国内首个!《动物病原微生物宏基因组高通量测序技术规范专家共识...
根据测序目的和建库要求,提取方法可选用DNA提取、RNA提取或者DNA和RNA共提取。宏基因组高通量测序样品类型复杂,对文库核酸的纯度和浓度要求高,且细菌、真菌、寄生虫、支原体等微生物提取难度大,建议使用经过验证可用于宏基因组高通量测序的核酸提取试剂[10]。核酸质量应符合建库要求。2.3文库制备文库制备是指将基因...
专家共识丨动物病原微生物宏基因组高通量测序技术规范专家共识...
根据测序目的和建库要求,提取方法可选用DNA提取、RNA提取或者DNA和RNA共提取。宏基因组高通量测序样品类型复杂,对文库核酸的纯度和浓度要求高,且细菌、真菌、寄生虫、支原体等微生物提取难度大,建议使用经过验证可用于宏基因组高通量测序的核酸提取试剂。核酸质量应符合建库要求。(三)文库制备文库制备是指将基因组DNA...
NAR | 最全植物基因组数据平台 IMP中文教程( 核基因组更新到 1000...
IMP针对收录的数据提供了10个功能分析模块,示例性结果如下图,包括多基因表达图谱的绘制、共表达基因的搜寻和鉴定、基因簇的展示、BLAST序列搜索、多序列比对、在线差异基因分析(样品相关性热图、差异基因热图和火山图)、GO/KEGG富集分析、GSEA富集分析、IGV基因组浏览器展示、引物设计、序列提取等。IMP数据...
CRISPR后基因编辑底盘工具开发成功。海藻提取物作用机理有新发现
1月31日消息,人们对海藻源植物用生物刺激素作用机理的认识存在一个常见的误区,认为海藻提取物依靠其含有的植物激素成分发挥作物。但近期的研究显示,海藻提取物中天然的糖类、多酚类等物质才是此类产品发挥功效的活性成分,这些物质能够刺激植物天然的生理机能,以此改善植物的生长、产量、品质和抗逆能力。为了扫除这...
I.DOT 经济化土壤样品中DNA的宏基因组和扩增子文库的制备
根据长度、质量、数量和微生物群落对DNA提取结果进行了评价。所有土壤类型的DNA提取都很成功,进一步使用纳升级移液系统I.DOTone将Illumina扩增子和宏基因组文库制备体积分别缩小了5倍和10倍,对观察到的微生物群落没有显著影响。通过这些方案,DNA提取,宏基因组文库制备或扩增子文库制备耗时大约分别为3小时、5小时和6小...
贝瑞基因2024年半年度董事会经营评述
基因测序需要使用DNA提取试剂、DNA纯化试剂、建库试剂和测序试剂等试剂组(www.e993.com)2024年11月10日。公司NIPT建库试剂应用了自主研发的EZ-PALO快速建库方法,能够简便、快速完成建库。4、设备销售公司以实现“高通量二代基因测序、三代基因测序仪硬件平台全覆盖,同时带动遗传、肿瘤等领域的相关试剂销售,提高NIPTPlus、CNV-seq、WES等新品转化率”...
考古2023|科技考古:科技赋能,考古新知
张淦宇等介绍了距今4000年以来西藏37个遗址人群线粒体基因组研究结果。通过对多个单倍体类群开展系统发育分析,作者认为全新世早中期西藏与黄河中上游人群有共同的祖先。距今4000年以来,西藏人群的母系遗传关系整体上呈现出长期的连续性,与东亚其他地区北方人群的母系遗传联系在不同时期有所差异。其中,距今约4000-3000年...
羽龙:暗藏的航行者(距今曾经有1.3亿年)
在我国,桫椤已被国家列为一级重点保护植物,严禁砍伐。恐龙灭绝,桫椤独存。桫椤不开花,不结果,没有种子,那它是怎样繁殖的呢?木本植物通常是靠种子或插条来繁殖,而桫椤则是靠孢子繁殖的。桫椤的叶背上有球形的孢子囊,孢子就在囊中。当孢子成熟后就会破囊而出,继而借助风力在林中飘飞或被流水带走。一旦找到...
中药材品种与产地鉴别研究现状与思考
齐琳洁等[96]基于黄芩基因组开发SSR分子标记方法并对不同产地黄芩进行遗传差异分析,聚类分析可将10个黄芩产地分为两大类。张文青[97]利用ISSR技术对不同种源的黄芩进行鉴别研究,结果表明,黄芩主产区样本基本各聚为一支,部分种源间差异较大。3.7.3DNA序列分析技术...
基因组DNA提取常见问题及注意事项
4.对于基因组DNA提取,A260/280值如果低于1.7说明有可能存在蛋白污染,如果值大于1.9,说明可能存在RNA污染;如果洗脱样本时没有使用BufferEB,而使用ddH20,比值或偏低,因为Ph值会影响吸光值,并不表示样本纯度低;5.对于植物样本,样本处理量无法统一确定,对于一般样本(烟草,拟南芥等),提取量不超过100mg鲜重组织或者20mg...