Nat Cell Biol | 核糖体毒性介导亨廷顿疾病的发病机制
作者分析ribo-seq数据时发现uORF和主要的ORF都有核糖体启动,当用cycloheximide(CHX)处理阻断翻译的延长时,核糖体占据了uORF的整个区域,但没有延伸到主要的ORF区域,这表明uORF通过减少主要的ORF翻译启动抑制HTT基因在体内的翻译。而在thapsigargin(Tg)处理诱导应激反应的情况下,大部分mRNA翻译效率下降,但是HTT和另外一种同...
Neuron|孙疏影团队揭示核斑功能紊乱导致C9ORF72-FTD/ALS的病理机制
螯合特定的RNA结合蛋白(RBPs),导致其功能紊乱;二是转运到细胞质中的GGGGCCRNA通过非AUG起始的蛋白翻译生成具有毒性的二肽重复蛋白(DPR),包括多聚甘氨酸丙氨酸(poly-GA),多聚甘氨酸脯氨酸(poly-GP)和多聚甘氨酸精氨酸(poly-GR)等。
Nature Methods | 突破蛋白质功能研究瓶颈:ORFtag高效标记与筛查...
ORFtag是蛋白质组功能筛查的多功能工具(Credit:NatureMethods)图a.ORFtag方法的总体概述。ORFtag基于逆转录病毒载体,这些载体包含一个强启动子(Pstrong)、选择基因(NeoR)和功能标签。标签后面接一个剪接供体序列。在大规模转染的细胞中,ORFtag盒随机整合到基因组中,通过将功能标签与整合位点下游的剪接受体位点...
北京大学申请ETV2的ORF序列专利,用于将干细胞分化为内皮细胞能够...
专利摘要显示，本发明提供了一种ETV2的ORF序列以及一种内皮细胞的制备方法，属于内皮细胞开发技术领域。本发明中ETV2的ORF序列如SEQIDNO.1所示，能够高效表达ETV2蛋白，用于翻译能够得到更多的ETV2蛋白，表达效率更高，用于将干细胞分化为内皮细胞能够显著提升转化效率。本发明提供的内皮细胞的制备方法，制备效率...
National Science Review丨吴仲义/文海军团队开发广谱高效的抗...
冠状病毒进入宿主细胞后,首先以病毒基因组RNA为模板,利用宿主的核糖体翻译出ORF1ab,随后ORF1ab水解,产生16个非结构蛋白,其中包括病毒复制所需要的酶。吴仲义/文海军团队于2020年4月份通过分析新冠病毒的基因组结构特征,首先指出这种特殊的编码机制(先完整翻译出一个“超级蛋白”再水解)提高了冠状病毒的进化稳定性,...
铁死亡新调节因子!南京医科大学发文:胃癌治疗的强大策略
这些ORF可能编码与多种人类癌症中关键功能相关的新型蛋白质或肽类,但这些lncRNA的翻译潜力及其蛋白质产物的功能尚未得到充分研究,尤其是在胃癌(GC)中(www.e993.com)2024年11月8日。10月24日,南京医科大学研究团队在期刊《AdvancedScience》上发表了题为“HCP5DerivedNovelMicroproteinTriggersProgressionofGastricCancerthrough...
STM丨汪秀星/张弩合作揭示非经典开放阅读框编码肽段MPEP促GBM恶性...
短开放阅读框(ORF)是真核DNA的共同特征。最新研究进展提示人类基因组中短ORF具有翻译潜力。许多可翻译的短ORF已被鉴定在具有已知编码DNA序列(CDS)的mRNA转录本的5'非翻译区(5'-UTR)或3'非翻译区(3'-UTR)内,甚至在以前被认为是非编码的RNA转录本中。mRNA翻译稳态的精细调控对于维持正常组织和预防肿瘤发生至关重...
中山大学吴仲义/文海军团队开发广谱高效的抗冠状病毒药物
冠状病毒进入宿主细胞后,首先以病毒基因组RNA为模板,利用宿主的核糖体翻译出ORF1ab,随后ORF1ab水解,产生16个非结构蛋白,其中包括病毒复制所需要的酶。吴仲义/文海军团队于2020年4月份通过分析新冠病毒的基因组结构特征,首先指出这种特殊的编码机制(先完整翻译出一个“超级蛋白”再水解)提高了冠状病毒的进化稳定性,...
Neuron:孙疏影团队揭示额颞叶失智症/ALS等的病理新机制
其中poly-GR表达最低但毒性最大。前期研究显示在FTD/ALS患者脑组织中存在大量的RNA可变剪接异常,外显子跳跃(exonskipping)和内含子保留(intronretention)事件在C9ORF72-FTD/ALS患者脑组织中尤为突出,但是其分子机制并不清楚。2024年8月23日,约翰斯霍普金斯大学医学院孙疏影团队在Neuron杂志在线发表题为Disruption...
Science:改写教科书!细菌能够在基因组外从头生成新基因,以对抗...
值得注意的是,这种DNA产物可以有效转录,产生mRNA编码无终止密码子的、永无止境的ORF——Neo,其翻译导致有效的细菌生长停滞,从而阻止病毒的复制、增殖和传播。研究模式图此外,系统发育分析和多种DRT2同源物的筛选进一步揭示了滚环逆转录和Neo蛋白功能的广泛保守性。这项工作强调了细菌逆转录酶以RNA为模板创造新基因的...