抗体亲和力增强17倍,百奥几何、复旦AI方法模拟细微蛋白质互作
(2)在特征提取阶段,采用多级消息传递方案来全面了解蛋白质界面上复杂的相互作用。(3)提出了一种基于对比学习的预训练算法,利用CATH中丰富的未标记单链蛋白质结构,将侧链扭转角知识提取到模型中,进一步提升模型性能。GearBind的强大性能研究人员用两个现实世界的抗体亲和力成熟项目检验了他们基于GearBind的管线。
2024年中国蛋白粉行业成本结构和价值链分析 高价值环节主要分布在...
从蛋白粉产业链来看,产业链上游包括畜禽养殖和农业种植,其中畜禽养殖原材料包括鱼类、禽类、畜类的肉/蛋/奶等;农业种植原材料包括植物,例如坚果类、豆类、谷类食物,以米面和豆类为主。中游包括动物蛋白粉和植物蛋白粉;下游需求侧包括作为蛋白质膳食补充剂直接食用和作为功能添加剂加入食品工业、其他医药保健品的生产中。
西湖大学李子青/深圳湾实验室周耀旗等解读AI赋能的蛋白质结构与...
利用可基因编码的多肽标签-蛋白质化学反应,通过合理的设计及与蛋白质折叠的结合,我们已经合成了多种具有复杂拓扑结构的蛋白质,包括轮烷、纽结蛋白质、套索蛋白质、蛋白质索烃等。在此基础上,我们发展了单结构域蛋白质的拓扑改造方法,实现了一系列单结构域蛋白质拓扑异构体的选择性合成,并初步探讨了拓扑对构效关系的影...
蛋白质AI生成模型发布,阻断癌症靶点在望
AlphaProteo的训练数据,包括全球结构生物学界科学家们多年积累的蛋白质数据库(PDB)中的蛋白质数据,以及AlphaFold中的1亿多个预测结构,从而了解分子之间结合的方式,只要给定目标分子结构和首选结合位置,就能生成在这些位置与目标分子结合的候选蛋白质。具体来看,AlphaProteo可为多种靶蛋白生成新的蛋白结合剂,包括与癌症和...
水凝胶最新《AM》综述:工程化蛋白质水凝胶用于仿生细胞支架!
1)结构上,应注重蛋白质水凝胶的纤维结构,为细胞支架提供微观和宏观有序性以更好的模拟天然细胞外基质和诱导细胞生长。生物活性方面,未来可研究两种及以上的生物活性物质的相互作用对细胞行为的影响。响应性功能性方面,更多响应性方式例如离子相应、电磁场、超声响应值得被探索,以实现生物相容的、可逆的动态水凝胶性质...
蛋白质质量
糖尿病是一种常见的慢性代谢性疾病,影响着全球数以百万计的人(www.e993.com)2024年9月16日。管理糖尿病的关键在于合理的饮食调控,其中蛋白质的摄入是一个重要方面。科学的蛋白质摄入不仅有助于糖尿病
探索蛋白质结构解析的新途径与方法
1.冷冻电子显微镜(cryo-EM):冷冻电子显微镜是近年来蛋白质结构解析领域的重要突破之一。与传统的X射线晶体学不同,cryo-EM技术不需要蛋白质的晶体样品,而是通过冷冻和电子显微镜技术直接观察和分析蛋白质的结构。这种方法对于大型和难溶解的蛋白质非常有优势,使得蛋白质结构解析更加便捷和高效。2.蛋白质动力学分析:蛋白...
蛋白质结构的解析方法:如何揭示蛋白质的三维构象?
X射线晶体学是一种常用的解析蛋白质结构的方法。它基于X射线的散射原理,通过测量蛋白质晶体中X射线的散射图案来获得蛋白质的结构信息。X射线晶体学可以揭示蛋白质的原子级别细节,包括原子的位置、键长和角度等。这种方法在蛋白质结构研究中应用广泛,尤其是对于较大的蛋白质复合物和酶的催化机制的研究。
填补AlphaFold3空白,字节跳动提出物理引导的方法让蛋白质动起来
图片来源:《Accuratestructurepredictionofbiomolecularinteractions》AlphaFold3:构象覆盖度有限。AlphaFold3对蛋白质Cereblon在有/无配体结合条件下的预测显示出局限的构象变化。灰色:真实结构;蓝色:AlphaFold3预测结构。造成现有模型难以预测动态构象分布的主要原因是,蛋白质结构数据集仅有实验解析的单一静态结构或结合...
Nature Methods | 超过AlphaFold2精度,蛋白质互作结构预测新工具
打开网易新闻查看精彩图片图3.通过合理拼接单体MSA构建复合物MSA,进而预测蛋白质复合物结构。在这项研究中,张阳团队基于他们此前开发的DeepMSA迭代MSA构建算法,提出了改进版的DeepMSA2算法。DeepMSA2结合了一系列基于大标度宏基因组序列数据库的MSA生成策略,同时该方法结合了新的AI驱动的MSA打分策略来筛选高质量的...