2区-贵州中医药: 基于蛋白质组学和生信探究土茯苓治疗高血压的...

图6通过GO和KEGG分析DEP。(A)DEP的生物过程GO术语。(B)DEP的细胞成分GO术语。(C)DEP的分子功能GO术语。(D)DEPs的KEGG途径。6.差异表达基因的GO和KEGG通路富集分析我们对DEPs进行了GO和KEGG富集分析。DEPs的GO注释由三个部分组成,即BP(生物过程)、MF(分子功能)和CC(细胞成分),用于分析DEPs的功能富集。BP...

南京农业大学园艺学院生物信息学分析系统、高通量数据可视化分析...

金额￥19720元(包1:￥14496元、包2:￥5224元),由中标人支付。本项目代理费总金额:1.9720000万元(人民币)七、公告期限自本公告发布之日起1个工作日。八、其它补充事宜供应商认为中标或者成交结果使自己的权益受到损害的,可以在公告之日起7个工作日内,向新华招标有限公司或南京农业大学监察处提出书面质疑...

(生信实操)用R语言处理芯片数据及结果可视化分析

目前使用的判别分析方法主要包括:支持向量机、决策树、贝叶斯分类、神经网络法。03分析数据结果的展示方式3.1Venn图构建(venndiagram包)VennDiagram包提供了2到5个集合的绘图函数:包括绘制两个集合的韦恩图的draw.pairwise.venn,三个集合的draw.triple.venn,四个集合的draw.quad.venn,五个集合的函数draw.quintu...

单基因肿瘤生信分析怎样发表8分+?

ssGSEA算法结果表明,MYBL1与大多数免疫术语呈正相关,MYBL1与大多数代谢项呈负相关(图2C)。GO分析表明,对于生物过程(BP),最丰富的术语是排泄,肾上腺发育,氯化物跨膜转运(图2D)。对于细胞成分(CC)和分子功能(MF),这些术语主要在转运复合物中丰富(图2E,F)。GSEA分析主要富集在炎症反应,G2M检查点和E2F靶标方面...

基因家族纯生信分析依然可以发表6分+

TCGA分析显示,肝癌患者CDK1、CCNB2、CCNA2、TOP1A、BUB2、AURKB、CCNB1、BUB11B、NCAPG和KIF0的表达水平显著升高(图10)并与HCC患者的无病进展和总生存期(OS)相关(图11)。图10图1106外部数据库验证为了验证SKA1-3表达的结果,从GEO下载了GSE84402数据集。此外,还获得了GSE84402数据集,其中包括来自28对...

生信入门 | 初探WGCNA分析

结果如下图:结果是每个模块中包含的基因数量(www.e993.com)2024年11月27日。一般来说,结果包含十几个到二十几个模块是比较正常的,此外一个模块中的基因数量不宜过多,像我们这个结果里模块1的基因数量达到了2307,这个就有点太多了,主要是因为我们powers=14,软阈值太低了导致的。所以说上述软阈值的筛选可以对我们的模块分析起到微调的作用。

功能超全的生信分析网站,下一篇SCI就靠它了!

5.点击“submit”得出分析结果。1.基因差异表达气泡图展示了肿瘤组织与癌旁组织之间基因集的表达差异。气泡的颜色变化代表肿瘤组织与正常组织之间基因表达倍数的变化。分析结果以FC>2和显著性FDR<0.05为过滤条件,气泡的大小表示FDR值大小。点击左侧表格中癌症名称如图中“BLCA”,会展示出该基因在这种癌症中的差异...

菌群生信分析,有哪些值得关注的新工具?_腾讯新闻

代谢组学通过分析生物体或样品中的不同代谢物来帮助研究生理或病理过程,典型输出是对应于测量信号强度的峰值表;NOREVA是一种新方法,峰表要经过许多处理工作流程,这些工作流程由组合确定序列中的3~5个定义的计算组成,根据客观性能标准判断每个工作流程的结果,分析各种基准以突出这种新开发方法的独特性;该方法以R包...

大规模人群高深度WGS全基因组分析(自闭症万人基因组)-实战经验

CCDG流程规定了参考基因组版本，从FASTQ到CRAM文件的各步骤分析工具和参数选择，以产生功能等效(functionallyequivalent)的变异检测结果，能被广泛应用于多个人群队列项目。MSSNG自闭症万人基因组项目分析工具MSSNG项目经过广泛的方案测试，综合考虑到一致性、成本和速度等因素，最终选择了Sentieon软件来处理项目的全基因...

单细胞类型分析杀器---EPIC

▲设置结果呈现形式然后直接点击run开始运行,结果表格如下:▲运行结果最后进行结果分析,可以直接download结果表格导入R进行分析,也可以点击Figure查看结果图片,有啥图片呢?也不多,就三个:柱状图,每一根柱子比例都是1,不同颜色表示不同的免疫细胞在样本中所占的比例;...