中国科大用深度学习实现高实验成功率的蛋白质序列从头设计

图2.左侧图为实验验证采用的一个目标主链结构(天蓝色)与相应ABACUS-R设计蛋白晶体结构(绿色)的叠合比较。在右侧展示的局部结构放大图中,ABACUS-R设计蛋白的残基间氢键等极性相互作用不同于天然结构。相较于ABACUS模型,ABACUS-R序列设计更高的成功率和结构精度进一步增强了数据驱动蛋白质从头设计方法的实用性。ABACUS...

...洪亮团队提出CPDiffusion模型,超低成本、全自动设计功能型蛋白质

设计了一种扩散概率模型框架CPDiffusion,该框架结合蛋白质骨架结构、活性位点等多种生成条件,能够以非常低的训练成本、数据成本,学习蛋白质的序列、结构与功能之间的隐含映射关系,进而生成多样化的蛋白质序列,这些生成的序列能够在湿实验验证中以极高的成功率通过测试。

天府锦城实验室在生物传感与蛋白质测序领域取得重要进展

蛋白质是生命活动的主要承担者，例如胰岛素和胰高血糖素控制血糖高低；视紫质能够感应光子，对于正常视觉功能必不可少。许多疾病的发生与蛋白质的异常直接相关，例如缺乏凝血因子会引起血友病；异常淀粉样蛋白斑可损害神经元，是阿尔茨海默病的潜在诱因。破译蛋白质信息是探索生命现象、促进人类健康的关键一环。该研究成果...

动物实验表明年轻时控制蛋白质摄入延寿效果更好

此前动物研究显示，控制饮食有延长寿命的效果，流行病学研究表明这种方法对人类同样有效。目前有各种版本的通过控制饮食促进健康的方法，其中之一是限制蛋白质的摄入。蛋白质由20种氨基酸组成，其中的蛋氨酸被证实对寿命的影响很大。日本理化学研究所和东京大学参与的国际研究小组在新一期英国《自然·通讯》杂志上报告说，...

恒温混匀仪(振荡型干式恒温金属浴混匀器)在蛋白质纯化实验作用

在蛋白质纯化实验中,恒温混匀器的作用更加显著。蛋白质的纯化是生物化学实验中的重要环节,而恒温混匀器能够提供稳定的温度环境,保证蛋白质的稳定性和活性。同时,通过振荡混合,恒温混匀器能够提高蛋白质的溶解度,促进蛋白质与配体的结合,从而提高蛋白质的纯化效率。

不只是AlphaFold!一文读懂蛋白质折叠的前世今生:从“不可能”到...

日前,QuantaMagazine科学作家YaseminSaplakoglu在一篇长文中详细介绍了蛋白质折叠问题的历史——从早期实验学家使用X射线晶体学解析蛋白质结构,到计算生物学家尝试通过算法预测结构,再到AlphaFold的出现及其带来的颠覆性影响(www.e993.com)2024年11月8日。同时,她也探讨了人工智能在蛋白质科学领域的突破性进展,特别是AlphaFold如何改变蛋...

干式恒温器是一种可用于蛋白质结晶实验的恒温仪

聚合酶链式反应(PCR)是一种常用的分子生物学实验技术,它的反应过程中需要**控制温度和时间。干式恒温金属浴能够提供稳定的温度环境,并且具有快速升温降温的功能,使得PCR反应能够更加准确和快速地进行。三、蛋白质结晶蛋白质结晶是一项非常关键的实验技术,它可以用于研究蛋白质的结构和功能。在蛋白质结晶实验中,干式恒...

鲜鸡蛋、初产蛋、可生食蛋……立夏蛋怎么选?实验数据告诉你

从统计学角度来看，实验数据没有显著差异，说明鸡蛋品类虽然五花八门，但其中的蛋白质含量却大同小异。因此，从提供蛋白质营养成分的角度分析，无论是初产蛋、土鸡蛋，还是乌鸡蛋，与平时更加多见且更为平价的普通鲜鸡蛋相比，并没有明显不同。实验二：哪种鸡蛋更卫生？菌落总数、大肠菌群和沙门氏菌是判定食品卫生...

年后第一个 CO-IP 实验,背景深得发慌,要恶补的功课都在这里了

我们还贴心地帮大家整理了蛋白质互作实验方法及优劣势分析,帮助大家根据自己的课题选择合适的研究方法。点击看图本次直播更有线上解答环节,你可以有和讲师一对一的答疑机会!更多干货内容欢迎点击下方海报报名直播～内容策划:王丹琦内容审核:朱超敏题图来源:丁香实验...

旋转式混匀器(混合仪)简介及在生物实验中的应用案例

三、蛋白质结晶实验中的应用蛋白质结晶是生物化学研究中的重要手段,有助于解析蛋白质的结构和功能。在蛋白质结晶实验中,旋转式混匀器也发挥着不可或缺的作用。在结晶条件的筛选和优化过程中,需要将蛋白质溶液与结晶剂混合,并通过旋转式混匀器使其充分混合均匀。这样可以提高结晶的成功率,并获得高质量的蛋白质晶体...