Cell | 转座子:基因组中的“垃圾”如何化身为免疫调控的利器?
数据统计了各种转座子(TEs)类型的外显子化事件,主要包括SINE(短散布核元件,如Alu)、LINE(长散布核元件)、LTR(长末端重复序列)以及DNA转座子等。研究发现,在免疫基因中,Alu等SINE转座子的外显子化事件最多,且它们可以与母基因的正义链或反义链结合,从而形成新的剪接位点。IFNAR2-S和IFNAR2-L的异构体比对...
Cell:北京大学杜鹏团队通过剪接抑制获得两种新型人全能性干细胞
而na??vehESC和hEPSC在相同条件下未能形成类囊胚结构。免疫染色分析显示hTBLC类囊胚中CDX2+的TE-like细胞位于外层,OCT4+的ICM-like细胞聚集在内部,两种细胞之间形成明显的空腔。单细胞转录组分析进一步证明,由hTBLC衍生的类囊胚主要由TE-like,PrE-like以及EPI-like三种细胞组成。单细胞整合分析显示,hTBLC类囊胚...
《细胞》重磅:北大团队获得两种新型人全能性干细胞
免疫染色分析显示hTBLCs类囊胚中CDX2+的TE-like细胞位于外层,OCT4+的ICM-like细胞聚集在内部,两种细胞之间形成明显的空腔。单细胞转录组分析进一步证明,由hTBLCs衍生的类囊胚主要由TE-like,PrE-like以及EPI-like三种细胞组成。单细胞整合分析显示,hTBLCs类囊胚中的三种细胞谱系能够与人类E5-E7阶段囊胚中的对应细胞谱系...
Cell | 北京大学杜鹏课题组通过剪接抑制获得两种新型人全能性干细胞
免疫染色分析显示hTBLCs类囊胚中CDX2+的TE-like细胞位于外层,OCT4+的ICM-like细胞聚集在内部,两种细胞之间形成明显的空腔。单细胞转录组分析进一步证明,由hTBLCs衍生的类囊胚主要由TE-like,PrE-like以及EPI-like三种细胞组成。单细胞整合分析显示,hTBLCs类囊胚中的三种细胞谱系能够与人类E5-E7阶段囊胚中的对应细胞谱系...
Nature | 首次获得非人灵长类动物的性染色体完整序列,揭示不同...
与X染色体相比,类人猿Y染色体的大小差异较大,由于谱系特异性扩增区、回文、转座元件和卫星序列的积累,Y染色体具有低对齐性和高水平的结构重排。许多Y染色体基因在多拷贝家族中扩增,部分基因在净化选择下进化。因此,Y染色体表现出动态进化,而X染色体更为稳定。该研究结果发表在Nature上,文章题为“Thecompletesequence...
Nature:老人「致命一跤」有救了!广州健康院揭秘衰老个体肌肉萎缩...
进一步的snRNA-seq亚聚类分析表征在两种主要肌纤维类型中,存在肌腱连接和NMJ特化的肌核(www.e993.com)2024年12月19日。亚聚类确定了其他在成人或老年人肌肉中富集的细胞群。例如,II型肌纤维特异性的ENOX1+肌核在成人组中富集;相比之下,TNNT2+、ID1+、DCLK1+和SAA2+肌核在老年组中富集。与NADPH氧化酶在骨骼肌中的保护作用...
学术大爆发!中国/华人学者一天发表35篇Nature Communications|...
25上海交通大学陈广洁、王兆军及彭晓春共同通讯在NatureCommunications在线发表题为“Synovialmicroenvironment-influencedmastcellspromotetheprogressionofrheumatoidarthritis”的研究论文,该研究发现滑膜微环境影响肥大细胞促进类风湿关节炎的进展。26武汉大学HeHe及宋质银共同通讯在NatureCommunications在线发表...
...Genet:阿尔茨海默症和帕金森病的单核苷酸多态性研究, 揭示两种...
作者发现,MAPT有一段很大的连锁不平衡区域,且其有两个不同的单倍型,即H1和H2,二者都有超过2000个的SNPs,且在MAPT中的有近1800000个核苷酸的倒置(图10)。单倍型,又称单倍体型或单元型,指个体组织中,完全遗传自父母双方中一个亲本的一组等位基因,即位于染色体上某一区域的一组相关联的SNP等位位点。...
...联手发表17篇Nature,全面绘制哺乳动物初级运动皮层细胞类型特征
7.小鼠运动皮层转录组细胞类型的表型变异皮层神经元在基因表达以及形态学和电生理学特性方面表现出极大的多样性。大多数现有的神经分类法都是基于转录组学或形态电学标准,因为在同一组细胞中研究神经元多样性的两个方面在技术上具有挑战性。在这里,该研究使用Patch-seq对成年小鼠初级运动皮层中超过1,300个神经...
清华监督贝叶斯嵌入,对单细胞染色质可及性数据进行细胞类型注释
图2:评估数据集内注释性能。(来源:论文)为了进一步证明EpiAnno在可解释注释方面的优势,研究人员对小鼠前脑的转座酶可访问染色质(ATAC)-seq数据集进行了单核分析。EpiAnno获得了令人满意的注释性能,并捕获了具有特定潜在特征的不同细胞类型。然后,研究人员根据相应特征(方法)的负载确定了特定于细胞类型的峰...