上海交通大学医学院多功能全自动蛋白质表达定量分析系统采购项目...

上海交通大学医学院多功能全自动蛋白质表达定量分析系统招标项目的潜在投标人应在上海财瑞招投标平台(httpcairuibidding/)获取招标文件,并于2024年11月07日10:00(北京时间)前递交投标文件。一、项目基本情况项目编号:310000000240711114659-00150220(国际招标编号:1825-244A20242367)项目名称:上海交...

专访诺奖得主David Baker:生物学非常重要,它超越了AI蛋白质设计

Top7基于特定结构设计没有任何功能,但现在我们可以设计具体各种新功能的蛋白质。Q:将蛋白质序列与功能连接起来的领域在哪里?Baker:回到Binder(蛋白质配体结合剂)设计问题,我们正在做的很多事情都是从靶点结构开始。现在使用AlphaFold,可以非常准确地生成许多蛋白质的结构。功能也很重要,因为我们想生成能够治疗疾...

生物医学的大变革:“AlphaFold时刻”给蛋白质科学带来深刻影响

03研究人员开发了名为DeepGO-SE的人工智能工具,能够预测未知蛋白质的功能,为生物技术进步开辟新前沿。04另一方面,MetaAI通过进化尺度建模研究,积极扩展蛋白质设计的边界,标志着蛋白质从头设计领域取得重大进展。05人工智能与蛋白质设计的结合有望为生物技术和医学带来颠覆性的变革,实现按需创建定制功能蛋白质的能力。

认识真正的竹纤维 了解竹纤维的十大性能

性能一:抗菌抑菌竹纤维具有天然抗菌、抑菌的效果,因为竹子含有一种独特物质为“竹琨”,具有天然的抑菌、防螨、防臭、防虫功能。在显微镜下观察,细菌在棉、木等纤维制品中能够大量繁殖,而竹纤维制品上的细菌不但不能长时间生存,而且短时间内还能消失或减少。经国家纺织品检测中心检测数据表明,竹纤维对金黄色葡萄球菌、...

分析蛋白质功能结构域的策略和步骤

使用专门的软件工具,如Pfam、InterPro、SMART等,来预测蛋白序列中可能存在的结构域或功能域。3.三维结构预测如果可行,可以使用如Phyre2、SWISS-MODEL等工具来预测蛋白质的三维结构。这可以提供关于功能域如何在空间中组织的更多信息。4.功能注释结合文献、已有的数据库和实验数据,为预测的功能域进行功能注释。

...实验室青年研究员谈攀发布关于FSFP:基于语言模型的蛋白质功能...

近日,上海交通大学自然科学研究院/物理与天文学院/张江高研院/药学院洪亮教授课题组联合上海人工智能实验室青年研究员谈攀,在蛋白质突变-性质预测上取得重要突破(www.e993.com)2024年11月8日。该工作采用全新的训练策略,在使用极少湿实验数据的情况下,极大地提高了传统蛋白质预训练大模型在突变-性质预测的效果。该研究成果以《Enhancingtheefficien...

清华大学药学院学者开发基于蛋白质语言模型的结构与功能预测方法

蛋白质语言模型,通过对大量序列的自监督学习,能够捕捉到氨基酸残基之间复杂的相互作用和模式。这些模型不仅能够预测蛋白质的三维结构,还能够揭示其功能和动态特性,并展现出优于经典计算生物学方法的表现。田博学课题组开发了一系列的基于蛋白质语言模型的方法,在抗体结构、蛋白质与DNA结合位点、细胞色素450酶活性预测等工作...

Nat. Biotechnol. | 通过全新设计的蛋白质激发功能

设计序列以指定结构和功能图5最终设计目标是只需要一个序列就可以完整描述一个蛋白质,但是一个简单的氨基酸字符串及其推导正确序列的过程,比肉眼所见的复杂得多。当直接检查序列时,可以分析极性和疏水残基的模式以及甘氨酸和脯氨酸的策略性使用,以提供蛋白质属性的简化图像,例如其二级结构内容或它是否可以是一个膜...

初创计划 | NVIDIA 助力深原质药实现基于深度生成的功能蛋白质设计

AlphaFold2解决的是“蛋白质结构预测问题”,即给定蛋白质的氨基酸序列,求解这个蛋白质的三维原子坐标结构。由于蛋白质的空间折叠是由其序列所决定的,同时又有很多已知序列信息以及结构信息作为训练数据,所以这方面的AI模型已经取得了极大的成功,能够以相当高的精度预测一个蛋白质的空间结构。不过结构预测并不等同于...

Mol Cell:魏文胜团队实现人类蛋白质组中赖氨酸位点的功能解码

总的来说,该研究利用碱基编辑技术成功建立了高通量的氨基酸精度功能性筛选方法,为系统性研究蛋白质功能和调控机制提供了新的有效手段。同时,所得到的氨基酸精度的蛋白质功能性大数据为更深入地理解蛋白质调控机制,尤其是翻译后修饰机制,提供了有力的依据(图4)。