Nat Commun丨张勇与阮珏团队合作开发低DNA用量、无扩增的PacBio...
与PacBio公司的标准建库和低DNA扩增建库方法不同(Genes2019;GenomeBiol2021),LILAP无需特殊实验仪器,所有试剂均可在第三方公司购买,建库成本降至每个样品10美元。同时,测序接头内还可添加条形码(barcode),用于多样本混合建库测序(GenomeBiol2010)。图1.LILAP测序技术原理示意图(Credit:NatureCommunications)研...
测序仪笔记分享(万字长文,建议收藏)
·DNA测序:基于Sanger法的原理,利用DNA聚合酶在体外DNA复制过程中随机掺入带有荧光标记和终止子的双脱氧核苷酸(ddNTPs),从而得到不同长度的DNA片段。这些片段经过电泳分离后,通过激光激发和CCD检测,得到每个碱基发出的荧光信号,从而确定DNA的碱基序列。·片段分析:基于荧光检测的原理,利用不同颜色的荧光染料标记不同...
存放几十年老样本重见天日:科学家研发单细胞DNA测序法,可用于研究...
近日,他和合作者研发一款高通量单细胞DNA测序方法——“Arc-well”。这是第一个能对福尔马林固定石蜡包埋(FFPE,Formalin-FixedParaffin-Embedded)组织进行测序的方法,能同时对数千个细胞进行基因拷贝数进行分析,填补了利用单细胞DNA测序对FFPE样本进行大规模基因组分析的空白,使得存放几十年的FFPE样本得以...
常用PCR技术及原理
探针法(常用TaqMan探针):探针完整时,报告基团发射的荧光信号被淬灭基团吸收;PCR扩增时,Taq酶的5’-3’外切酶活性将探针酶切降解,使报告荧光基团和淬灭荧光基团分离,从而荧光监测系统可接收到荧光信号,即每扩增一条DNA链,就有一个荧光分子形成,实现了荧光信号的累积与PCR产物的形成完全同步。图4.染料法原理图5....
...本文系统总结常见测序仪的原理和主机结构,并介绍相关测序原理...
一.测序仪对比1.ABI3730xlDNAAnalyzer图源自thermofisher官网1.1.相关原理·DNA测序:基于Sanger法的原理,利用DNA聚合酶在体外DNA复制过程中随机掺入带有荧光标记和终止子的双脱氧核苷酸(ddNTPs),从而得到不同长度的DNA片段。这些片段经过电泳分离后,通过激光激发和CCD检测,得到每个碱基发出的荧光信号,从...
湛江阅读 | DNA鉴定技术:验血非亲生,全靠DNA还原真相!
第四步:毛细管测序仪检测由于DNA带有电荷,通过毛细管电泳的方法,不同片段DNA长度的电泳速度不同,在同样的电压,同样的电泳时间下,泳动的距离不同,这些长短不同的距离可以通过前期加入的内标测量分辨出来,同时可通过一定的软件显示在电脑上,方便检测人员处理和分析数据(www.e993.com)2024年7月28日。
scNanoCOOL-seq: 单细胞多组学测序技术的新里程
??可以检测具有结构变异(SVs)的基因组区域。??可以提供在单个细胞内分析等位基因特异性表观遗传状态的机会。scNanoCOOL-seq技术整合了三代测序平台的优势和scCOOL-seq原理,为科研人员提供了一种前所未有的单细胞多组学测序方法。这一创新性的方法有望推动对单细胞内表观基因组与转录组互动关系的深入研究,为科学...
【陈巍学基因】视频:对全基因组甲基化和全基因组序列进行同步测序
我们先讲第一部分,5字母测序的原理。作者把这种既可以测到DNA链上的甲基化信息,又可以测到DNA链原来碱基序列的建库测序方法,称为“5字母测序”,five-letterseq。我们先来讲这种测序方法的原理。把要检测的DNA链的片段两端补平,连上发夹型的接头,接头上有U碱基。
从基因组学到多组学,纳米孔测序还可以做更多?
齐碳科技首席科学家白净卫博士图片来源:受访者供图纳米孔测序法采用完全有别于二代测序技术的理化方法。在基因测序的过程中,纳米孔测序利用核酸带有电荷的物理属性,在接通电源的溶液中,引导被测序物质穿过薄膜上纳米尺度的孔洞,造成孔内离子电流变化。由于ATCG碱基结构不同,穿过孔洞时产生的离子电流变化会存在...
93万年前人类祖先曾有一次大灭绝?中国团队领衔新创的全基因组分析...
研究成果照片。图片左侧展示了群体历史估计新方法的核心公式;右侧岩画描绘了人类祖先在远古的群体瓶颈时期,团结起来共同面对未知的风险。中国科学院上海营养与健康研究所供图对古人类群体进行“人口普查”“如果说古DNA提取和分析是一把枪,精准击中了人类近十万年的溯祖研究,那么我们就想造一把新枪,用以解决百万年...