医学1区 | 中药单体木犀草素靶向降解Uroc1蛋白解除小鼠DEHP毒性并...

为了研究介导反式uca信号的信号通路,我们使用小鼠肝细胞样本进行了无标记的蛋白质组学分析,这些肝细胞样本经DEHP处理12h,然后在没有DEHP的情况下再用反式uca或PBS处理12h(图6A)。以P<0.05且差异倍数≥2为标准筛选出差异表达蛋白。经反式uca处理后,共有76个蛋白质发生改变,其中27个上调,49个下调(图6B)。

农林1区Food Chemistry: 广东农科院以广靶代谢组学揭示乌龙茶加工...

更具体地说,根据正交偏最小二乘判别分析(OPLS-DA)模型中变量重要性投影(VIP≥1)以及单变量统计分析中差异倍数(FC)≥2或差异倍数≤0.5的原则,我们筛选出564种显著差异代谢物,其中比例最高的是黄酮类化合物(22.87%),其次是酚酸(20.21%)和氨基酸及其衍生物(7.62%)(见图3A)。在差异代谢物中,有43种与味...

Nature新成果|基于深度学习的糖肽碎片质谱预测

目前,基于深度学习的方法已经在蛋白质组学当中得到了应用,可以预测蛋白酶酶切效率的可检测性,保留时间,离子淌度质谱中的碰撞截面积,MS/MS中的碎片离子强度,以及翻译后修饰的位点。预测谱库可以直接由蛋白质序列信息生成,并且基于特征评分模型已经可以区分真实信号和噪音。但是目前的方法仍旧无法预测完整糖肽的碎片谱图。

iMeta | 吴松锋/李京丽/朱云平-联合开发在线蛋白质组数据分析平台

例如,在火山图分析中,我们包括了两种蛋白质标记方法:1.根据上传文件中指定的标记列自定义蛋白质标记;2.基于p值和差异倍数变化阈值的批量标记。类似地,在箱线图分析中,用户可以选择是否在不同组之间添加假设测试标签。我们还设计了自定义选项,允许用户选择性地添加特定组比较的假设测试标签(例如,仅注释显著结果或...

iMeta | 北大深圳医院桂耀庭组揭示弱精子症患者精浆微生态的动态...

在此过程中,AZS患者精浆中6种菌属(Pseudomonas,Serratia,Methylobacterium-Methylorubrum,Uruburuella,Vibrio,Pseudoalteromonas)的动态变化,可能导致精浆中hexadecanamide含量的降低,进而诱发精子活力的下降,这种活力的降低与精子中两种关键蛋白质(PAOX和CA2)的下调密切相关。

丙戊酸钠与纤维蛋白原-从临床到基础

图8VPA处理原代人肝脏细胞后出凝血相关基因的mRNA表达差异火山图(VPA-5dayVSControl-5day)图9VPA处理原代人肝脏细胞后Fib编码基因的FGA、FGB、FGG的mRNA表达差异倍数图GSE84150表达谱数据显示:VPA处理原代人肝脏细胞后出凝血相关基因的mRNA表达与GSE109140较一致,多数凝血因子的mRNA表达呈下降趋势,其中VPA处理...

《食品科学》:信阳农林学院郭桂义教授等:基于非靶向代谢组学的...

代谢组学是继基因组学、转录组学和蛋白质组学之后的一种新兴科学技术,一般来说,研究的对象是相对分子质量在1000以下的小分子化合物,研究手段涵盖了核磁共振技术、气相色谱-质谱(GC-MS)联用技术和液相色谱-质谱(LC-MS)联用技术。目前非靶向代谢组学被广泛应用到茶叶的研究中,为全面深入地了解茶叶提供了有力帮助...

从羊水中可成功构建胎儿上皮类器官,探索先天疾病的新前沿!

i,火山图展示了CDH类器官与胎龄匹配对照在FETO前后的差异表达基因(DEGs)。显著的(P<0.01)肺相关标志物已标记。蓝色点表示统计学上显著下调的基因,红色点表示统计学上显著上调基因。LFC,对数倍数变化。j,免疫荧光染色显示CDH类器官在FETO前后的前表面活性蛋白C(proSFTPC)(比例尺,50??μm)。k,透射电子显微镜(...

苏州昊帆生物股份有限公司

由于分子砌块的使用贯穿新药研发的全生命周期,其重复使用属性使得后期分子砌块用量呈倍数级增长,随着公司分子砌块数量的增长,分子砌块对公司收入的贡献将逐步提高。公司亦是蛋白质交联剂市场的有力竞争者,建立了涵盖大量双官能团连接体的蛋白质交联剂化合物库,现有蛋白质交联剂细分产品70余种。此外,公司的脂质体与脂质...

(上接D50版)上海盟科药业股份有限公司 关于部分募集资金投资项目...

四环素与细菌的核糖体结合,从而干扰细菌蛋白质的翻译来发挥抗菌药的作用,其外排泵蛋白和降解酶的出现使得细菌对四环素类抗菌药产生耐药性。且四环素耐药基因通过质粒传播,因而分布非常广泛。四环素耐药基因又可以分为四环素外排基因、核糖体保护蛋白基因和使四环素失去活性的氧化还原酶基因。其中前两种机制为主要因素。目前...