前沿进展:通过层次结构信息和分子动力学模拟发现高活性肽

PepHiRe利用这一思想,从8种已知的BH3肽序列中提取出结构信息,辅助生成全新的多肽药物,进而靶向抑制与癌症密切相关的MCL-1蛋白。MCL-1蛋白通过阻止细胞凋亡,帮助癌细胞“逃脱”死亡,而我们设计的多肽药物则可以模仿BH3肽的功能,打破这种抑制,从而促进癌细胞死亡,减缓病痛。PepHiRe的工作流程可以分为三个主要步骤:...

从结构准确预测蛋白质功能,东北大学「CNN+GCN」统一框架

为了应对这些挑战,东北大学的研究人员从蛋白质结构出发,提出将卷积神经网络(CNN)和图卷积网络(GCN)结合成一个统一框架,称为双模型自适应权重融合网络(Two-modelAdaptiveWeightFusionNetwork,TAWFN),用于蛋白质功能预测。TAWFN在预测蛋白质结构功能方面表现出了良好的性能,优于现有方法。相关研究以「TAWFN...

Nature与Science同时出王炸!生命科学领域又一位“天才少年”诞生...

2024年10月9日,谷歌DeepMind的DemisHassabis、JohnJumpe因对蛋白质结构的预测,与蛋白质设计先驱DavidBaker分享了2024年诺贝尔化学奖。2021年,DeepMind推出了AlphaFold2,其能够根据氨基酸序列来准确预测蛋白质的三维结构。AlphaFold2的出现,引发了蛋白质结构及其相互作用建模领域的一场革命,为蛋白质建模和设计应用...

追问weekly | 过去一周,脑科学领域有哪些新发现?

酪蛋白激酶1δ的自我调节机制揭示人体生物钟调节新路径AI手机应用或将成为抑郁症非侵入性检测新工具█神经技术电子舌结合AI技术精准识别食品质量差异新算法助力神经网络克服“灾难性遗忘”基于神经连接图谱预测果蝇视觉系统功能的新突破新型非线性动态模型揭示神经活动与行为的复杂关系超薄光学设备助力精准监控与刺激...

Nature Methods:基因变异与蛋白质功能的动态链接:G2P平台推动临床...

通过G2P平台,可以方便地检索并可视化基因-蛋白质的映射关系,并且能够将数据下载用于后续分析。这一工具为基因组学与蛋白质结构之间的桥梁提供了极大的便利,为探索与疾病相关的遗传变异的结构功能机制铺平了道路。近年来,人工智能(AI)技术的进步极大地推动了结构生物学的发展,尤其是AlphaFold等AI驱动的蛋白质结构预测...

...等解读AI赋能的蛋白质结构与功能预测及设计丨Cell Press线上讲座

蛋白质的体内合成受基因调控,其主链结构多为线型结构(www.e993.com)2024年11月3日。具有非线型复杂拓扑结构的蛋白在大自然中较为少见,大多与特定的功能优势相联系。我们致力于拓展蛋白质的拓扑结构,以探索拓扑结构的构效关系以及生物医药应用。利用可基因编码的多肽标签-蛋白质化学反应,通过合理的设计及与蛋白质折叠的结合,我们已经合成了多种具有复...

圆二色光谱分析指导蛋白质结构与功能关系的研究

圆二色光谱分析是一种重要的技术,可以提供关于蛋白质二级结构的信息。通过圆二色光谱分析,我们可以鉴定蛋白质的二级结构类型,研究蛋白质的折叠状态和构象变化,并揭示蛋白质结构与功能之间的关系。这一技术在生物制药领域的蛋白质研究中具有广泛的应用前景,可以为药物设计和疾病治疗提供重要的指导和参考。

蛋白结构分析能否揭示蛋白质功能与相互作用的关键?

1.蛋白质结构分析的意义1.1功能解析:蛋白质的结构与其功能紧密相关。通过蛋白质结构分析,我们可以了解蛋白质的构象、活性位点和功能模块,从而揭示蛋白质的功能和调控机制。1.2相互作用研究:蛋白质的相互作用是生物体内复杂的分子交流方式。通过蛋白质结构分析,我们可以揭示蛋白质之间的相互作用关系,从而理解信号传递、酶...

AlphaFold为什么能精准预测蛋白质结构?

当不同的氨基酸连成一串的时候,它们会脱水形成肽链,也就是蛋白质的一级结构;而这样的一级结构是不稳定的,受到疏水作用、氢键和范德华力等影响,肽链最终会折叠成一个非常复杂而稳定的三维结构。图1是一个蛋白质折叠前后对比的例子。图1:蛋白质折叠示意图丨图源:wiki...

非粮科技|可再生的生物质基气凝胶:从结构设计到功能调控

一、结构设计和功能调控:该综述从自然界中普遍存在的结构得到启发,根据BAs的骨架形态,将BAs分为无序结构和有序结构。无序结构的BAs表现出各向同性的宏观性质。而在有序结构中,BAs的骨架沿特定方向排列,其表现出各向异性的宏观性质。通过调整孔径和孔分布可以构筑不同微观形貌的无序结构和有序结构的BAs,以满足BAs...