...MetaSVs:结合长、短reads用于宏基因组结构变异分析和可视化流程
再加上数以百万计的测序数据被用作源输入,许多分析步骤,如序列比对,基因组组装和bins(high‐qualitydraftgenomes)分箱,既耗时又参数繁重,急需一个高效,可追溯而且灵活的工作流程。在这里,我们已经建立了一个集成的流程MetaSVs,用于微生物组SVs分析,使用ONT长reads和Illumina短reads的混合数据来综合分析宏基因组SVs...
青元开物全自动基因测序文库构建助力呼吸道感染诊断
富集纯化后的文库,通过质控、均一化及pooling后可上机illumina测序。4)数据分析测序数据经过数据质控后,进行结果分析。2.实验结果扩增子文库构建流程可以通过EoSBot??Seq24全自动基因测序文库工作站实现全自动化,工作站配置三个移液器,一个8通道(20微升)、一个8通道(200微升)和一个24通道(500微升),工作站...
行研|分子诊断系列:Sanger测序基因分析仪更广阔市场蓄势待发
第三代基因测序技术也叫从头测序技术，即单分子实时DNA测序。DNA测序时，不需要经过PCR扩增，实现了对每一条DNA分子的单独测序。单分子实时荧光测序技术，应用了边合成边测序的思想，并以SMRT芯片为测序载体，芯片上有很多小孔，每个孔中均有DNA聚合酶。测序基本原理是：DNA聚合酶和模板结合，4色荧光标记4种碱基（即...
Nature 重磅,65w 超大样本量全外显子测序突破性研究
在多个外显子组panel中保留IlluminaDNAPrepwithEnrichment的工作流程和数据质量优势。利用XLEAP-SBS化学技术实现深入探索XLEAP-SBS化学技术,是Illumina迄今为止最快、数据质量最高、最可靠的测序化学技术,在2×100bp时,该测序仪可实现出色的准确率,可做到≥85%的碱基分值高于Q30??(...
一种集成式、高效的外显子组测序方案
图1:NextSeq1000/2000外显子组测序工作流程——一种简单的集成式NGS测序方案,可提供高度准确的外显子组测序数据。工作时间因实验和检测类型而异。NextSeq1000/2000外显子组测序解决方案提供了简化的集成式工作流程,使研究人员能够大幅提高工作效率。首先使用文库试剂盒(如IlluminaDNAPrepwithExome2.5...
万众一芯:小型化半导体测序仪更适合tNGS大规模临床应用
万众一芯致力于开发基于半导体基因芯片的快速、经济、精准的测序仪平台,该系统可以在5小时内完成全部测序流程,一次测序的开机成本可降到数百元(www.e993.com)2024年11月18日。这款半导体基因测序仪ATGCMICRO,基于SBS原理,搭载自主研发的高灵敏度半导体电子基因芯片,在半导体基因测序芯片上自动完成测序模板富集和测序,通过识别核酸延伸过程中释放的离子信...
Nat Methods | 克服PCR扩增误差:利用同源三聚体核苷酸提高测序...
不同的测序技术,如Illumina、PacBio和OxfordNanopore等,因其独特的测序原理和数据输出特性,对UMI的准确性和应用效果有着不同的要求和影响。因此,针对不同测序平台优化UMI的设计和数据处理流程是实现高准确度测序的关键。该研究在Illumina、PacBio和OxfordNanopore等不同测序平台上进行了广泛测试。结果显示,无论是短...
吴文娟教授:基于临床评估的真菌检测和病原学诊断……从真菌感染...
最近mNGS取得了新的进展,例如:缩短周转时间,减少外源性污染,改进工作流程和提高敏感性。基于第二代测序的Illumina测序法对真菌的检测敏感性和特异性分别为91%和89%;基于第三代测序的纳米孔测序法对真菌的检测敏感性和特异性分别为91%和100%[29]。国际上,去年发表的这篇文章回顾了与新冠病毒相关的肺曲霉病病例。
Illumina测序系列丨Illumina 文库制备原理
本期,我们来熟悉Illumina平台的文库制备原理!本期学习目标??了解两种全基因组文库构建方法:机械法(超声)打断和酶法打断??了解Illumina超声打断法文库制备试剂盒TruSeqDNAPCR-free和TruSeqNanoDNA的操作流程和区别??了解Illumina酶打断法文库制备试剂盒NexteraXT和NexteraDNAFlex的操作流程和区别...
测序技术的一些原理理解(sanger测序与illumina测序)
illumina测序illumina是二代测序的“代表人物”,下面讲一讲PE测序(双末端测序)的原理。首先要知道一些二代测序的一些基本概念:在一个flowcell上一般有2个或者8个line,每个line被分成两列,每列大概有60个tile,而tile是荧光扫描时的最小单位,每个tile在每次循环的时候会被扫描4次,A,T,C,G各一次,下面讲具体过程...