解读|为什么AI工程师预测蛋白质结构能获诺贝尔化学奖?
除了根据氨基酸序列预测蛋白质的结构——从线性的序列就能预测其折叠后的三维空间结构,人们在AI模型的帮助下,洞悉蛋白质结构的上述密码后,产生了更大想象力——创造具有新功能的蛋白质。这可能导致新的纳米材料、靶向药物、更快的疫苗开发、最小的传感器和更环保的化学工业。它也让我们更好地了解生命是如何运作的,包...
他们用AI破译蛋白质结构“密码”——三位科学家分享2024年诺贝尔...
在蛋白质的世界里,氨基酸以长链的形式相连,折叠成复杂的三维结构,赋予蛋白质重要功能。自20世纪70年代以来,科学家一直致力于根据氨基酸序列预测蛋白质结构,但这是一项极其艰巨的任务。因为有些氨基酸和其他氨基酸相互作用,有些氨基酸则具有疏水性。而且氨基酸链形成了复杂的形状,使精准确定蛋白质结构难上加难。AI模型...
2024年诺贝尔化学奖官方解读:他们通过计算和AI揭示“蛋白质奥秘”
然后蛋白质的魔法就发生了:氨基酸链扭曲并折叠成独特的三维结构(图1),这种结构有时是独一无二的。这种结构赋予了蛋白质功能。其中一些成为化学建筑材料,可以创建肌肉、角或羽毛,而另一些则可能成为激素或抗体。许多蛋白质形成酶,这些酶以惊人的精度驱动生命的化学反应。位于细胞表面的蛋白质也很重要,它们充当细胞与...
AI蛋白质折叠:在生命宇宙中漫游,远眺生物经济的流光
答案在于,蛋白质拥有丰富而复杂的空间结构,这些结构决定了蛋白质的功能。蛋白质以氨基酸为基本组成单位,氨基酸的不同排列(即序列)以及在此基础上的卷曲折叠,形成了特定的三维立体结构,进而执行不同的功能。人类现在已知组成蛋白质的氨基酸有20余种,如果它们可以以任意顺序和长度链接、并折叠形成不同的蛋白质,那么理论上...
2024年诺贝尔化学奖再颁 AI,到底是诺奖“水”了还是AI“杀死”了...
诺贝尔化学奖委员会主席海纳·林克(HeinerLinke)表示:“今年获得认可的发现之一与神奇蛋白质的构造有关。另一项发现则与实现50年前的梦想有关:根据氨基酸序列预测蛋白质结构。这两项发现都开辟了广阔的可能性。”如今,蛋白质作为化学工具的功能技术反映在生命的多样性中,比如研究小分子药物、带来新的纳米材料...
解读|为什么AI工程师预测蛋白质结构能获诺贝尔化学奖?
没有蛋白质,生命就无法存在(www.e993.com)2024年10月17日。作为化学工具,蛋白质惊人的多功能性反映在生命的巨大多样性上。结构决定功能。面对复杂的蛋白质结构的预测,过去耗时数年的工作,利用2024年诺贝尔化学奖得主丹米斯·哈萨比斯(DemisHassabis)和约翰·乔普(JohnM.Jumper)开发的AlphaFold等人工智能工具,现在只需要几分钟。
张锋最新Cell论文:揭示真核基因编辑器Fanzor结构多样性和切割机制
该研究展示了Fanzor蛋白在不同生物中所表现出的分子多样性,并深入解析了其通过RNA引导的DNA切割机制。作者通过冷冻电镜解析了来自不同物种Fanzor蛋白,以及不同构象下的13个结构,包括来自藻类Guillardiatheta的GtFz1、真菌Spizellomycespunctatus的SpuFz1和寄生真菌Parasitellaparasitica的PpFz1。这些结构揭示了Fanzor...
...内提高执行功能;利用AI发现16万种新RNA病毒;上下文依赖性的...
此外,帕金森病患者体内的相关神经元数量减少,并出现了病理性α-突触核蛋白的堆积。这一发现为帕金森病患者的早期睡眠障碍提供了新的解释,未来可能有助于开发针对这一疾病的新型治疗方法。研究发表在Cell上。#大脑健康#快速眼动睡眠#神经回路#帕金森病#睡眠障碍...
科学家发现男性不育的根本原因
“令人兴奋的是,这项研究可以帮助我们真正理解生命的根本,”Billmyre表示。对于Hawley来说,这项研究体现了该研究所在科研上的多样性和丰富性。Hawley的实验室通常对果蝇进行研究,但这项研究中发现的蛋白质并不存在于果蝇中,因此需要不同的研究有机体来开展实验。得益于该研究所的资源和技术中心,研究人员可以在小鼠...
开源多结构蛋白质预测大模型——Genie 2
Genie2是在Genie基础之上研发而成,不仅扩展了可设计蛋白质结构空间的广度和多样性,还引入了多模态能力,在蛋白质的预测准确率方面比现有同类模型Chroma、FrameFlow和RFDiffusion等更好。开源地址:httpsgithub/aqlaboratory/genie2论文地址:httpsarxiv/abs/2405.15489...