GWAS关联分析知识普及(样本收集、性状调查、基因分型、关联分析...
全基因组关联分析(Genomewideassociationstudy,GWAS)是对多个个体在全基因组范围的遗传变异(标记)多态性进行检测,获得基因型,进而将基因型与可观测的性状/表型进行群体水平的统计学分析。根据统计量或显著性p值筛选出最有可能影响该性状/表型的遗传变异(标记),进而挖掘与性状相关的基因。GWAS分析方法介绍G...
SOX4是单细胞分析揭示的动脉粥样硬化内皮细胞的新型表型调节因子
SOX4是单细胞分析揭示的动脉粥样硬化内皮细胞的新型表型调节因子动脉粥样硬化是一种进行性血管疾病,其特征是在动脉内膜积聚的脂质、形成纤维脂质斑块致管壁增厚、管腔狭窄。内皮细胞(ECs)的单层构成血管的内膜,负责生物力学信号的转导和血管张力的调节。ECs功能障碍以内皮依赖性血管扩张和血管收缩不平衡为特征,提示动脉...
我省建成全国首个蔬菜表型分析平台
表型指的是生命体可观测到的性状和特征,是基因型与环境互作的结果。植物表型包括叶面积、干物质、产量、抗病性、株型、抗倒能力、根部形态等指标。在育种研究中,表型测量至关重要。但过去,表型测量高度依赖人工,效率低、工作量大、误差大。高通量表型分析平台,则通过集成红外热成像、高光谱成像以及图像分析、深度...
多样性展现:质谱流式细胞技术解析细胞表型
质谱流式细胞技术是一种新兴的高通量分析技术,它结合了流式细胞术和质谱的优势。简言之,流式细胞术对细胞进行单细胞水平的分类与计数,而质谱则提供了对细胞表面蛋白质表型的强大检测能力。这种技术让我们有能力同时对数十亿细胞进行有标记的、无标记的或是特异性的表面蛋白表型分析。第二:为何使用质谱流式细胞技术?
Nature Genetics | 癌症基因组学的新突破:探索复杂基因型与表型...
组合遗传策略是一种通过分析多个基因变异与癌症表型之间的关联来探索癌症发生机制的方法。该策略通过综合考虑多基因交互作用,提供了更全面的癌症遗传图谱。在癌症研究中,组合遗传策略有助于揭示复杂的遗传网络,为癌症预防、诊断和治疗提供新的思路和方法。单细胞和空间解析测序技术在癌症研究中的优势是什么?
Nature Genetics | 肝硬化遗传机制的新突破:跨群体遗传分析揭示...
功能性和表型宽度的探讨通过定位影响基因表达的分子定量性状位点(molecularQTLs),如表达量定位(eQTL)和蛋白水平定位(pQTL),研究人员进一步探究了稀有变异与疾病特征之间的联系(www.e993.com)2024年7月23日。例如,通过比较表达量QTL分析与肝硬化的关联数据,研究人员可以推断出哪些基因在肝硬化的发展中可能起到关键作用。此外,利用共定位分析,研究人员...
类器官高通量表型筛选用于药物发现和药物再利用
高通量筛选(Highthroughputscreening,HTS)技术,是指以分子水平和细胞水平的实验检测方法(assay)为基础,以微孔板形式作为载具,以自动化操作系统执行试验过程,以灵敏快速的检测仪器采集实验结果数据,以计算机分析处理实验数据,在同一时间检测成千上万的样品,并以得到的相应数据库支持运转的技术体系,它具有微量、...
李海鹏/潘逸萱团队创建新型全基因组分析方法,并发现人类在早、中...
澎湃,澎湃新闻,澎湃新闻网,新闻与思想,澎湃是植根于中国上海的时政思想类互联网平台,以最活跃的原创新闻与最冷静的思想分析为两翼,是互联网技术创新与新闻价值传承的结合体,致力于问答式新闻与新闻追踪功能的实践。
为什么国宝大熊猫会有棕色的,是白化病吗?PNAS最新研究:揭开中国...
黑色和棕色熊猫毛发的表型为了研究黑色大熊猫与棕色大熊猫的毛发差异,研究人员采集了3只圈养黑熊猫和1只棕熊猫的毛发,并进行了细致的显微结构观察。显微镜观察结果显示,棕色毛发的黑素体明显少于黑色毛发。研究人员进一步采用透射电镜分析高度着色毛发部位,发现黑色头发的黑素体在横切面上呈近圆形,在纵切面上呈细长的...
DNA分析及其阴暗面
法律学者关注的另一个领域是法医DNA表型分析的实践。它旨在根据基因序列推断一个人的可见特征——皮肤、眼睛和头发的颜色,以及面部结构、雀斑的存在与否以及脱发的程度。然而,任何研究过生物发育的人都知道,生物体不仅是其基因的产物,也是其环境的产物,因此遗传信息只能说明部分情况。