中国科大首次解析人类溶酶体维生素B12外排蛋白ABCD4的电镜结构

该蛋白由606个氨基酸残基组成,以同源二聚体的形式在人体内行使功能。本次解析的结构为生理状态下ABCD4二聚体复合物的结构,包含两个六次跨膜的跨膜结构域(TMD)和两个核酸结合结构域(NBD),整体呈现对溶酶体内开放的构象,其中两个核酸结合结构域各自结合一个ATP分子并二聚化,两个跨膜结构域通过跨膜螺旋的交错形成...

他开创了AI蛋白质结构领域,现在要做比诺奖更大的事

有些蛋白质是结构性的,有些蛋白质是功能性的。结构性的蛋白质组成生物的身体——头发和指甲里的角蛋白,皮肤里的胶原蛋白,肌肉纤维里的肌球蛋白,血管里的弹性蛋白。功能性的蛋白质推动生物体内的机能与反应——帮助消化吸收的淀粉酶、脂肪酶,控制血糖的胰岛素,运输氧气的血红蛋白,存储铁的铁蛋白,传递信号的神经递质...

AI精准预测蛋白质结构,结构生物学何去何从?颜宁等人点评

帮助解析了竞赛中涉及到的、实验多年没拿到的X射线晶体和cryo-EM冷冻电镜结构,比如T1058的膜蛋白是用了Alphafold2的预测模型之后,才跟原有晶体学数据综合成功解析了结构。AlphaFold2团队的JohnJumper报告表明,他们使用了基于注意机制的神经网络,动态调整网络中节点的顺序和链接;依靠的是端到端的优化整体构建结构,而不...

超越蛋白质结构,全面预测蛋白质与所有生命分子相互作用

这一最新模型能预测含有蛋白质数据库(ProteinDataBank)内几乎所有分子类型的复合物的结构,包括配体(小分子)、蛋白质、核酸(DNA和RNA)如何聚集在一起并相互作用,以及预测翻译后修饰和离子对这些分子系统的结构影响,从而帮助我们在原子水平上精确地观察生物分子系统的结构。这种用计算机解析蛋白质与其他分子复杂相互作...

2024诺贝尔化学奖解读:他们破译了蛋白质令人惊叹的结构之谜

在蛋白质中,氨基酸以长链的形式相互连接,形成三维结构,这是蛋白质功能的关键。自20世纪70年代以来,研究人员一直试图从氨基酸序列预测蛋白质结构,但这被认为是极其困难的。然而,四年前由戴米斯·哈萨比斯和约翰·江珀实现了一个惊人的突破。戴米斯·哈萨比斯其实是从游戏领域“跨界”来到化学领域。出生于1976年7月,四...

2024年诺贝尔化学奖揭晓!AI蛋白质设计和结构预测获奖!

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2024年诺贝尔化学奖:致敬蛋白质科学与AI的融合之旅

蛋白质是生命的基石,它是由氨基酸通过肽键连接而成的有机化合物,在生命体中扮演着多种多样的作用。人体的头发指甲、肌肉、免疫细胞甚至病毒都是蛋白构成的,但这些蛋白之间的作用却全然不同,决定蛋白质功能的关键就在于蛋白质的结构。因此,解析蛋白质的结构一直是科学家们探索生命奥秘的关键一环,也是人类实现百病不侵...

为何诺贝尔化学奖又颁给AI?万字详解:AI重塑结构生物学

《环球科学》杂志2024年10月新刊推出“AI重塑结构生物学”系列专题文章,恰逢其时地对今年诺贝尔化学奖的成果及三位获奖者的研究进行了深入解读。文章系统梳理了计算蛋白质设计与结构领域的发展历程,并详尽解析了其中的重大突破与前沿进展。为方便读者系统完整地了解今年的获奖成果,我们特将两万余字的专题内容全文刊出。

科学家用AI技术获诺贝尔奖化学奖,专家称AI是重要的技术手段

AlphaFold就是一款可以用来预测蛋白质的3D结构的人工智能平台，约翰·乔普就是该平台的第一作者。AlphaFold先进理念也经常出现在汪盛的课堂上，他表示，在教学过程中，自己注重将科技前沿和最新动态传授给学生，提升学生的科学素养。汪盛表示AI发展是人类科技发展的一个必然过程，从化学领域研究来看，AI的运用高效地为科学...

质谱技术揭秘蛋白质:从结构到功能的深度解析

蛋白质是生物体中最重要的分子之一,对于我们理解生命的机制和研发生物药物具有关键作用。质谱技术作为一种强大的分析工具,能够帮助我们揭示蛋白质的结构、组成、修饰和功能。本文将详细介绍质谱技术在蛋白质研究中的应用,着重强调质谱技术主要分析蛋白质的什么。