Nature:蛋白质测序技术突破:PASTOR单分子水平精准解读蛋白质突变...
利用PASTOR技术对蛋白质分子中激酶磷酸化进行检测和图谱化的结果(Credit:Nature)激酶磷酸化的检测模型:图a展示了一个新的PASTOR蛋白(PASTOR-phos),用于特异性检测激酶活性。蛋白质结构中设计了特定的磷酸化位点序列,例如针对蛋白激酶A(PKA)的LRRASLG序列(kemptide),以及含有CKII识别位点的序列。实验目的是通过纳米孔...
蛋白组学测序数据表怎么看
1、蛋白质ID(ProteinID)唯一标识每个蛋白质的编号,通常是数据库中的标识符,如UniprotID。2、蛋白质名称(ProteinName)蛋白质的通用名称或描述性名称。3、谱图计数(SpectralCount)检测到的谱图数量,反映了蛋白质在样本中的相对丰度。4、肽段序列(PeptideSequence)用于识别蛋白质的特定肽段的氨基酸序...
2024国自然热点—组蛋白乳酸化修饰在肿瘤研究中的思路
2.1利用ChIP-seq技术寻找组蛋白乳酸化修饰的下游靶标。高通量测序数据。H3K18laChIP-seq结果:H3K18la在启动子区域有一定占比(图3A),GO和KEGG显示H3K18la特异性基因在代谢和肿瘤相关通路中富集(图3B),表明组蛋白乳酸化修饰在肿瘤发生过程中发挥了调节作用。图3H3K18laChIP-seq结果展示2.2ChIP-...
打破AlphaFold大模型局限,世界最大蛋白质相互作用数据集AlphaSeq...
他们最近发布的AlphaSeq数据库专注于蛋白质-蛋白质相互作用(protein-proteininteraction,PPI),包含了超过7.5亿条测量结果,构成了世界上最大的PPI数据集。在AlphaSeq数据的基础上,训练出的AlphaBind模型可以准确预测有不同结合特性(亲和力、特异性、交叉反应性、表位等)的蛋白质序列,从而辅助蛋白质设计或发现全新的蛋...
【单细胞测序系列】转录+蛋白组protein-RNA single-cell analysis...
三、实验结果说明1、流式分选的各亚类T细胞,在AbSeq测序后用AbSeqCD25和CD127做散点图呈现与流式细胞术一样的分布,说明AbSeq具备蛋白质测量的高灵敏度。2、幼稚和记忆标志物CD45RA和CD45RO只能在蛋白水平检测。CD4+T细胞功能分化的主要鉴别方式是获得对抗原反应的记忆表型,典型的特征是幼稚细胞上CD45RA和记...
【单细胞测序系列】只做转录组不做蛋白组,意义少一半?
带有oligo寡核苷酸的抗体能够在单细胞测序实验中同时检测蛋白质和mRNA表达,有助于加深对蛋白质生物学的理解,并加速单细胞研究(www.e993.com)2024年10月7日。40个指标选择意义向上滑动3、RNA捕获、文库、测序三实验结果说明1、mRNAcellmap细胞图谱结果从三类样本健康、COVID-19感染者和康复者收集到的124,726细胞,通过T-SNE做可视化...
蛋白质“扩增测序”新方法 | NSR论文
蛋白质是生命功能的基石,单分子、单细胞水平的蛋白质测序技术能够为科学研究带来突破性的进展,并推动人类疾病诊断和治疗的进步。尽管基于质谱的蛋白质组学技术已经能够快速、高通量地鉴定生物样品中的蛋白质,但是与更为成熟的核酸测序技术相比,尚不能借助类似聚合酶链式反应(PCR)的技术直接扩增蛋白质分子,低丰度蛋白质...
...methods》期刊封面 解码“生命天书” 成功破译蛋白质测序难题
withfunctionalizednanopore”的研究论文,阐明纳米孔单分子检测新策略,实现了对全部20种天然氨基酸的直接区分,提出并验证了纳米孔外切酶实时多肽测序方法(简称NEPS),为实现单分子蛋白质测序提供了可行途径,展示出生物传感器技术与人工智能算法结合的优异潜力,代表我国生物传感技术与蛋白组学工具的原始创新能力进入全球前沿...
解码“生命天书”成功破译蛋白质测序难题
functionalizednanopore”的研究论文,阐明纳米孔单分子检测新策略,实现了对全部20种天然氨基酸的直接区分,提出并验证了纳米孔外切酶实时多肽测序(简称NEPS)方法,为实现单分子蛋白质测序提供了可行途径,展示出生物传感器技术与人工智能算法结合的优异潜力,代表我国生物传感技术与蛋白质组学工具的原始创新能力进入全球前沿方阵...
四川生物治疗全国重点实验科研团队破译蛋白质测序难题 进入全球...
当前蛋白质测序的公认标准是质谱测序法,但其检测范围窄、操作复杂、价格昂贵。该科研团队提出的纳米孔外切酶实时多肽测序(NEPS)方法,使用机器学习算法准确区分不同氨基酸的电流信号,实现了全部20种天然氨基酸的高灵敏度、无修饰直接检测。NEPS方法为实现单分子蛋白质测序提供了可行途径,展示出生物传感器技术与人工智能...