Nature重磅综述 |关于RNA-seq,你想知道的都在这

short-readRNA-seq结果很稳定,对RNA-seq的short-read测序技术多次测试比较发现,其平台内和平台间的相关性都很好。然而在样本准备和计算分析阶段有一些步骤也会引入偏好性。这些限制会影响特定生物问题的解释,比如正确地识别和定量一个基因的多个转录异构体。这一局限与研究特别长或特别多变的转录异构体尤其相关。如人...

原位杂交仪概述及其DNA或RNA杂交实验中发挥的重要作用

此外,还需要注意样品的处理和杂交后的检测方法,避免产生假阳性或假阴性结果。总的来说,原位杂交仪是DNA或RNA杂交实验中不可或缺的重要设备。它为实验者提供了稳定、可靠的实验条件,使得杂交反应能够顺利进行,提高了实验的准确性和可靠性。随着分子生物学技术的不断发展,原位杂交仪的应用也将不断扩大和深化,为生物...

基于DNA分子电路的外泌体microRNA原位检测

这种选择性融合特点避免了非特异性交叉融合的风险,为目标外泌体来源的RNA提供了原位、准确的分析基础,并提高了RNA检测的置信度和可靠性。融合后,内置的步行器探针会对目标miRNA产生响应,生成放大荧光信号,实现高灵敏(检测限约为0.4fM)、高特异性的miRNA检测。研究结果显示,采用三种DNA逻辑电路(包括AND、OR和NOT逻辑...

沃信VOSHIN-300Y型原位杂交仪可用于DNA原位杂交实验

RNA原位杂交技术类似于DNA原位杂交,但使用的是标记的RNA探针。这种技术主要用于检测细胞或组织中特定RNA的表达和定位。例如,在神经生物学研究中,研究者可以利用RNA原位杂交技术观察神经元内特定mRNA的分布和表达水平,从而揭示神经元的功能和通讯机制。三、除了DNA和RNA原位杂交实验外,原位杂交仪还可用于其他类型的分子...

原位杂交仪可用于了解DNA或RNA序列在细胞组织中的定位表达

-考虑您计划使用的核酸或蛋白质探针类型。不同的原位杂交仪可能适用于不同类型的探针,如DNA、RNA探针或蛋白质抗体。3.灵敏度和分辨率:-考虑您对实验结果的灵敏度和分辨率要求。一些仪器可能具有更高的灵敏度和分辨率,适用于需要结果的研究。4.自动化程度:...

RNA和DNA测序助力儿童淋巴瘤精准诊疗,结合案例分析

分析了WES和RNAseq数据,显示常见于PMBL的分子变异,如SOCS1和PTPN1体细胞突变(www.e993.com)2024年11月5日。此外,还发现多个CNV,包括PMBL中报道过的染色体2p和9扩增。综合这些结果,诊断为PMBL。我们在其他淋巴瘤(如伯基特淋巴瘤、间变性大细胞淋巴瘤和DLBCL)的磁共振成像(MRI)和正电子发射断层扫描-计算机断层扫描(PET-CT)中也观察到肾脏病变...

原位杂交仪|恒温平滑肌槽百科及在组织生物学研究实验中的作用

原位杂交技术具有高灵敏度和高特异性的特点,可以检测低拷贝数的DNA或RNA序列,并且可以定位基因在细胞中的表达位置。此外,该技术还可以对整个组织样本进行无损检测,保留了样本的完整性和真实性。2.局限性然而,原位杂交技术也存在一些局限性。首先,该技术的操作过程较为复杂,需要专业人员操作和解释结果。其次,由于该...

肺癌融合基因检测:RNA 水平的 NGS 你听过吗?

基于DNA-basedNGS检测的驱动基因阴性患者中,RNA-basedNGS可以多检出10-14.2%可用药融合变异。对于驱动基因阴性患者的一线治疗,目前的中国临床肿瘤学会(CSCO)指南和NCCN指南通常建议选择免疫单药或者免疫联合治疗。而现有研究数据显示,NSCLC患者接受一线免疫治疗的PFS和总生存期(OS)仍劣于一线融合基因相关...

遗传学检测方法比较:荧光原位杂交(FISH)vs 微整列比较基因组杂交...

与免疫组化类似,偶联了荧光标记之后,需要加入显色剂进行后续的检测,显色剂有操作简便的“一步法”试剂,或当样本丰度较低时或希望获得更低背景的结果时,有“两步法”试剂。“两步法”检测试剂其实就是在RNA/DNA探针上偶联一个anti-biotin或anti-digoxin的信号放大试剂,然后再加入对应的显色试剂。

中科院1区-if27+: 旋覆花内酯靶向E2泛素结合酶UbcH5c抑制胰腺癌...

在Panc1和SW1990细胞中,细胞热位移实验进一步证实了DHPO-UbcH5c的结合。westernblot结果显示,在对照组中,UbcH5c在较低的温度下表达,随着温度的升高,UbcH5c表达消失。然而,加入DHPO后,在50℃时出现了一条较强的UbcH5c条带,即使温度升高到58℃,仍可检测到蛋白条带(图2g),这表明在Panc1和SW1990细胞中,DH...