潘禺:在这迷人又壮美的科学领域,“中国玩家”能奋起直追吗?
蛋白质折叠领域还有一个教条,叫莱文塔尔(Levinthal)悖论,说的是一个给定的蛋白质可供选择的可能构象的数量是天文数字,即使是一个小蛋白质,也需要比宇宙存在的时间还要多的时间来探索所有可能的构象,可谓“一沙一世界,一花一天堂”。安芬森教条的例外,则是人类已知的许多疾病。比如朊病毒的构象,就与应有的原生折叠...
2024 诺贝尔化学奖:AI 助力生命科学
Anfinsen折叠实验和Levinthal悖论美国科学家ChristianAnfinsen做出了另一个早期发现。他通过各种化学手段,使现有蛋白质展开然后再次折叠。令人感兴趣的是,蛋白质每次都呈现出完全相同的形状。1961年,他得出结论:蛋白质的三维结构完全由其氨基酸序列决定。这一发现使他在1972年被授予诺贝尔化学奖。然而,Anfins...
2024年诺贝尔化学奖官方解读:他们通过计算和AI揭示 “蛋白质奥秘”
这使他获得了1972年诺贝尔化学奖。然而,Anfinsen的逻辑中存在一个悖论,另一位美国人CyrusLevinthal在1969年指出了这一点。他计算出,即使蛋白质只由100个氨基酸组成,理论上蛋白质也可以采取至少10^47种不同的三维结构。如果氨基酸链随机折叠,那么找到正确的蛋白质结构需要比宇宙的年龄还要长的时间。
专家解读化学诺奖:如果没有今年的化学奖,可能就没有物理学奖
这就是著名的蛋白质折叠问题和著名的利文索尔悖论(Levinthal'sparadox)。从上个世纪中叶到现在,无数的前辈一直在孜孜不倦地研究这个问题,包括我们研究院的荣誉院长、2013年诺贝尔化学奖得主迈克尔·莱维特(MichaelLevitt)教授等人。随着时间的历史推移,这个问题慢慢地就分化成了两个问题:一个是蛋白质为什么会这样,或...
又是AI?2024年诺贝尔化学奖被他们获得
然而,安芬森的逻辑包含一个悖论,美国另一位科学家赛勒斯·莱文萨尔(CyrusLevinthal)在1969年指出,即使一个蛋白质仅由100个氨基酸组成,理论上它可以假设至少10^47种不同的三维结构。如果氨基酸链是随机折叠的,它可能需要比宇宙的年龄还长的时间才能找到正确的蛋白质结构。但在细胞中,这个过程只需几毫秒。那么,氨基酸...
宇宙最强Alphafold3,“下海”了|蛋白质|氨基酸|大分子|化合物...
这种量级的可能性,人类要穷尽到宇宙尽头去了(www.e993.com)2024年10月19日。可与此同时,蛋白质自发的折叠行为几秒钟就完成了。二者之间巨大的反差被称为“利文索尔悖论”(Levinthal'sparadox)。人类还能预测蛋白质结构吗?此后很长一段时间内,蛋白质结构预测都被认为是“太阳底下最难的科学问题之一”。
生物学界最大的谜团之一被 AI 破解
但在自然界中,蛋白质会自发折叠,有些只需几毫秒,这被称为Levinthal悖论。蛋白质折叠问题解读视频请戳:CASP14比赛最新结果:AlphaFold中位GDT高达92.4CASP竞赛由JohnMoult和KrzysztofFidelis两位教授于1994年创立,每两年进行一次盲审,以促进蛋白质结构预测方面的新SOTA研究。一直以来...
重磅!AI解决生物学50年大挑战,破解蛋白质分子折叠问题
但在自然界中,蛋白质会自发折叠,有些只需几毫秒,这被称为Levinthal悖论。蛋白质折叠问题解读视频请戳:httpsv.qq/x/page/q3208094b83.htmlCASP14比赛最新结果:AlphaFold中位GDT高达92.4CASP竞赛由JohnMoult和KrzysztofFidelis两位教授于1994年创立,每两年进行一次盲审,以...
“它将改变一切”,AI解决生物学50年来重大挑战,破解蛋白质分子...
但在自然界中,蛋白质会自发折叠,有些只需几毫秒,这被称为Levinthal悖论。蛋白质折叠问题解读视频请戳:CASP14比赛最新结果:AlphaFold中位GDT高达92.4CASP竞赛由JohnMoult和KrzysztofFidelis两位教授于1994年创立,每两年进行一次盲审,以促进蛋白质结构预测方面的新SOTA研究。
四大顶级专家谈AlphaFold2:记录、风向与学术思考(上篇)
几十年前,大家就在探讨这个领域里被称作Levinthal的悖论。第一,一般蛋白的平均长度大概在300个氨基酸,假设每个氨基酸的可能构象有10个,所有的可能性就是10的300次方,数据量非常巨大。即使是全球最好的计算资源价值,也不能处理这么多的可能性。第二,蛋白质折叠靠的是能量,能量实际上非常复杂。从底层来讲,它是基...