华大集团两款纳米孔基因测序仪全球首发,给世界更好的选择
向全球发布最新测序技术——CycloneSEQ测序技术,两款小而美、小而优,拥有自主产权的新型基因测序仪——纳米孔测序仪CycloneSEQ-WT02(以下简称“WT02”,中文名“梧桐”)、CycloneSEQ-WY01(以下简称“WY01”,中文名“五岳”)首次呈现在世人面前。
全读长时代到来!华大成全球唯一拥有三种不同技术路径测序仪的机构
2024年9月9日,作为全球领先的生命科学前沿机构,华大集团在25周岁生日到来之际,向全球发布最新测序技术——CycloneSEQ测序技术,两款小而美、小而优,拥有自主产权的新型基因测序仪——纳米孔测序仪CycloneSEQ-WT02(以下简称“WT02”,中文名“梧桐”)、CycloneSEQ-WY01(以下简称“WY01”,中文名“五岳”)首次呈现在世...
Nature重磅综述 |关于RNA-seq,你想知道的都在这
建库之后,单独的cDNA分子在流动槽中构建测序簇,使用3’阻断的荧光标记的核苷酸进行边合成边测序。在每一轮测序中,高速摄像机拍照捕获当前激发的荧光,来判断当前是哪个核苷酸合成进来,测序长度在50-500bp。ThePacificBiosciencesworkflow(中):建库之后,每个分子与固定在纳米孔底部的聚合酶结合。然后是边合成边测...
Nature | 一种检测单链DNA突变的新方法:单分子测序
在这种方法应用中:1),增加了每条链的测序通过次数(DNA的中位大小为1.7kb,测序中位数是32);2)在文库准备过程中,通过ssDNA断口链接或者使用NanoSeqA-tailing方法进行末端加尾,或者使用无需加尾的方法,以去除实验过程中的非特异性信号;3)改进了计算机分析算法,以去除计算分析中带来的非特异...
Zygnema藻类基因图谱成功绘制,揭示了水生到陆生植物的进化转变
项目介绍研究人员使用了四种藻属Zygnema菌株,其中两种来自美国的培养物,另两种来自德国。科学家们结合一系列尖端的DNA测序技术,确定了这些藻类的全基因组序列。这些方法使科学家们能够生成这些生物的全染色体水平的完整基因组--这是以前从未在这组藻类上做到过的,将这些基因组与其他植物和藻类的基因组进行比较...
利用DNA和RNA测序组合方法鉴定非小细胞肺癌靶向治疗的基因变异特征
在NSCLC队列中,研究者发现通过DNA或RNA面板测序有五位患者携带METex14(www.e993.com)2024年10月19日。DNA测序显示有11个NSCLC病例携带MET突变,其中只有一个病例在c.3028G>A位点发生MET突变,这预示着在mRNA加工过程中发生了MET外显子14的剪接。通过RNA面板测序也证实了METex14的存在(见图4A)。有四例METex14患者仅通过RNA面板测序发现(见图4B)。
Nature | 怀孕与逆龄的奇妙联系:科学揭示生育对DNA的年轻化效应
评估过程样本收集:通常从血液、唾液或其他体液中提取DNA样本。DNA提取与纯化:对样本中的DNA进行提取和纯化,以准备后续的甲基化分析。甲基化分析:使用技术如甲基化特异性PCR(MSP)、全基因组甲基化测序等,分析样本DNA的甲基化水平。数据分析与解读:将所得的甲基化数据与数据库中的标准年龄相关甲基化模式进行比较...
测序读长达25000碱基,准确性达99.9%之后,PacBio如何开启下一步破局?
SMRTcell芯片是HiFi测序的核心,用于在PacBio长读长测序仪器上进行HiFi测序的化学反应过程。SMRTcell芯片的内部表面包含几百万个纳米级小孔,称为ZMW(零模波导)孔。文库构建完成后,这些经过处理的DNA分子会被随机铺撒到ZMW中。玻璃底板预先标有链酶亲合素,DNA分子上的聚合酶标有生物素,利用生物素合酶亲合素的亲合...
cfDNA甲基化在器官和组织损伤检测中的强大力量
DNA去甲基化:除DNMT外,DNA去甲基化酶(如TET(10-11易位))也是DNA甲基化动态平衡的关键组成部分。TET酶可以从DNA中去除甲基,将5-mC转化为5hmC(5-羟甲基胞嘧啶),并参与DNA去甲基化过程。AID(activation-inducedcytidinedeaminase,活化诱导的胞嘧啶脱氨酶)和AB(Apobec)是脱氨酶,通常与DNA碱基脱氨和脱氧核糖修饰...
SOFT研究基因组测序揭示HR+/HER2-年轻乳腺癌的基因组特征
选择了1509个肿瘤样本进行有针对性的DNA测序,另外,还选择了一个较小的年轻年龄病例对照子样本进行全外显子测序(WES)。经过排除后,有1258个样本可用于分析。来自病例对照子样本的82例年轻患者成功完成了WES,其中73例(78%)成功测序了肿瘤/正常对,9例(10%)成功测序了肿瘤样本,但没有正常样本。主要终点为无远处复发...