专访博德研究所计算科学家邵斌:用DNA语言模型破译和设计生命丨...

而DNA的序列跟自然语言很像,它们都是某种语言,只不过人类的语言由几千乃至几万个词组成,而DNA是由ATCG这4个碱基组成,它们都是序列数据。所以能不能把这种语言模型用在对DNA的处理上,我觉得是一个很重要的问题,如果我们能用类似于ChatGPT的方法去理解DNA,能够实现对DNA的交互设计,实现对DNA的知识挖掘,我觉得是非...

DNA未来或成完美硬盘?研究发现:一公斤DNA能保存所有地球文明!

DNA碱基对组成的序列,犹如原始的结绳记事,而且序列构成的链条越长,代表记载的信息也就越多。同样,科研人员先将要储存的信息转化编码,而后将字符串刻录到DNA的碱基对上,这样不同的碱基,就等于记录了不同的字符串。至于读取信息,现在的技术也已相当成熟。国内在这方面的研究已经持续了十几年,而且已经形成了储存信...

cfDNA甲基化在器官和组织损伤检测中的强大力量

DNA去甲基化:除DNMT外,DNA去甲基化酶(如TET(10-11易位))也是DNA甲基化动态平衡的关键组成部分。TET酶可以从DNA中去除甲基,将5-mC转化为5hmC(5-羟甲基胞嘧啶),并参与DNA去甲基化过程。AID(activation-inducedcytidinedeaminase,活化诱导的胞嘧啶脱氨酶)和AB(Apobec)是脱氨酶,通常与DNA碱基脱氨和脱氧核糖修饰...

不依赖脱氨酶的碱基编辑器开发成功

碱基对是形成DNA、RNA单体以及编码遗传信息的化学结构。组成碱基对的碱基包括A、G、T、C、U。碱基编辑作为一种前沿的基因组编辑技术,可以在不切割DNA双链的情况下,实现对单个碱基的精准编辑,因此也被认为更具安全性。该技术已广泛应用于基础研究、基因治疗和细胞工厂构建等领域。常用的DNA碱基编辑器,主要通过将可...

动脉粥样硬化中的DNA甲基化和组蛋白修饰及其表观遗传治疗视角

TLR基因启动子区(如TLR1、2、3、4、5、6、8等)的DNA甲基化可降低膜上TLR表达。根据修饰类型不同,TLR基因启动子附近核小体(Nucleosomes)区(如TLR2、3、4和5)的组蛋白修饰可正调控或负调控膜上TLRs表达;HAT直接与NF-κB互作或诱导其乙酰化,并将NF-κB招募到IL-6、IL-8和环氧合酶-2(COX-2)等促炎...

...朱炎团队和余垚团队揭示ERCC6和NAP1在植物和酵母中参与碱基...

BER的进展是由不同的酶介导的多个步骤组成的,这些酶协调修复中间体(repairintermediates)的转移(www.e993.com)2024年11月14日。在糖基化酶(glycosylases)启动BER后,无碱基位点所在DNA链的及时内切至关重要,因为这些无碱基位点虽然在BER中充当中间体,但是在不及时修复时容易形成具有更大诱变性和毒性的其它DNA损伤,导致基因组不稳定。BER修复的错误...

Cell 50周年专刊 | 时空组学在生物学和医学领域的新机遇

同时,科学家们仍在持续努力解读这部由30亿碱基对组成的生命“天书”,近年来,从细胞组学到时空组学的全面突破,使得我们可以在时间和空间的维度上,清晰地看到我们身体每个细胞的全景特征,彻底颠覆了我们认知生命的方法论,为理解这部基因组“天书”、为生物学和医学研究带来了前所未有的机遇。

鲁白:我们要做出真正一流的基础研究,还有很长一段路要走|科学|...

第四个是1950年,美国生物化学家埃尔文·查戈夫(ErwinChargaff)应用紫外分光光度法结合纸层析简单技术,发现DNA碱基组成的规律:嘌呤数等于嘧啶数(A=T,G=C)。但可惜的是,查戈夫始终没有弄明白碱基配对在DNA的结构的作用。第五个是1953年,物理化学家和晶体学家罗莎琳德·富兰克林(RosalindFranklin)捕捉到了DNA的X...

喝速溶咖啡会减少寿命?真相其实是这样……—新闻—科学网

在人体DNA中有一处非编码重复序列,被称为“端粒”,它与组蛋白一起组成了一小段DNA-蛋白质复合体。端粒本身是非编码DNA,并不负责合成任何蛋白质,但是它有着更重要的作用。它位于染色体的末端,类似于给染色体戴着一顶很高的“安全帽”,起到维护DNA稳定性的作用,避免基因组的损坏。

喝速溶咖啡会减少寿命?真相其实是这样……

在人体DNA中有一处非编码重复序列,被称为“端粒”,它与组蛋白一起组成了一小段DNA-蛋白质复合体。端粒本身是非编码DNA,并不负责合成任何蛋白质,但是它有着更重要的作用。它位于染色体的末端,类似于给染色体戴着一顶很高的“安全帽”,起到维护DNA稳定性的作用,避免基因组的损坏。