Nature Biotechnology | 突破质谱细胞术的瓶颈:ACE技术助力低丰度...

总体而言,ACE技术为质谱细胞术分析提供了一种高灵敏度的方法,使得单细胞层面低丰度蛋白质组分的谱绘成为可能,并对相关疾病的研究和诊断提供了重要的技术支持。质谱细胞术(MassCytometry)是一种通过使用金属同位素标记的抗体来标记感兴趣目标的技术,能够在单细胞水平上同时测量数百万个细胞中的大约50种蛋白质或蛋白质...

如何看懂蛋白质组学图结果?全面解读质谱成分

质谱图是蛋白质组学图中最常见的一种图形表示方式。它通常由两个主要部分组成:质量轴和强度轴。质量轴表示质谱中各个离子的质量,而强度轴表示对应质量的离子的相对丰度。通过观察质谱图的形状和峰的位置,我们可以获取关于样品中蛋白质的信息。2.质谱峰的解读质谱图中的峰代表了不同质量的离子。每个峰的高度和...

iMeta | 北大深圳医院桂耀庭组揭示弱精子症患者精浆微生态的动态...

如图S1A所示,与正常组人群和AZS-I组人群相比,AZS-II组人群和AZS-III组人群精浆中假单胞菌的相对丰度显著降低,而弧菌和假交替单胞菌的相对丰度显著升高,上述分析提示精浆中不同菌属的丰度变化与中重度AZS发生具有潜在相关性。此外,我们对物种注释结果进行了进一步的分析,重点关注不同比较群体中常见和独特的扩增子...

Science重磅综述:二十年的微塑料污染研究——我们学到什么?

为了减少混淆,提出了统一的分类方案,并在政策中使用类似术语,例如《联合国塑料污染条约》草案中的“有意添加的微塑料”和“无意释放或降解产生的微塑料”(图1)。▲图1微塑料的分类和来源。(A)根据来源和尺寸提出的微塑料分类的方案图,以及潜在的干预措施。(B-E)各种微塑料类别的图像:来自化妆品的微塑料微珠,...

iMetaOmics | 张勇/李福平-先进糖蛋白组学在男性生殖研究中的潜在...

人类精液中精子和精浆的糖蛋白组学研究通常由同一团队进行,然后将二者进行比较。通常,糖蛋白的组成高度重叠。首先,糖组学分析揭示了包括富含Lewisx和/或Lewisy序列的丰富糖链在内的显著相似性。W型、平分型N-糖链在精浆中的丰度明显低于精子。个体之间,精子和精浆中的岩藻糖化和唾液酸化糖链水平差异巨大。进一步的...

未知杂质定性之液质图谱中分子量的解析原则

气化温度的降低可以减少分子离子进一步断裂的可能性,分子离子峰的相对丰度增加(www.e993.com)2024年11月25日。2.通常在质谱图中质荷比最高的位置就是分子离子峰,但是有时最高质荷比峰不一定是分子离子峰。其原因为:(1)当出现M+n(n=1.2。。。)同位素峰时,同位素峰可能出现在质荷比最高处。

iMeta | 齐素华/顾兵/罗兰/王亮-揭示玛咖来源细胞外囊泡可通过脑...

图3.Maca-EVs对照组和UCMS小鼠粪便中微生物群组成的影响在行为测试完成后,我们处死小鼠并收集了粪便样本进行16SrRNA测序分析。本研究包括了对照组、对照组+Maca-EVs、UCMS组和UCMS+Maca-EVs组(每组n=3个实验)。(A,B)展示了不同类群在门和属水平上的微生物群相对丰度(前10位)。(C,D)显示了Faith'...

2区-贵州中医药: 基于蛋白质组学和生信探究土茯苓治疗高血压的...

图5DEP识别结果。(A)与对照组相比,模型组中的基因表达存在差异。(B)与模型组(L-NAME)相比,SGR的差异表达基因。(C)模型组92种不同的蛋白质和SGR。5.差异表达蛋白的鉴定根据蛋白质丰度水平的差异,通过t检验评估实验组和对照组之间差异的显著性。不同组之间的DEP根据倍数变化>1.2或<0.85和p<0.05进行鉴定...

中科院1区-中国中医科学院:发酵杜仲叶水提物通过维持肠道稳态和...

(A)维恩图显示了ASV的重叠,(B)基于UniFrac的PCoA,(C)门水平的相对丰度,(D)厚壁菌门与拟杆菌门的比例,(E)属水平的相对丰度,(F)对HFD有反应的变化属与高脂血症相关指数的相关性。*|r|>0.5,p<0.05;**|r|>0.5和p<0.01。(G),(H)通过线性判别分析(LDA)效应大小(LEfSe)鉴定ND、HFD和FELE中的大多数...

小分子化合物结构确证相关技术要求和经验总结

卤素常有同位素峰,分子结构中存在的氯(Cl)和溴(Br)较典型,当分子中含有1个氯或溴时,相对丰度比分别为3:1或1:1;含有多个氯或溴时,笔者一般是手动计算,或采用Chemdraw中的Analysism/z值来判断。质谱解析中还有一条大家都比较熟悉的“氮规则”:化合物分子不含氮或含偶数个氮原子时,其分子离子的质量是偶数...