Cell Systems:饮食调控生物计算机,开启内源基因逻辑运算新篇章
最后,在“第二层楼”之上安装能够调控内源基因的功能性转录因子,通过激活相应基因来“打开开关”,或者通过抑制基因来“关闭开关”,从而精准控制基因的状态和表达量,完成这座“积木楼”的顶层建设。这个过程不仅展现了科学创造力,也为基因调控领域开启了全新的大门。REPACRISPR不仅能执行基本逻辑运算,如与门、或门和非...
...利用单细胞染色质可及性图谱揭示原发性人类癌症中的恶性调控程序
癌症基因组图谱(TCGA)旨在了解与这些基因突变相关的多种分子特征,以及驱动不同癌症类型表型的相关基因调控变化。一种识别与基因表达相关的调控元件和反式因子的方法是利用转座酶可接触染色质测序(ATAC-seq)绘制染色质可及性图谱,其中ATAC-seq可识别基因组中被转录因子(TF)和聚合酶等调控蛋白主动结合的部分。虽然TCG...
水平旋转仪(脱色摇床,RPR梅毒振荡器)在基因组学中有哪些应用
在梅毒抗体检测实验中,使用梅毒水平旋转摇床(数显梅毒旋转仪、水平旋转仪)时,需要注意以下细节以确保实验的准确性和安全性:特别声明:以上内容(如有图片或视频亦包括在内)为自媒体平台“网易号”用户上传并发布,本平台仅提供信息存储服务。Notice:Thecontentabove(includingthepicturesandvideosifany)is...
...RNA聚合酶Pol V转录产物在调控基因表达和植物抗病虫中的全新功能
这些结果表明,PolV可通过独立于RdDM通路的方式调控基因表达和植物对病虫的抗性。图二:polv突变体对灰霉和甜菜夜蛾的抗性下降该研究进一步探索了PolV如何调控基因表达。通过系统分析,鉴定了13000多个PolV转录本(PVT),并发现近一半受PolV调控的基因附近存在PVT。为了验证PVT是否可以直接调控邻近基因表达,该研究...
...浙江大学邵佳伟等设计用于细胞智能计算的三态门基因表达调控系统
当B输入连接畅通时,电路由原有输入信号A控制,输出0或1,否则输出为高阻抗状态“Z”(图2)。利用多重三态门构建复杂电路时,可以保证多模块的灵活连接,同时确保信号传递的速度和效率。研究发现,细胞基因表达调控可抽象为三态门模式。例如从DNA经转录、翻译到最终生成蛋白的过程,转录调控(B)可以作为翻译调控(A)的上游...
CRISPRa与单细胞RNA测序:细胞调节模式的深度解析
一种新方法将多重基于CRISPR的基因激活(CRISPRa)与单细胞RNA测序(sc-RNA-seq)相结合,以识别以细胞类型特异性方式控制基因表达的顺式调节元件(www.e993.com)2024年10月19日。美国研究人员将这种新方法应用于慢性粒细胞白血病细胞(K562)和iPSC衍生的兴奋性神经元,揭示了细胞类型之间的不同调节模式。
...西安交大科研人员建立关节炎滑膜组织基因表达调控图谱揭示关节...
关节炎是一种常见的关节病变,主要表现为滑膜增生、软骨变性及软骨下骨增生,造成关节功能丧失和生活质量下降,在60岁以上人群发病率超过50%,全球范围内有数亿人受到影响。全基因组关联研究(Genome-wideassociationstudy,GWAS)已鉴定数百个与关节炎相关的风险变异,但90%以上位于基因组非编码区,其调控功能和致病机制...
不改变DNA序列即可实现精准基因调控,一文了解表观遗传编辑技术的...
表观遗传学指的是一种可逆的遗传机制,它可以在不改变DNA序列的情况下,通过对DNA与组蛋白(histone)的修饰来影响基因表达,这是控制细胞分化和胚胎发育等关键生物过程的重要机制。在不同类型的表观遗传修饰当中,DNA甲基化(methylation)是其中最被广为研究的机制之一。基因启动子区域上的特定DNA甲基化会抑制该基因的转录...
华中农业大学揭示水稻雄性配子发生过程表观基因组动态重编程机制
核心提示:研究结果表明,水稻DNA甲基化在雄配子发生过程中存在动态重编程现象,直接影响雄配子发育相关基因表达和生殖,并发现一组表观调控因子在此过程中具有特异的功能。该研究为解析水稻生殖发育基因组重编程和植物表观遗传修饰的跨代遗传机制具有重要意义。
QB | 吉林大学孙慧妍副教授团队提出基于因果结构发现推断基因调控...
高通量技术的发展产生了大量的组学数据,为挖掘基因之间的调控关系提供了重要基础,目前已有许多方法利用基因表达数据推断调控网络。由于调控机制本质上是一种因果关系,本文作者提出一种基于成对因果结构发现的GRN推理框架GRINCD(图1),该方法结合图表示学习和因果不对称学习,获得节点在系统中的嵌入特征,进而通过应用加性...