FSHW | 微冻结合气调包装卵形鲳鲹鱼片品质相关蛋白分析研究

此外,皮质蛋白附着在肌动蛋白丝上,有效地控制了肌动蛋白的稳定性和结合并大大减缓了肌动蛋白丝的解聚,含有77个氨基酸的邻近连接体可以增加皮质蛋白重复区与肌动蛋白结合的亲和力。胶原蛋白是细胞外基质中的一类纤维性大分子蛋白。根据不同的胶原多肽链,它被分为许多不同的胶原类型,最常见的是I型、Ⅱ型和Ⅲ型,属...

上海交大周冰心博士:锚定稀缺生物数据挑战,图神经网络重塑蛋白质...

第一个工作,在突变任务预测上,如下图所示,我们曾使用等变图神经网络去刻画蛋白质氨基酸的内部空间关系,其中每个节点代表一个氨基酸,在点位上表示该氨基酸的类型、理化性质等特征,图上的边连接体现氨基酸之间的相互关系,比如共同进化潜力与互相作用力影响。随后,我们使用预测模型给不同的突变体打分,并识别出最有可能优...

浙大细胞“黑客”技术登上《科学》:改写氨基酸“代码”,创造全新...

每个密码子由3个碱基组成,A、C、U、G四种碱基按不同的排列组合方式形成了64个密码子,其中61个对应编码了20种天然氨基酸,还有3个意味着终止符。这张密码子表是几乎所有生物都通用的“单词表”,从细菌到大象、从爬虫到人类,都用这20个氨基酸“单词”。一个个氨基酸连接起来,再加上“句号”,就形成了蛋白质“句子...

基于微环境感知图神经网络构建指导蛋白质定向进化的通用人工智能

对于结构数据来说,另一种方式是针对性地设计等变神经网络,把蛋白质图的节点特征、连接方式、以及三维坐标都输入进模型,通过一系列具有等变性的信息传导网络层,对数据特征进行提取与更新。另外,为了进一步利用生物学的先验信息来提高模型的泛化性和表达能力,作者还采取了三个额外的措施,包括:对输入的氨基酸类型进行加...

ICML 2024 | 知识感知的强化学习优化的蛋白质定向进化方法

一、方法首先,我们根据氨基酸的性质构建了氨基酸的知识图,捕获了氨基酸之间复杂和相互关联的关系。在此基础上,我们提出了一种知识感知策略,通过AAKG上的优先随机游走来预测突变位点和类型。最后,奖励模型(即突变体的适应度预测器)提供了对KAP的反馈。我们以主动学习的方式优化KnowRLM,识别的突变体由预言机注释并用...

“黑客”系统让非天然氨基酸“入编”

“设计药物、研究机理、探索新的生命形式(www.e993.com)2024年11月16日。”谈及稀有密码子重编码技术的应用场景,林世贤不假思索地说道。当非天然氨基酸可以高效进入蛋白质一级结构时,意味着科学家在设计蛋白质分子时获得了一个崭新的维度,可以更自由地引入特定功能氨基酸,设计更多非天然氨基酸药物。“这是我未来几年最感兴趣的方向。”林世贤说,...

江小涓最新文章:数据、数据关系与数字时代的创新范式(1.7万字)

进入21世纪,以互联网、大数据、人工智能为代表的数字技术带来数据生成、传递和处理能力的极大提升,数据关系重新定义创新链条上各方的交互方式和地位作用,创新要素、创新主体、创新过程和创新组织等方面发生重要改变,这些改变导致数字时代的创新范式呈现出数据和数据关系驱动的新形态。科技界对于大数据带来的科学价值早有探...

东北农业大学刘飞教授等:益生菌及其代谢产物调控胰高血糖素样肽-1

东北农业大学食品学院的程之梁、刘飞*,黑龙江中医药大学药物安全性评价中心的焦月华*等以益生菌及其代谢产物为主线,介绍GLP-1与T2DM之间的关系、GLP-1缓解T2DM的局限性与改进方法以及通过相关益生元对GLP-1的调控以缓解T2DM症状,总结益生菌及其代谢产物对GLP-1的调控,从相关的代谢产物介绍缓解机制,可以为今后缓解以...

诺贝尔化学奖是AI for Science,物理奖是Science for AI

氨基酸首先以“串珠子”的方式连接成一条链(STRINGOFAMINOACIDS);这条氨基酸链最终会折叠成特定的三维结构,形成功能性蛋白质(PROTEIN);这张图很好地诠释了2024年诺贝尔化学奖的两个核心发现:如何利用这20种氨基酸设计新的蛋白质(DavidBaker的工作);...

微源实验室针对胰高血糖素样肽1GLP-1类似物的杂质研究

故通过以GLP-1为中间体,通过结构修饰[2]、氨基酸序列改造等方式以延长半衰期[3],出现了利拉鲁肽、阿必鲁肽、杜拉鲁肽、索马鲁肽等药物,在糖尿病领域效果显著。其中脂肪酸的共价连接,称为酰化,被广泛用于控制治疗肽的半衰期。比如地特胰岛素,B链30号位点的苏氨酸去除并在29号位点的赖氨酸添加了一个十四碳脂肪...