...学院蔡华珍教授等:多频复合超声真空煮制对卤牛肉肌纤维结构及...
2多频复合超声辅助真空煮制对牛肉蛋白质二级结构的影响蛋白质二级结构是多肽链通过氢键沿一定方向盘旋、折叠而形成有规则的重复构象,包括α-螺旋、β-折叠、β-转角和无规卷曲结构。由图2可知,各处理组牛肉肌原纤维蛋白质在波长208nm和222nm附近有两个强负吸收峰,这是α-螺旋结构的特征吸收峰,该特征吸收峰...
分子之心完成数亿A轮融资 将完善AI蛋白质基础大模型等生物领域新...
结构、功能和进化的产业级AI蛋白质生成大模型NewOrigin(达尔文)、精度超越AlphaFold3的复合物结构预测算法,全球首创的可同时用于蛋白质侧链预测与序列设计的算法等,相关成果多次发表于SCIENCE杂志、美国科学院院刊等核心期刊,获得首届国际基础科学大会前沿突破奖等荣誉。
谷歌DeepMind再放大招!AlphaProteo直接设计全新结合蛋白,加速药物...
时隔三年,谷歌DeepMind在Nature发表论文,推出了AlphaFold3,让我们得以冲破「蛋白质宇宙」,实现对所有生物分子结构的预测。这次使用的,还是AI革命最核心的组合架构——Transformer+Diffusion。最近,DeepMind又放大招——推出了用于设计和生成全新蛋白质的人工智能模型——AlphaProteo,其能够为多种目标蛋白设计和生成全新的高...
Nature | 蛋白质测序技术突破:PASTOR单分子水平精准解读蛋白质...
研究开发了一种基于纳米孔(nanopore)和解折酶ClpX的蛋白质测序技术——PASTOR(ProteinAnnotationbySingle-moleculeTranslocationandOverwriting),其核心在于通过纳米孔读取单分子蛋白质链的电流信号,并结合机器学习和物理建模技术实现蛋白质序列的精准测序。研究通过设计特殊的蛋白质结构块(每块59个氨基酸)并引入单个氨...
河南科技大学罗登林教授等:热处理对荞麦麸皮蛋白结构与理化特性
由图2B可知,未经过热处理的SPI、TBBP与CBBP中二级结构的主要组成为相对稳定的α-螺旋与β-折叠结构,两者结构总占比可衡量蛋白质的稳定性,TBBP与CBBP中α-螺旋和β-折叠结构所占总比例相近(分别为66.95%和67.84%),均低于SPI(68.30%),表明制备的荞麦麸皮蛋白二级结构的稳定性低于SPI。经热处理后,SPI-G、TBBP-G与...
基于几何图学习的物理系统建模:从动态系统到复杂系统
静态复杂系统一个明显例子是对蛋白质结构进行建模,代表性的模型有AlphaFold,RoseTTAFold等等;动态系统则是研究某种分子/粒子的轨迹,或者对其动态特性进行研究,如分子动力学模拟(www.e993.com)2024年9月16日。当然,这个划分只是为了方便研究,在真实场景下是二者皆有的,比如对蛋白动态对接的过程进行研究,这既要对蛋白结构进行建模(静态),也要对分子...
国内首家!独特结构的弹性蛋白出现了!
近年来,重组胶原蛋白不仅是最炙手可热的赛道之一,亦是万众瞩目的市场新星。据公开数据,2023年重组胶原蛋白市场规模达188.2亿元。尽管发展速度惊人,但当前国内外重组胶原蛋白行业主要以生产胶原蛋白片段为主,全结构、高活性功能性蛋白的研发与生产依然面临种种挑战,这也引发了行业在产品结构、活性、功效和应用方面的激烈...
Nat Commun︱国家蛋白质科学中心(北京)人工智能研究团队基于深度...
“模拟敲除”探索去泛素化酶-底物相互作用的结构基础蛋白质之间的相互作用往往由特定结构域和motif介导。作者基于TransDSI模型发展了一个可解释性模块,通过观察敲除特定序列片段对“TransDSI分数”的影响,在预测去泛素化酶-底物相互作用的同时推测决定相互作用的关键区域(图3a)。
清华大学药学院学者开发基于蛋白质语言模型的结构与功能预测方法
蛋白质语言模型,通过对大量序列的自监督学习,能够捕捉到氨基酸残基之间复杂的相互作用和模式。这些模型不仅能够预测蛋白质的三维结构,还能够揭示其功能和动态特性,并展现出优于经典计算生物学方法的表现。田博学课题组开发了一系列的基于蛋白质语言模型的方法,在抗体结构、蛋白质与DNA结合位点、细胞色素450酶活性预测等工作...
蛋白质质谱分析:多肽结构鉴定的新视角
质谱图谱是蛋白质质谱分析的结果,它是一种图形化的表示方式,可以显示蛋白质的质量和相对丰度。质谱图谱可以通过质谱仪进行生成,并通过数据处理软件进行分析和解读。2.3数据库搜索数据库搜索是蛋白质质谱分析的重要步骤,它通过将质谱图谱与已知的蛋白质数据库进行比对,从而确定蛋白质的身份。数据库搜索可以帮助我们鉴...