Nat Cell Biol | 单细胞新RNA测序在单次转录爆发层面上揭示了转录...
在实验中,研究者对10,000个原代小鼠成纤维细胞进行了单细胞新RNA测序,以推断转录爆发的动力学参数。NASC-seq2方法显著提高了检测敏感性和细胞处理通量,使得在每个细胞中检测到的基因数量大幅增加。图1:a.随着测序读取数增加,每个K562细胞检测到的基因数量变化。b.针对F1原代成纤维细胞的大规模NASC-seq2实验示意...
中科院动物所金坚石组综述16S rRNA基因扩增子测序技术的前世今生
为了利用16SrRNA基因解析细菌菌群的组成,自1985年以来,人们一直在开发可用于全面解析菌群中16SrRNA基因的测序方法。以下是大多数已发明的16SrRNA基因扩增子测序方法的标准流程:通过一对靶向16SrRNA基因保守区域的通用引物扩增菌群中细菌的16SrRNA基因,并利用高通量测序平台测序获得所有扩增的16SrRNA基因的序列。...
机器学习模型如何巧诊儿童疑难炎症病症
该团队把RNA转化为DNA,接着进行了DNA测序,对基因组的蛋白质编码区域加以分析。洛伊花费了一年时间试验机器学习算法,旨在样本中找出疾病特征,基本上构建了一系列不同的工具来理解无细胞RNA。除了开发出用于诊断的精准模型之外,研究人员还证实,无细胞RNA测序可用于量化对特定组织和器官的损伤,包括肝脏、心脏...
人类基因组计划已完成20年,DNA何时实现“随手测”
中国工程院院士詹启敏说,我们认识肿瘤的时候不仅仅是用肝胰肺肾来区分,还可以把肿瘤细胞变异的DNA分子当作肿瘤“ID”。通过对肿瘤细胞进行测序深入了解肿瘤,可破解“ID”对应的密码,开发出对应疗法,实现“精准打击”。中国科学院院士杨焕明说,现在成本降低后,很多以前舍不得测的基因组类别现在都能测序了,比如疾...
《中国肺癌杂志》发布非小细胞肺癌DNA+RNA同步共检专家共识
我个人认为,DNA+RNA同管共检会是今后初诊晚期非小细胞肺癌患者基因测序的大趋势和大方向。”针对本《共识》的一次性同步检测DNA和RNA的技术,和目前国内已有的DNA+RNA检测的区别,周清华教授认为:“前DNA+RNA的检测策略可以分为三类:一类可以称之为“联合法”,实质上是取了患者肿瘤组织后,分别对DNA和RNA进行抽提...
细胞游离DNA测试或有助于李法美尼综合征患者早期发现癌症
使用靶向基因组测序、浅层全基因组测序和无细胞甲基化DNA免疫沉淀测序(cfMeDIP-seq),研究小组研究了患有活动性癌症、或随后诊断出癌症的个体血浆样本中的肿瘤突变、拷贝数变化、与癌症相关的ctDNA片段模式以及cfDNA中发现的甲基化标记(www.e993.com)2024年10月18日。玛格丽特公主癌症中心OICR主任TrevorPugh表示,这种方法可以检测血液中多种不同类型的...
融资超20亿!基因测序“黑马”!
#台式DNA测序仪AVITI??2022年3月,ElementBiosciences公司(以下简称:Element)召开发布会披露了期待已久的AVITI??台式DNA测序仪,公布了相关技术细节及参数。AVITI??测序仪具有更优越的性能、更低的成本和更高的灵活性,应用方向包括RNA基因表达、单细胞RNA测序、全外显子组测序和其他靶向测序等领域。
【云飞杂记】真菌传之测序
细胞以膜为界,动物以皮肤为界;我们可以对DNA进行测序,区分生命个体。最重要的是,我们的定义优先考虑了有机体及其相关特征:这是一个跟环境物理分离,具有DNA并可以复制,遵照自然选择的实体。基因测序前,我们会认为遍地的蘑菇是生命群体吧,即使是隔条马路的同一种蘑菇,也不会认为是一个生命个体吧。
垂医科普|什么是水泡状胎块/葡萄胎?如何精确诊断?
p57免疫组化检测:p57是一个父源印记母源表达基因,CHM通常表现为细胞滋养细胞和绒毛间质细胞呈p57核染色阴性;而PHM和非葡萄胎妊娠中,细胞滋养细胞和绒毛间质细胞呈p57核染色阳性,所以p57无法对PHM和非葡萄胎妊娠进一步区分。染色体核型分析:核型分析常用于从完全性葡萄胎和非葡萄胎性水肿性流产中鉴别部分性葡萄胎,但...
深瞳丨人类基因组计划已完成二十年??DNA何时实现“随手测”
中国工程院院士詹启敏说,我们认识肿瘤的时候不仅仅是用肝胰肺肾来区分,还可以把肿瘤细胞变异的DNA分子当作肿瘤“ID”。通过对肿瘤细胞进行测序深入了解肿瘤,可破解“ID”对应的密码,开发出对应疗法,实现“精准打击”。中国科学院院士杨焕明说,现在成本降低后,很多以前舍不得测的基因组类别现在都能测序了,比如疾病基因...