Nat Cell Biol丨H3K27me2动态变化揭示小鼠早期胚胎异染色质的建立...

异染色质是染色体上的致密结构区域,通常不进行转录,在维持基因组完整性和基因调控中起着重要作用。异染色质主要分为两种类型,一种是组成型异染色质,这种染色质主要存在于重复元件区域,由组蛋白H3K9三甲基化(H3K9me3)驱动形成。组成型异染色质在早期胚胎发育过程中逐渐形成,其建立机制已被广泛研究。另外一种是获得...

中国科大揭示基因组异染色质化促进piRNA表达的分子机制

该研究以模式生物秀丽隐杆线虫为模型,发现了在基因组上,异染色质化修饰能够促进piRNA的转录生成,并且发现了一个全新的包含Chromo结构域的蛋白--USTC复合物结合依赖蛋白(UAD-2)参与调控异染色质化区域的基因转录。piRNA是一类在动物中保守的非编码小RNA,在转座子沉默、生殖发育、基因表达调控和性别决定等过程中发挥...

【前沿进展】NEJM | 陈玲玲发表长非编码RNA剂量不足引发神发育...

CHASERR是一个保守的lncRNA，在15号染色体上位于染色质重塑酶Chromodomain-helicase-DNA-bindingprotein2（CHD2）基因的上游，可以顺式调控CHD2的表达。已有报道表明，小鼠中Chaserr对于维持CHD2蛋白质表达水平至关重要；纯合体Chaserr敲除小鼠导致产后早期致死，杂合体敲除导致严重的发育阻滞（NatureCommunications,...

关于“超雄”或“超雌”,我们对染色体的了解还太少

X染色体上的XITS基因是控制失活的关键,它并不会转录出能翻译出蛋白质的RNA,而是转录出功能性的非编码RNA,阻碍该条X染色体的活化。XITS基因的表达也随着X染色体的数目而增强。Y染色体上自然并不存在这样的片段,且有趣的是其表达似乎也比X染色体更强烈,克林菲尔特(Klinefelter)综合征即基因型为XXY的患者即使有两条X...

赵蔚/李杰团队揭示磷酸化HDAC6的相分离导致三阴性乳腺癌染色质...

在肿瘤中,染色质结构的异常重组可能导致染色质可及性变化,进而激活原本静默的致癌基因,或抑制抑癌基因表达;染色质结构的改变也可以通过影响染色体表观遗传标记从而调控基因的表达。然而,尽管三维染色质结构对肿瘤表型的影响非常关键,但TNBC三维基因组的调控机制仍知之甚少。

颉伟/王海峰团队等揭示小鼠胚胎失活X染色体高级结构从头建立过程...

该研究系统性描绘了小鼠胚胎失活X染色体三维染色质构象的从头建立过程,其中首次报道了胚胎发育早期失活的X染色体呈现出一种特殊的染色质高级结构——X-megadomains,并深入探究了其形成的分子机制和参与平衡失活X染色体上必要基因激活和全局性转录沉默的潜在功能,为深入理解X染色体失活机制以及染色体高级结构与基因转录调控...

Nature子刊重磅!癌症治疗新靶点——染色体重塑因子

染色质重塑因子是细胞内调控基因表达的重要结构,它们通过复杂的相互作用影响DNA的可及性和转录活性,针对这些复合物进行药物研究,意味着要深入理解其组成、结构和功能,以及它们如何参与疾病的发生和发展,这些研究有利于为疾病诊断和治疗提供新的思路,还可以指导药物的开发和优化,从而增强对多种癌症和其他疾病的治疗效果,为...

Nature:理解大脑疾病和功能的新工具!钟声团队开发全新技术——单...

▲研究在女性前额皮质细胞中揭示了XIST-染色质相互作用的细胞特异性(图片来源:参考资料[1])另一方面,XIST是能够抑制X染色体基因表达的长链非编码RNA,XIST在X染色体上的积累导致女性的一条X染色体被沉默,这个被称作“X染色体失活”的过程平衡了两性的X染色体基因表达水平。而X染色体的不完全失活,可能导致了女性更高...

XIST直接调控初始人类多能细胞中的X连锁基因和常染色体基因

研究人员发现,XIST在X染色体上扩散,并诱导抑制初始hPSC中X连锁基因的表达。令人惊讶的是,XIST还以特定的常染色体区域为目标,在这些区域诱导抑制性染色质变化和基因表达抑制。因此,XIST使雌雄细胞的X连锁基因剂量相等,同时诱导常染色体的差异。在小鼠造血干细胞的XCI启动过程中,Xist的分散配置和常染色体定位也会短暂出现。

人早期胚胎发育的表观遗传调控(染色质组蛋白修饰+DNA甲基化

这一可及性的增加先于第一次谱系决定,表明染色质可及性可能在细胞谱系分离过程中对GRN形成具有重要的功能。仅从转录组数据就可以推断出GRN。然而,在GRN分析中纳入染色质可及性数据可提高准确性,特别是对于人类胚胎数据等低样本量的数据,并且可以预测增强子相关性。这些方法在人类囊胚谱系中鉴定出保守的GRN,由JUND和...