隆平高科:全基因组选择模型在长江流域籼水稻育种中取得成效
隆平高科:全基因组选择模型在长江流域籼水稻育种中取得成效新京报讯(记者刘欢)9月18日,袁隆平农业高科技股份有限公司(以下简称“隆平高科”)发布投资者关系活动记录表显示,公司全面熟化运用水稻商业化育种信息化系统,进一步提升分子育种信息化,升级规范化、标准化的基因型鉴定流程和实验室信息管理系统,研发的全基因组选择...
我国科研团队发布水稻完整参考基因组
论文通讯作者、中国农业科学院深圳农业基因组研究所研究员商连光介绍,为此,研究团队以水稻“日本晴”为材料,综合利用新一代测序技术,完成了“日本晴”参考基因组的完整组装,其大小为385.7百万碱基对,每条染色体的端粒到端粒均由一条完整连续的序列组成,碱基精确度超过99.9999%,最新的组装新增了12.5百万碱基对的基因组序...
经典荟萃|近期植物泛基因组研究集锦
近日,国际著名期刊《PlantBiotechnologyJournal》,《NatureGenetics》,《NatureCommunications》等陆续发表公布了利用HiFi测序技术助力的泛基因组的研究成果,涉及物种分别为菠菜、鹰嘴豆、菜豆、水稻,以下为这4个物种泛基因组研究成果简要介绍。1中国农业科学院蔬菜花卉研究所钱伟团队构建了菠菜泛基因组近日,中国农业...
...张勇课题组开发基于Cas12 核酸酶祖先TnpB的紧凑型植物基因组...
2.为了探究IsDge10在水稻基因组中的多基因编辑能力,作者开发了基于高效RZ核酸酶及双PolII驱动的IsDge10系统(图2A),并通过水稻原生质体转化,与扩增子通量测序策略对IsDge10多基因编辑系统的编辑能力与编辑模式进行了分析。结果表明:1)IsDge10多基因编辑系统,在7个水稻原生质体测试位点均能够进行编辑(图2B);2)针对Is...
我国科研人员发布完整的水稻参考基因组
中国科学院院士钱前表示,此次发表的水稻“日本晴”参考基因组所有染色体端粒到端粒的组装结果,是在水稻中实现真正意义上的全基因组完整无缺口组装。该成果是水稻基因组组装和基因组学研究的重要进展。据悉,这项研究成果近日由中国农科院深圳农业基因组研究所联合崖州湾实验室、中国水稻研究所、中国农科院作物科学研究...
...Physiol | 南京农业大学张文利课题组在全基因组水平鉴定水稻单...
近日,南京农业大学张文利教授课题组在PlantPhysiology在线发表了题为“Genome-widecharacterizationofsingle-strandedDNAinrice”的研究论文,在全基因组水平上鉴定了水稻中的ssDNA(www.e993.com)2024年10月4日。该研究利用S1核酸酶切割单链DNA结合末端标记和测序方法(ISS1-seq),在全基因组水平表征了水稻ssDNA,发现ssDNA与多种非B型DNA结构和...
中国农业科学院作科所构建基于深度学习的水稻全基因组选择新方法
5月28日,中国农业科学院作物科学研究所联合国内多家科研单位,构建了用于水稻基因组选择的大规模中国栽培稻群体数据集,提出了配套的全基因组预测深度学习模型DeepCCR,为育种者快速、高效地培育优良品种提供了有利工具。相关研究成果在线发表在《植物生物技术杂志(PlantBiotechnologyJournal)》上。
多样性国际稻种稻瘟病抗性全基因组关联分析 广东省科学技术厅
多样性国际稻种稻瘟病抗性全基因组关联分析完成单位:广东省农业科学院植物保护研究所、国际水稻研究所(IRRI)研究人员:杨健源、BoZhou、曾列先、苏菁、汪聪颖、冯爱卿、李传瑛、韦小燕、伍圣远研究时间:2016-01-01~2018-12-31成果评价单位:广东省科学技术厅成果评价日期:2019-12-26成果应用行业:...
华中农业大学揭示水稻雄性配子发生过程表观基因组动态重编程机制
综上所述,该研究分析了水稻小孢子母细胞、小孢子和精细胞的全基因组DNA甲基化,并研究了一组染色质调节因子在此过程中的功能,揭示了DNA甲基转移酶和组蛋白去甲基化酶在mCHG重塑中的不同功能,并表明mCHG重塑对雄配子发生和受精具有重要意义。也为研究表观变异通过雄配子传递到后代的可能性提供了数据。
Science Bulletin | 商连光/钱前/王少奎联合构建水稻基因组倒位...
近日,中国农业科学院深圳农业基因组研究所联合崖州湾国家实验室、中国水稻研究所、厦门大学和华南农业大学等单位在ScienceBulletin上在线发表了题为“Widespreadinversionsshapethegeneticandphenotypicdiversityinrice”的研究论文,在泛基因组水平全面解析了水稻基因组倒位变异的多样性及其在优异基因挖掘和育种方...