条形码病毒工具-解剖学和转录组学在神经结构解析中的结合
在GFAP启动子控制表达糖蛋白G和TVA的小鼠中,作者对星形胶质细胞的相互作用细胞组进行了分析,结果显示,RABID-seq可以在单细胞水平上同时识别星形胶质细胞的细胞相互作用以及相互作用转录组特征。图2利用RABID-seq重建单细胞转录组学和连接组学2022年3月16日,耶鲁大学医学院神经生物学系以及细胞与分子生理学系的助理...
几十只小鼠解剖到手麻,直到师姐打开了这个「黑盒子」(含试用)
好不容易新合成的小分子化合物体外抗肿瘤效果不错,打算用小鼠做活体实验,一合计,5个时间点5个组别,每组3只小鼠,一个实验周期下来要2个月,还要75只小鼠,每个时间点都要解剖取样。有师弟师妹帮我吗?抓不到人...有这么多钱买小鼠吗?还没开口...师弟,有没有可能,这个世界上有一种仪器叫小动...
整合多组学数据,华大图神经网络模型SpatialGlue登Nature子刊
近日,新加坡科技研究局(A*STAR)、华大基因和上海交通大学医学院附属仁济医院等组成的研究团队,提出了一种具有双注意力机制的图神经网络模型SpatialGlue,能够以空间感知的方式整合多组学数据。SpatialGlue能够有效地将多种数据模态与其各自的空间背景相结合,以揭示组织样本的组织学相关结构。研究证明,与其他方法相比,...
60多年前,他们从小鼠的脾脏中发现了传说中的细胞
蒂尔和麦卡洛克最初的研究目标是想要系统性地测量恢复经辐照小鼠的血细胞需要多少骨髓细胞。图片来源:123RF在给经辐照小鼠移植不同数量的骨髓细胞后,他们发现了一些很有趣的现象。麦卡洛克在小鼠接受骨髓移植10天后对其进行了解剖。眼尖的他发现,小鼠的脾脏上出现了几个圆形结节,这些结节里含有血液中的三种主要细胞成...
Nature连发10篇,揭示迄今最全小鼠完整大脑细胞图谱
研究采用了不同但互补的方法,将新开发的空间转录组学技术Slide-seq与高通量单核RNA测序相结合,以440万个10微米像素的分辨率量化全基因组表达,使细胞类型能够系统地定位到单个大脑区域(图5)。这揭示了小鼠全脑各个解剖结构中的细胞类型组成,包括过去关注较少的中脑、脑桥、延髓和下丘脑。研究人员估计,分析已涵盖小鼠...
科学家建立小鼠全脑甲基化和三维基因组图谱,为大脑提供分子“百科...
在该研究中,研究人员还通过单细胞多组学测序技术,在同一细胞测甲基化的同时,还检测了三维基因组结构或RNA等多种不同的信息(www.e993.com)2024年11月20日。最终,通过覆盖成年小鼠大脑的117个解剖区域,建立301626个甲基化组以及176003个染色质构象/甲基化联合图谱。“各种表观遗传学信息代表着基因的调控,而RNA代表了基因的表达,这些...
《自然》集中发表系列神经科学论文:小鼠完整大脑详细图谱完成
左上-基于解剖脑区的小鼠大脑的3D效果图;左下-不同脑区标志为不同颜色的小鼠大脑3D效果图;右上右下-小鼠大脑的垂直切片,不同颜色代表不同细胞类型,圆圈代表根据表观基因组分析在小鼠大脑中发现的细胞类型的数量和多样性(图片来自索尔克研究所)。施普林格·自然供图...
Nature连发10篇论文:曾红葵/庄小威/何志刚/任兵/王潇等绘制小鼠...
将MERFISH衍生的细胞图谱对应到艾伦小鼠大脑共同坐标框架中,可以系统地量化每个大脑区域和解剖结构中的细胞类型组成和组织。转录组学细胞类型的全面空间分布,使我们能够描绘出超过100个分子上定义的大脑区域,并识别许多大脑区域的空间梯度。将MERFISH和scRNA-seq数据集成,进一步允许在整个转录组尺度(>20000基因)上对每个...
不再受限于选定区域,迄今最完整小鼠大脑图谱创建|总编辑圈点
左上??基于解剖脑区的小鼠大脑的3D效果图;左下??不同脑区标志为不同颜色的小鼠大脑3D效果图;右上右下??小鼠大脑的垂直切片。图片来源:《自然》科技日报记者??张梦然《自然》13日发表了一系列来自脑科学计划-细胞普查联盟(BICCN)的论文,报告了迄今为止最为全面详细的小鼠完整大脑细胞类型的特性描述和分类。
Nat Neurosci:少突胶质细胞调控髓鞘再生的新机制
电镜(EM)超微结构分析显示,DORcKO小鼠的视神经和胼胝体中轴突包覆严重受损,髓鞘化轴突数量减少,髓鞘厚度降低。轴突数量或轴突直径分布没有显著差异。与对照组相比,DORcKO小鼠皮层中GSTπ阳性和OLIG2阳性少突胶质细胞谱系细胞的频率较低,并且视神经中存在脱髓鞘表型,表明DORcKO小鼠的少突胶质细胞髓鞘形成缺陷持续到...