质谱成像技术点亮环境毒理学研究:2024中国环境质谱大会分会场精彩...
报告题目:基于质谱的毒理糖蛋白质组学及应用基于课题组所发展的位点和结构特异性定量N-糖蛋白质组学分析方法,探索了丙烯酰胺对小鼠肝脏的N-糖蛋白质组影响。丙烯酰胺因其广泛使用及环境分布被证明具有肝毒性和致癌风险,已在毒理基因组学和蛋白质组学方面有研究,但糖蛋白的参与尚不明确。通过对丙烯酰胺处理组和对照...
离子淌度质谱全新功能:实现非变性膜蛋白复合物的Top-Down分析
首先,ED装置在质谱仪的前端将膜蛋白-配体复合物中的去垢剂去除(图3a,步骤2)。其次,用四极杆分离出蛋白质-配体复合物相对应的母离子,并使用trap碰撞池进行解离(图3a,步骤3和4)。第三步,后面的离子淌度IMS池能够分离蛋白质和配体离子(图3a,步骤5)。最后,这些经过淌度分离的离子在transfer碰撞池产生三级碎片离子...
蛋白质质谱从头测序怎么解谱
1、样品准备首先,蛋白质样品需要经过提取、纯化和浓缩等步骤。2、肽段化然后,蛋白质被酶切为较短的肽段。3、质谱测量利用质谱仪进行肽段的测量,得到质谱图。4、解谱通过解析质谱图,得到蛋白质或肽的氨基酸序列。三、解谱解谱是从头测序过程中的重要步骤。它是通过解析质谱图,获取蛋白质或肽的氨基...
Nat Commun | 结合机器学习与血浆蛋白质组质谱分析可提前7年预测...
该研究包括三个阶段:第0阶段,通过非靶向质谱法推断蛋白质组学组成,识别潜在的生物标志物;第I阶段,将来自发现阶段的候选蛋白通过靶向质谱多反应监测(MRM)方法,应用于更大的样本队列中;第II阶段,对靶向MRM方法进行改进并分析更多样本,以评估靶向蛋白质panel的临床可行性。蛋白质组学发现阶段(第0阶段)研究团队随机...
...| 突破质谱细胞术的瓶颈:ACE技术助力低丰度蛋白质检测
01NatureBiotechnology报道了一种名为循环扩增放大(ACE)的新型信号放大技术,提高了质谱细胞术在灵敏度方面的限制。02ACE技术能够在超过30种蛋白质表位上同时进行信号放大,显著提高了低丰度蛋白质的检测灵敏度。03研究团队通过悬浮质谱细胞术展示了ACE技术在表征上皮-间充质转化(EMT)和间充质-上皮转化(MET)过程中...
中国科学院过程工程研究所蛋白质组学质谱仪采购项目公开招标公告
中国科学院过程工程研究所蛋白质组学质谱仪采购项目招标项目的潜在投标人应在oitccas获取招标文件,并于2024年09月09日13点30分(北京时间)前递交投标文件(www.e993.com)2024年11月3日。一、项目基本情况项目编号:OITC-G240570350项目名称:中国科学院过程工程研究所蛋白质组学质谱仪采购项目...
高分辨质谱仪Orbitrap Astral在蛋白质组学中的应用
在本研究中,团队通过使用数据独立采集技术评估了OrbitrapAstral质谱仪在定量蛋白质组学中的性能,结果发现Astral质谱仪每单位时间定量的肽比ThermoScientificOrbitrap质谱仪(长期以来一直是高分辨率定量蛋白质组学的黄金标准)多5倍,并且OrbitrapAstral质谱仪可在宽动态范围内产生高质量的定量测量(图1)。同时,在...
Nature子刊:尹鹏团队发明质谱流式信号放大技术,大幅提高单细胞及...
题图丨Pixabay质谱流式细胞术可在数百万个单细胞中同时采样并量化分析50多种蛋白质或蛋白质修饰水平。应用质谱流式可从全新的角度判别细胞种类、细胞表型,评估其功能状态和异质性以研究疾病发生和发展的机制。然而,作为一种新兴单细胞蛋白组方法,质谱流式因其技术特性也存有一些功能上的不足之处。目前该技术最大...
2区-贵州中医药: 基于蛋白质组学和生信探究土茯苓治疗高血压的...
在质谱分析中,少于5个氨基酸的肽段产生的片段离子很小,序列鉴定不能有效。如果肽段大于20个氨基酸,则质量和电荷数较高,并且不适合于高能诱导的片段化。本研究中鉴定的所有肽都在7–20个氨基酸的范围内。它们符合胰蛋白酶水解和高能诱导的切割断裂的一般规则(补充图S1)。补充图S2显示了蛋白质的分子量和所鉴定的...
专访腾讯AI Lab姚建华、杨帆:腾讯 AI Lab 为何瞄准单细胞蛋白质组...
基于这些数据,结合AI算法,我们可以进一步推断组织蛋白组中细胞类型的比例,这对于理解肿瘤微环境至关重要。目前,临床上已有大量基于组织蛋白组的数据,这些数据通常来源于肿瘤患者癌组织及其周围正常组织的样本,通过质谱技术获得的是多种细胞类型混合后的蛋白质表达平均水平。我们的反卷积算法能够精确推断出不同细胞类型...