利用DNA和RNA测序组合方法鉴定非小细胞肺癌靶向治疗的基因变异特征
注:图1A.覆盖前述所有驱动基因的DNA组测序(769个基因)用于EGFR、KRAS、HER2和BRAF基因的SNV/indel检测;图1B.MET和HER2基因的CNV;图1A,B.NSCLC队列中EGFR的SNV/indel数为201例(52.1%),MET的CNV数为16例(4.1%);图1C.通过DNA和RNA面板测序检测ALK、ROS1、RET、NTRK和METex14的基因融合。02...
RNA和DNA测序助力儿童淋巴瘤精准诊疗,结合案例分析
在某些情况下,通过IG/TR基因靶向DNA测序进行克隆性评估可以提供额外的关键信息,例如,关于不同病变之间的克隆关系(如病例1)或区分新淋巴瘤和疾病复发。相同的克隆型信息也可以用于开发用于播散性疾病定量的分子检测,这在我中心正越来越多地实施。在较小的医院和资源较少的国家,本研究提出的工作流程可能较难实施,但即...
Nature重磅综述 |关于RNA-seq,你想知道的都在这
现在的RNA-seq更常用于分析差异基因(DGE,differentialgeneexpression),而从得到差异基因表达矩阵,该标准工作流程的基本分析步骤一直是没有太大变化:始于湿实验,提取RNA,富集mRNA或消除rRNA,合成cDNA和构建测序文库。然后在高通量平台(通常是Illumina)上进行测序,每个样本测序reads深度为10-30Millionreads。早期...
解决方案 | 感染高发,病原NGS检测全流程原料解决方案助力更快更准...
UDF(dU-mediateddouble-strandDNAfragmentation)是Vazyme开发的一款新型防污染技术。先通过在PCR过程中添加一定量的dUTP,对PCR产物进行dU标记,在新一轮PCR开始前,用UDF复合酶处理体系中存在的含dU的非目标片段,UDF复合酶可令经dU标记的PCR产物在dU位置形成双链DNA断裂,避免了处理后的片段被修复的可能性。新升级...
基于宏基因组二代测序快速诊断儿童人细小病毒B19脑膜炎
进一步通过传统PCR扩增法以HPVB19特异性基因片段设计引物进行特异性扩增并将扩增产物利用二代测序技术进行测序比对,与HPVB19基因片段完全匹配(见图4和图5)。Lane1:50bpDNALadder;Lane2~5:HPVB19;Lane6~7:β-Actin;Lane8:DL2000图4PCR特异性扩增HPVB19基因片段...
病原靶向测序(tNGS)——一种快速崛起的感染性疾病诊断方法
tNGS实验流程基本包括以下四步:1、样本总核酸提取(包括人的核酸,致病菌,定植菌核酸等);2、富集目标病原体的核酸;3、通过高通量测序平台,获得靶向捕获后核酸的序列信息;4、数据分析(www.e993.com)2024年10月19日。现在市场上常见的tNGS产品大同小异,主要区别在于富集目标病原体核酸所采用的的方法,常见的有两种:...
算力+存力:优化基因测序的关键所在
基因测序流程的三大分析阶段基因测序全流程由三个分析阶段组成,下图揭示了从测试样本到最终生成解读报告的大体流程:一级分析:将需要进行测序的生物样本送入基因测序仪中,由测序仪进行WGS(全基因组测序)、WES(外显子测序)等测序操作,测序结果输出到可用于计算机进行分析的FASTQ文件中。FASTQ文件类似一个文本文件,每...
立足原始创新,普译生物推出PolyseqOne纳米孔基因测序系统
其中通用型DNA建库试剂盒可进行DNA样本以及PCR扩增产物的单样本建库测序。而快速DNA建库试剂盒(PY-DNA201)利用自主开发的转座酶系统&优化的缓冲体系,仅需15分钟即可完成DNA片段化和测序接头连接过程,显著缩短建库时间,并可获得良好的测序质量。配合快速建库试剂盒,15分钟完成样品核酸提取、15分钟进行快速建库、30分钟...
全自动基因测序文库制备系统 测序仪-青元开物-新品
全面的防污染及充足的台面板位,可同时满足测序文库构建及靶向捕获的过程。重复定位精度高、移液重复性高,有效减少人为误差,从而提升建库反应的重复性及一致性,提高测序检测质量、简化运行程序、降低实验成本并改善实验室管理效率。应用方向科研服务——DNA测序建库、RNA测序建库...
基因测序技术在海关系统应用前景与展望
3.移动化和便携性:在口岸现场及户外等场合,海关需要便携、移动式的基因测序设备,以便于随时进行检测和监测。4.快速分析能力:在特殊情况下,如疫情爆发或食品安全事件,海关需要具备快速响应的能力,因此基因测序仪需要更快的下机时间、更简化的操作流程和更快的数据分析速度。