Nature重磅综述 |关于RNA-seq,你想知道的都在这
同样使用模板置换逆转录来制备全长cDNA,在加接头制备测序文库之前,可以自己决定是否进行PCR扩增。DirectcDNA测序可消除PCR偏差,获得的测序结果质量更高;PCR扩增的cDNA文库的测序产出(测序获得的reads数)更高,适用于样本中RNA含量较少的情况。而目前还未在ONTcDNA测序中发现PacBio测序存在的转录本长短选择偏好。这些...
Science丨挑战教科书——非编码RNA的滚环式逆转录生成毒蛋白,助...
本研究指出,面对T5噬菌体侵染时,DRT2系统的逆转录酶会以ncRNA中长度约为120bp的特定碱基序列为模板来产生cDNA。区别于传统逆转录酶的单次逆转录过程,DRT2系统采用的是滚环式逆转录,即单次逆转录之后,逆转录酶会返回120bp的模板序列起始点,进行多次“周而复始”的逆转录反应,最终产生包含多个(最多可达上百)逆转录...
外星生物学?细菌RNA编码新的基因,突破中心法则认知
逆转录酶将ncRNA作为cDNA的模板,跨越发夹结构环状部分的起始端和末尾端不断重复绕圈,持续进行逆转录,将相同的RNA序列多次复制到cDNA中。这个独特的过程称为滚环逆转录,生成了一段串联重复的单链cDNA序列。有趣的是,逆转录生成的单个cDNA片段并不能编码蛋白质,但当形成连续重复的序列时,才能实现蛋白合成。这是因为...
项目文章:空间转录组揭示玉米籽粒发育过程中蔗糖在韧皮部的运输
ZmSUT1和ZmSUT7在蛋白质序列和cDNA编码序列中的同一性分别为93%和91%,表明它们来自最近的重复(图S14和S15)。qRT-PCR显示ZmSUT1、ZmSUT2、ZmSUT4、ZmSUT5和ZmSUT7在玉米种子中表达水平不同(图S16和表S8)。我们的空间转录组数据显示,只有ZmSUT1和ZmSUT7在BETL中特异性表达,表明这两个重复拷贝在空间调控中...
张锋最新Science论文:发现“隐藏基因”,揭开全新遗传调控方式...
这两项研究都指出,cDNA包含的序列基序几乎与细菌σ70启动子的共有序列相同。这些启动子由两个序列基序组成,即-35和-10基序(之所以这样称呼,是因为它们分别位于转录起始位点上游35个和约10个碱基处)。DRT2系统ncRNA序列中的模板重复包含这两个基序,但排列方式不同,因此单个重复无法形成有效的启动子;但当连接到cDNA上...
颠覆教科书!张锋最新Science论文:发现“隐藏基因”,揭开全新遗传...
这两项研究都指出,cDNA包含的序列基序几乎与细菌σ70启动子的共有序列相同(www.e993.com)2024年11月3日。这些启动子由两个序列基序组成,即-35和-10基序(之所以这样称呼,是因为它们分别位于转录起始位点上游35个和约10个碱基处)。DRT2系统ncRNA序列中的模板重复包含这两个基序,但排列方式不同,因此单个重复无法形成有效的启动子;但当连接到cDNA上...
刚发Cell,又登Science!张锋团队两大领域新突破!
这两项研究都指出,cDNA包含的序列基序几乎与细菌σ70启动子的共有序列相同。这些启动子由两个序列基序组成,即-35和-10基序(之所以这样称呼,是因为它们分别位于转录起始位点上游35个和约10个碱基处)。DRT2系统ncRNA序列中的模板重复包含这两个基序,但排列方式不同,因此单个重复无法形成有效的启动子;但当连接到cDNA上...
如何查找连续的mRNA、cDNA、蛋白序列
出现了很多基因序列,在每个序列的右边还有“OrdercDNAclone”的链接,这些序列中有些序列是跟你的目的基因同名的,有些是别名(OtherAliases)与你的目的基因一致,根据每个序列的介绍认真选择你的目的基因。上图中我需要的IL6是标号为2的序列。2、查找cDNA序列...
疫苗行业专题报告之mRNA:通用的平台型技术,未来大有可为
与DNA疫苗一样，基于mRNA的疫苗技术支持一种相对简单的、完全合成的生产工艺，允许使用相同的既定生产工艺和设备生产不同的疫苗，但其在细胞中缺乏持久性且无法进行基因组整合，因此mRNA疫苗在安全性方面具有一定优势。重组病毒载体疫苗本质上应归属于DNA疫苗范畴，通过将编码目标抗原的基因序列整合到病毒载体中，利用病毒...
第二代差异显示系统与传统mRNA差异显示技术
传统mRNA差异显示技术(DDRT-PCR)是根据绝大多数真核细胞mRNA3'端具有的多聚腺苷酸尾(polyA)结构,因此可用含oligo(dT)的寡聚核苷酸为引物将不同的mRNA反转录成cDNA。该方法的创始人LiangP和PardeeA根据PolyA序列起点前2个碱基除AA外只有12种可能性的特征,设计合成了12种下游引物,称3′-锚定引物,其通式为5...