注释结果,选择每个分类水平(门、纲、目、科、属)的前30...

专访南医大生信系主任余光创:没有哪个专业绝对优越,生信人做好...

许多人通过宏基因组或16SrRNA测序来鉴定肠道微生物,但往往缺乏相应的代谢物组学数据。我们开发的这个工具可以填补这一空白,做出更全面的分析。此外,我们还开发了SVP软件包,专门用于单细胞和空间转录组学研究,可以在单细胞水平对细胞功能进行刻画,基于此,我们可以鉴定具有空间特异性的生物学功能。目前,我们的工作主要...

Nature重磅综述 |关于RNA-seq,你想知道的都在这

ONTcDNA测序也可以测序全长转录本,而且适用于单细胞测序。同样使用模板置换逆转录来制备全长cDNA,在加接头制备测序文库之前,可以自己决定是否进行PCR扩增。DirectcDNA测序可消除PCR偏差,获得的测序结果质量更高;PCR扩增的cDNA文库的测序产出(测序获得的reads数)更高,适用于样本中RNA含量较少的情况。而目前还未在ONT...

2区-贵州中医药: 基于蛋白质组学和生信探究土茯苓治疗高血压的...

3.肝脏和肾脏的组织病理学分析3.1肝脏组织病理学分析在20倍、40倍和100倍物镜下,肝脏组织病理学染色显示,空白对照组肝细胞结构完整,形态规则,细胞间隙正常,大部分细胞核染色较深,核仁清晰,无变性坏死(图3A)。相反,模型组的肝细胞染色明显较轻,结构紊乱,核固缩(图3B)。与模型组(L-NAME)相比,阳性药物(卡托普...

算力+存力:优化基因测序的关键所在

1-3步为一级分析过程,该过程主要由二代基因测序仪完成(www.e993.com)2024年11月18日。完整的DNA测序样本在进行测序前会被用超声波击碎为上千万条(根据DNA链条长度不同,有时会高达上亿条)DNA片段。随后由基因测序仪将上千万条DNA片段中的序列内容解读出来,并将解读结果写入到FASTQ文件中。这些结果数据在FASTQ文件中是乱序写入的,要得到按照测序...

微生物组-扩增子16S分析和可视化(2024.10)

二、图表解读和绘制针对很多老师缺少系统的生信背景,看不懂分析文章图表,更对绘制各式图表手足无措。我们推出过如下两个系列,共16篇原创文章,对8种图形进行讲解和R语言绘图。但这些只是入门,在培训上,我们将结合发表高水平文章,进一步讲解16种常用分析图型结果的原理和使用范围,让您不仅读懂图,更知道如何应用于...

系统学习单细胞多组学、空间转录组和机器学习单细胞分析应用线上...

2,从生信零基础开始到单细胞基础和高阶课程,最后到空间转录组和单细胞机器学习应用逐步提高,3,系统学学习,一次学到位,包教包会,4,连续一个月紧凑学习,精细化讲解将单细胞内容全部学懂、学会、学透彻、学以致用,5,了解单细胞测序基本概念及原理、测序分析的常用软件、测序数据的下载方法和研究思路、学会用...

诺禾致源2023年年度董事会经营评述

⑤信息发掘与报告生成:测序完成后,公司生物信息分析工程师对测序仪给出的样本信息进行信息发掘,并出具解读报告并发送给客户。特别是第二代测序,因读长短、建库环节需要将完整的DNA打断成较小的片段,重组装对信息分析技术有较高的要求。而解读海量的基因组数据,甚至基因结合转录组、蛋白质、代谢等多组学数据,也对信息...

从测序到宏基因组:聚焦菌群生信分析方法最前沿

02月11日的《热心肠日报》,我们解读了11篇文献,关注:生信,宏基因组,测序,病毒组,MAG,抗菌肽,代谢产物,表型关联,差异丰度,批次效应。Nature子刊:基于三代测序的宏基因组分析助力完整微生物进化研究NatureMethods——[47.99]①基于PacificBiosciences或OxfordNanopore的三代测序技术已成为获得闭环微生物基因...