12篇Nature系列论文齐发:全面解析肿瘤的起源、演化及细胞间相互作用

采用这种方法,研究团队揭示了小鼠胚胎发育过程中特定组织中细胞的精确增殖时间、不同细胞类型之间不寻常的发育关系以及由其独特的遗传历史所产生的新的上皮祖细胞状态。对小鼠腺瘤的分析结合了对人类癌前病变的多组学和单细胞分析,并对418例人类息肉进行了克隆分析,结果表明,15%-30%的结肠癌前病变起源于多个正常祖先,...

组织生物学:寻找新范式|介导|基质|微环境|巨噬细胞_网易订阅

考虑到组织的功能组织性,细胞类型的多样性通常可以分为两类功能:执行组织主要功能的细胞和执行支持功能的细胞,其中支持细胞用于促进和优化主要组织功能的性能(图4a)。原始-支持细胞关系在动物进化早期就出现在原始上皮-间充质组织单元中,其中上皮细胞执行防御、营养获取和维持内部稳态的主要功能,而间充质细胞通过产生...

《科学》:125个最具挑战性的科学难题|细胞|宇宙|灭绝|生物学|微...

干细胞是一种特殊的细胞,具有分化成其他细胞类型的能力。在周围细胞的正确生态系统中,称为干细胞生态位,干细胞分裂成子细胞,然后成为新的干细胞或具有独特功能的专门细胞,例如大脑、胃和肠道细胞。没有其他细胞具有这种分化或创造新细胞类型的转化能力。胚胎干细胞来自3-5天的胚胎,这些细胞特别具有多能性,可以用于再生...

Nature | 免疫细胞之间的相互作用促进免疫特征演化

他们发现大多数关联呈顺式调控关系,但有8.1%的基因表现出反式调控,尽管这些基因并不在相应细胞类型中表达,但它们能够影响至少一种免疫细胞类型的频率。这些基因通过与细胞类型的相互作用(如配体、代谢产物或细胞间连接)来影响相关的免疫细胞类型。此外,细胞反式基因在造血干细胞中的表达暗示了它们在分化谱系中对特定细...

...特异性内源性逆转录病毒包膜蛋白隔离SFRP2以调节人类心肌细胞...

这项研究证明了ERVH48-1如何在体细胞发育过程中调节WNT/β-catenin信号传导和细胞类型确立。据悉,内源性逆转录病毒(ERV)占据了人类基因组的很大一部分,其中一些编码的蛋白质可影响免疫系统或调节胚外早期发育中的细胞-细胞融合。然而,ERV衍生的蛋白质是否调控体细胞发育尚不清楚。

人类神经类器官系统多能性发育轨迹的单细胞表观基因组重建

研究人员使用人脑和视网膜类器官模型,对H3K27ac、H3K27me3和H3K4me3组蛋白从祖细胞到分化神经命运的修饰进行单细胞分析,以重建调节细胞身份获取的表观基因组轨迹(www.e993.com)2024年11月3日。研究人员捕捉了从多能性通过神经上皮到视网膜和大脑区域以及细胞类型规范的转变。抑制性和激活性表观遗传修饰的转换可以先于和预测每个阶段的细胞命运决定,...

科学家打造空间转录组分析新工具,无需使用单细胞数据作为参考,能...

Starfysh解决了目前部分测序技术存在的低空间分辨率的缺陷。该方法可以将不同组织的空间转录组数据、以及对应的组织学图片加以结合,通过空间基因表达与组织学特征,针对不同位点的细胞类型与细胞状态比例进行预测。与其他空间转录组方法相比,Starfysh无需使用单细胞数据作为参考,因此在分析上存在较好的灵活性,对于分析罕...

我快碎了!细胞转染颗粒无收,彻夜复盘后竟让课题组刮目相看

决定细胞转染效率的主要因素1.细胞因素细胞类型不同,转染效率也会有所差异。一般来说最容易培养和转染的是HEK-293细胞系,此外,贴壁细胞比悬浮细胞容易转染;增殖速度快的细胞比处于静止期的细胞容易转染;细胞系比原代细胞更易转染。细胞密度也会影响转染效率。不同的转染试剂或者细胞类型,要求转染时的最适细胞...

理解脑细胞的重要进展!《自然》:任兵团队绘制小鼠全脑表观遗传图谱

04研究团队推断了小鼠脑细胞亚型中的基因调控网络,并通过深度学习模型预测不同脑细胞类型中cCRE的活性。该图谱为理解人类大脑功能和疾病机制提供了重要的数据基础,有助于研究人类神经系统回路和疾病机制。以上内容由腾讯混元大模型生成,仅供参考▎药明康德内容团队编辑...

《自然》重磅专题:9篇论文齐发!全面展示迄今最详细的小鼠全脑细胞...

▲左上-基于解剖脑区的小鼠大脑的3D效果图;左下-不同脑区标志为不同颜色的小鼠大脑3D效果图;右上右下-小鼠大脑的垂直切片,不同颜色代表不同细胞类型,圆圈代表根据表观基因组分析在小鼠大脑中发现的细胞类型的数量和多样性。(图片来源/Credit:索尔克研究所)...