Nature Commun | 北京大学陈雪梅课题组揭示细胞质mRNA翻译起始...
mRNA翻译过程包括起始、延伸、终止和核糖体回收等步骤,其中翻译起始往往作为限速步骤,被顺式元件和反式因子共同调控。Kozak基序是真核生物翻译起始位点(TranslationInitiationSite,TIS)所处的序列环境,以顺式调控元件的方式影响翻译活性。尽管不同物种的Kozak保守基序并不完全一致,但是其-3位的嘌呤(A或者G)和+4...
Nature子刊:浙大熊旭深团队开发基于Transformer的语言模型,预测...
该研究发展了基于Transformer架构的多模态深度学习模型Translatomer(以Translatome和Transformer的结合词命名)用于预测细胞特异性翻译过程,填补了mRNA表达与蛋白质水平之间的差距,解析了复杂疾病的遗传变异对基因翻译的调控作用,为机制未知的疾病相关遗传变异提供了全新的分子机制见解。Translatomer模型整合了基因序列和RNA-...
Nature Biotechnology丨突破mRNA翻译瓶颈:LEGO技术显著提升疫苗和...
翻译起始是mRNA指导蛋白合成的限速步骤,在这一过程中,真核翻译起始因子(eIFs)通过与mRNA的N7-甲基-鸟嘌呤(m7G)帽结构相互作用进一步招募细胞质中的核糖体等内源蛋白翻译机器,从而开启mRNA翻译。大量此前研究表明,mRNA帽以及5′非翻译区域的化学修饰对于mRNA翻译及稳定性具有重要调控作用并展现出了改善治疗性mRNA药物性...
Nature子刊:刘帅/顾臻/平渊团队设计三组分LNP,实现器官靶向的mRNA...
为了充分发挥mRNA疗法在各种疾病中的潜力,还需要实现真正的器官靶向递送。之前开发的器官靶向性LNP及吸入式LNP,在肝外mRNA翻译方面取得了突破,但纳米颗粒在肝脏中的积累让然存在,这促使对现有的LNP系统的真正靶向能力进行重新评估。近日,浙江大学药学院刘帅研究员、顾臻教授、平渊教授等在Nature子刊NatureCommunicat...
Meta新模型NLLB获Nature盛赞,200种濒危语言高质量翻译,“不让任何...
新智元导读MetaAI的NLLB-200登上Nature,「不让任何一门语言掉队」,能翻译200种语言的大模型获得Nature社论的盛赞——复兴了濒临灭绝的语言,但是Nature研究人员也郑重提醒Meta,必须将使用这些语言的社区也纳入进来,才会真正减缓语言的消亡。MetaAI刚刚在社交媒体X上宣传自家的大模型NLLB,全称为NoLanguageLeft...
Meta 翻译大杀器NLLB200登上Nature:翻译质量提高44%
今天,Meta在《自然》(@Nature)杂志发表了一篇文章推出一种AI模型:NoLanguageLeftBehind(NLLB),能够在200种语言之间直接提供高质量的翻译NoLanguageLeftBehind(NLLB)模型架构详解NoLanguageLeftBehind(NLLB)项目旨在通过先进的神经机器翻译技术,实现对200种语言的高质量支持,尤其关注低资源语...
国内Nature,Cell三连发:翻译后修饰研究如何花式发顶刊
单磷酸腺苷酸化修饰(AMPylation)是一种广泛存在于原核和真核生物中的蛋白质翻译后修饰,在腺苷酸化酶的催化下,使用单磷酸腺苷基团(AMP)修饰蛋白质的氨基酸侧链。本文报道了使用三磷酸腺苷(ATP)作为配体和宿主肌动蛋白作为激活剂,嗜肺军团杆菌的效应蛋白LnaB对PR-Ub上的磷酸核糖基的磷酰基进行AMPylation,从而生成ADPR-...
Nature子刊:将Transformer模型应用于蛋白翻译过程
近日,美国麻省理工学院-哈佛大学Broad研究所邵斌博士及研究团队在NatureCommunications期刊发表了题为:Riboformer:adeeplearningframeworkforpredictingcontext-dependenttranslationdynamics的研究论文。该研究开发了一个名为Riboformer的深度学习框架,为我们理解翻译动态过程提供了全新的方法。这项研究利用Transformer...
Nature子刊:带你认识甲状腺癌基因变异特征及临床管理
EIF1AX编码蛋白质翻译起始复合物的一个成员,在5%-20%的FTCs和约5%的滤泡型PTCs中发生突变,并诱导异常翻译。PTEN或EIF1AX突变也可发生于滤泡性腺瘤,这提示它们的癌症起始效能低于其他驱动事件(如BRAF突变)。然而,当与其他特异性MAPK激活事件结合时,PTEN或EIF1AX突变可促进甲状腺癌进展。
Nature Biotechnol | 化学修饰polyA尾可增强mRNA的翻译能力
近日,美国Broad研究所王潇团队在NatureBiotechnology上发表了文章Branchedchemicallymodifiedpoly(A)tailsenhancethetranslationcapacityofmRNA,通过合成带具有多个合成polyA尾的mRNA来延长mRNA蛋白表达的持续时间并提高表达水平。首先,文章在之前报道的方法(使用T4RNA连接酶I将化学合成的寡核苷酸(oligo)连接...