他开创了AI蛋白质结构领域,现在要做比诺奖更大的事

假如把一个生物体想象成一家工厂,那么DNA就是最原始的设计蓝图;RNA是根据设计蓝图复写而来的很多本操作手册,每本手册里包含了制造某个特定产品的具体步骤;而蛋白质则是一个个最终的产品,是工厂的梁柱、门窗以及千形万状的结构,是工厂里自动执行各种功能的“分子机器”。有些蛋白质是结构性的,有些蛋白质是功能性...

...NMR)等多种表征首次揭示了CaCO3的结晶过程及其前驱体的化学组成!

针对CaCO3的沉淀现象,本文通过LP-TEM的原位成像技术,对前驱体溶液中的核心-壳结构进行了深入观察,结果表明,DLP中的Ca????–HCO3??离子对和水分子在特定条件下形成稳定的微结构,随后转变为ACC。这一微观机理的表征不仅揭示了离子配对的动力学过程,还为研究矿物化过程提供了新的视角,强调了酸性蛋白质在延长无定...

...食品中的应用——戊糖乳杆菌调控花生蛋白分子结构及凝胶特性规律

随着发酵微环境的改变,球蛋白内部基团更活跃,蛋白结构展开程度最大,而花生分离蛋白、伴花生球蛋白发酵后游离巯基含量降低是由于在发酵过程中,新展开的蛋白界面不稳定,暴露出的巯基与氧气结合形成了二硫键,巯基重新被包埋,从而使表面巯基含量降低。结果表明,发酵处理可在一定程度上促使花生蛋白组分空间构象发生改变,生成聚...

...了,专家解读:2024诺贝尔化学奖为何颁给蛋白质的AI计算和结构预测

蛋白质序列的决定了它的结构和功能,就像一把钥匙只有对应形状的锁才能打开一样。”“蛋白质结构预测,实际上是个古老的问题,大家一直在破译的路上,而这次获奖成果解决了一个困扰生命科学领域近七十年的难题。”张贵军表示,这串“珍珠项链”中每一个“珍珠”的类型、排列顺序的“第一遗传密码”早在上世纪60年代已...

2024化学诺奖专家解读:颁给蛋白质预测和AI实至名归,化学家还不会...

解析蛋白质结构是困扰了科学家50年的难题。蛋白质是生命的基石,不仅组成了我们身体的器官组织等基本结构,还作为荷尔蒙、生物信号传递物质、抗体等广泛参与各种生命过程。蛋白质由20个氨基酸排列组合成的长链折叠而成,就像同样的纸能折成纸鹤也能折成盒子,不同的折叠方式所形成的结构决定了蛋白质的功能。

2024年诺贝尔化学奖揭晓!揭开蛋白质折叠的秘密

就在研究蛋白质结构预测的过程中,戴维·贝克也对蛋白质设计产生了浓厚的兴趣,采用纯粹的计算策略,尝试从头设计全新的蛋白质,在自然界中不存在的蛋白质(www.e993.com)2024年11月29日。以下是他的研究步骤:第一步:贝克依赖于他们开发的Rosetta蛋白质结构预测算法,可以预测氨基酸序列在形成蛋白质时可能采取的三维结构。

AlphaFold为什么能精准预测蛋白质结构?

当不同的氨基酸连成一串的时候,它们会脱水形成肽链,也就是蛋白质的一级结构;而这样的一级结构是不稳定的,受到疏水作用、氢键和范德华力等影响,肽链最终会折叠成一个非常复杂而稳定的三维结构。图1是一个蛋白质折叠前后对比的例子。图1:蛋白质折叠示意图丨图源:wiki...

疟原虫和弓形虫微孔的蛋白质组成及其潜在机制

Parasitology发表了题为“Apicomplexamicropore:history,functionandformation”的综述性论文,基于近年来顶复门原虫内吞研究的突破性进展,全面概述了该门的特殊内吞胞器——微孔的发现历史和功能,重点阐释了微孔在疟原虫和弓形虫中的结构和蛋白的异同,并提出了微孔核心蛋白K13、EPS15和UBP1等在微孔形成过程中的...

不只是 AlphaFold!一文读懂蛋白质折叠的前世今生_腾讯新闻

“从原子到生态系统,(蛋白质结构)就像是一种通用语言,”AlQuraishi说道。“所有事情都在这里发生。”细胞通过将称为氨基酸的小分子串成长长的多肽链来制造蛋白质。选择哪种氨基酸取决于DNA提供的指令集。在生成后的瞬间,多肽链精确地弯曲、折叠成蛋白质的最终三维形状。一旦离开分子装配线,它就迅速开始执行其生...

不只是 AlphaFold!一文读懂蛋白质折叠的前世今生:从“不可能”到...

“从原子到生态系统,(蛋白质结构)就像是一种通用语言,”AlQuraishi说道。“所有事情都在这里发生。”细胞通过将称为氨基酸的小分子串成长长的多肽链来制造蛋白质。选择哪种氨基酸取决于DNA提供的指令集。在生成后的瞬间,多肽链精确地弯曲、折叠成蛋白质的最终三维形状。一旦离开分子装配线,它就迅速开始执行其生...