生物工程师研制新底物,助力木材分解酶研究

真菌具有酶,即微小的化学机器,能够做到这一点,但为了改进并使其适应工业用途,我们需要了解它们的工作原理,而研究人员没有合适的供料,即“底物”,供酶来研究其功能。“作为信州大学的一名研究生,我未能使用常用的测试底物生成我们在教科书中所熟知的典型酶促反应动力学图。我甚至联系了首先发现这种酶的研究人员,询问...

中国科大揭示Rpd3S/HDAC结合和催化核小体底物的分子机制

该研究解析了酵母Rpd3S/HDAC全酶复合体结合特定修饰核小体底物的复合物结构,首次发现完整的天然底物H3尾巴(1-24aa)结合在Rpd3S底物结合口袋,且H3K18残基的侧链朝向催化中心待催化;阐明了Rpd3S底物特异性的结构基础以及通过构象变化实现多位点催化的机制,尤其是Rco1亚基在核小体结合和位点特异性催化中起着关键作用,...

中国科大解析Lon蛋白酶的完整三维结构并揭示其底物识别与转移的...

LonAAA+蛋白酶(LonA)是一种在原核生物和真核生物细胞器中保守的ATP依赖性蛋白酶。LonA组装为同源六聚体,每个单体都包含一个N端结构域、一个中间ATP酶结构域和一个C端蛋白酶结构域。LonA通过降解受损或错误折叠的异常蛋白质在细胞蛋白质稳态中发挥重要作用,从而防止这些不需要的蛋白质种类形成有毒聚集体。LonA还...

他开创了AI蛋白质结构领域,现在要做比诺奖更大的事

功能性的蛋白质推动生物体内的机能与反应——帮助消化吸收的淀粉酶、脂肪酶,控制血糖的胰岛素,运输氧气的血红蛋白,存储铁的铁蛋白,传递信号的神经递质……一些蛋白质的大小对比。蛋白质分子的直径经常也就几纳米或者几十纳米,胰岛素只有51个氨基酸;助消化的胰蛋白酶有281个氨基酸;运氧气的血红蛋白有574个氨基酸;再...

刚刚!Jiangnan-China再夺国际金奖!|蛋白|科学|生物学|工程学院|...

聚对苯二甲酸乙二醇酯(PET)塑料废弃物污染已成为全球性的生态问题,而PET酶法降解作为一种理想的环境友好型解决方案,其效率却受到降解酶与底物结合能力的限制。因此,本项目采用STROM策略,通过筛选、融合并改造PET结合肽提升PETase对PET的降解能力。首先,使用深度学习模型筛选(Screen)获得了16种新型PET结合肽。然后,通过...

祖先序列重构拓展三萜2"-O-糖基化酶底物谱| 清华大学李春联合北...

尽管RTASLoop被鉴定为影响酶底物特异性的关键区域,但其作用机制有待进一步实验证实(www.e993.com)2024年10月31日。比如,可通过定点突变和酶活检测,分析RTASLoop中关键氨基酸残基的作用;或解析野生型酶和突变体的蛋白结构,阐明底物结合模式的差异。虽然ASR和系统发育分析被证实可有效指导UDP-糖基转移酶的功能优化和新酶挖掘,但这一策略能否推广至...

全球与中国脂肪酶行业调查分析及发展趋势预测报告(2024-2030年)

二、全球脂肪酶第一梯队、第二梯队和第三梯队生产商(品牌)及市场份额(2023VS2024)第五节脂肪酶全球领先企业SWOT分析第六节全球主要脂肪酶企业采访及观点第三章Covid-19对全球脂肪酶主要生产地区影响分析第一节全球主要地区脂肪酶市场规模分析:2023VS2024年一、2018-2023年全球主要地区脂肪酶产量...

一文搞懂 “抑制剂-激活剂-激动剂-拮抗剂-反向激动剂-阻滞剂”

非竞争性抑制(noncompetitiveinhibition)是指抑制剂与酶的非活性部位结合,形成酶-抑制剂复合物(EI)后再与底物结合形成酶-底物-抑制剂复合物(ESI);或是酶与底物结合,形成酶-底物复合物(ES)后再与抑制剂结合形成酶-底物-抑制剂复合物(ESI),不管是哪种形成方式,得到的中间体ESI都无法分解形成产物,酶促反应被抑制...

各种HIV药物的“前世今生”

整合酶位于宿主细胞中,附着在病毒DNA的3'端,启动病毒cDNA整合到宿主DNA中,然后转录形成前体蛋白。这个过程需要功能完整的整合酶以及病毒cDNA两端最后10-20个碱基对的完整性(Aquaro等人,2020)。整合酶抑制剂有两种类型:INSTI和INBI。前者附着在整合酶的催化核心结构域上,防止酶与DNA结合。后者与IN的异源口袋结合,阻碍...

真的假的?构建质粒这些知道的越少,成功率越高

解决方法:每μg的DNA至少使用3～5单位的酶。可能原因4:DNA被抑制剂污染解决方法:小量制备的DNA尤其容易受到污染物的影响,推荐使用质量有保证的DNA纯化试剂盒;或者增大反应体系以稀释污染物。胶中出现多余的条带可能原因1:如果胶中发现比预期更大的条带,这可能是由于酶与底物结合...