一张“图”,杀出重围
这里是用了图结构来表达数据,那么图数据库就是一个使用图结构进行语义查询的非关系型数据库,通过节点、边和属性这三个元素来表示和储存数据。“其实我们在日常生活中经常会用到图,例如家谱。”张睿表示,图数据库与人类的思考及存储的思维逻辑有较大相似性。相较于传统的关系型数据库,图数据库可规模化、系统性地...
他们用AI破译蛋白质结构“密码”
他们首先绘制了一种全新结构的目标蛋白质,然后从已知结构的蛋白质数据库中寻找与目标结构相似的短蛋白质片段;随后,Rosetta利用蛋白质能量图的基本知识,优化这些片段,给出了最终的氨基酸序列。此后,贝克研究小组不断发挥创意,创造出一系列富有想象力的蛋白质。这些蛋白质正在药物、疫苗、纳米材料和微型传感器等多个领域...
...给DeepMind哈萨比斯和大卫·贝克等三位,表彰蛋白质结构预测成果
不久之后DeepMind推出AlphaFold2,让相关数据库得以覆盖2亿多个结构,几乎涵盖目前已知的所有蛋白质。2023年,Hassabis被《时代》周刊评为“2023年度AI领域最有影响力100人”之一。JohnM.Jumper:用AlphaFold极大减少人工确定蛋白质结构的时间图|JohnM.Jumper(来源:诺奖官网)JohnM.Jumper是DeepMind的高级研究科...
为何诺贝尔化学奖又颁给AI?万字详解:AI重塑结构生物学
接下来,他们将所有坐标数据输入计算机中,计算机版本的蛋白质结构看上去像一片密林,她继续解释道,原子杂乱聚集在一起,只有戴上3D眼镜,才开始能看到蛋白质的拓扑结构。“整个过程非常折磨人,”桑顿说,“但结果出来后又令人愉悦。”经过年复一年的努力付出,一旦科研人员确信自己的蛋白质结构无误,他们就将数据提交给蛋...
诺贝尔化学奖是AI for Science,物理奖是Science for AI
1.数据录入和数据库搜索将一个结构未知的氨基酸序列输入AlphaFold2。系统会搜索数据库中类似的氨基酸序列和蛋白质结构。2.序列分析AI模型会对比所有相似的氨基酸序列(通常来自不同物种)。研究在进化过程中哪些部分被保留下来。AlphaFold2探索氨基酸在三维蛋白质结构中如何相互作用:...
诺贝尔化学奖也花落AI领域!刚刚,AlphaFold开发者等人获奖 | 深度...
▲AlphaFold2根据氨基酸序列预测的蛋白结构与实验手段解析的结果几乎完全重合(绿色,实验结果;蓝色,计算预测结果;图片来源:DeepMindBlog)2021年,Hassabis博士和Jumper博士与欧洲分子生物学实验室的欧洲生物信息学研究所(EMBL-EBI)合作,(AlphaFoldProteinStructureDatabase)(www.e993.com)2024年10月13日。这个数据库涵盖了人类和20种常用模式生物的35...
突破传统桎梏!上汽通用打造汽车物流新模式
图6硬件技术架构利用物联感知技术,可实现以下内容:①智能化账务交接、追溯:物联网系统与前端绑定系统对接后,可在卡车发运及道口零件接收时,第一时间对实物与运单数据进行校验,实现差异及时发现、及时预警、及时处理,将缺料、错料风险“扼杀在摇篮之中”。如图7。
MolAid化学数据库实用教程——晶体结构查询
想要看某个化合物的晶体3D模型,可以先在检索框输入化合物相关信息(cas、中英文名称、绘制结构、其他编码等),在结果列表选择目标物,再点击“物质信息”进入详情页,左侧栏选择“晶体信息”,右上角点击“查看3D结构图”即可查看化合物空间结构。部分化合物无法查看3D晶体结构图。
温州老板搞大模型,直追上海与杭州|宁波|浙江|杭州市|温州市|上海...
头图来源|视觉中国精明的温州老板,正采用一种激进的方式改造自己的事业。9月底,温州企业的领头羊正泰集团发布了一则招聘启事。招聘的岗位就是大模型负责人,薪酬为70000~95000元/月,工作内容中写着:领导大模型的训练和优化,建设数据库等,工作地点在上海。
数百万晶体数据训练、解决晶体学相位问题,深度学习方法PhAI登...
图示:相位和真实电子密度图之间的相关系数r的直方图。(来源:论文)经过训练的神经网络表现出色;如果相应的衍射数据分辨率良好,它可以解决所有测试结构(N=2387),并且在从低分辨率数据中解决结构方面表现出色。尽管神经网络几乎没有针对无机结构进行训练,但它可以完美地解决此类结构。