Nature子刊:魏文胜团队实现蛋白质组中丝氨酸、苏氨酸和酪氨酸位点...
图1:蛋白质组功能性丝氨酸、苏氨酸和酪氨酸筛选示意图接着,研究团队对筛选出的功能性位点进行深入分析,特别关注磷酸化修饰。结果显示,677个筛选到的位点可能通过磷酸化修饰影响细胞生长,其中绝大多数为之前未知的功能性磷酸化位点(图2)。进一步研究表明,一些位点突变通过调节磷酸化水平导致信号通路异常,例如MAPK信号通...
Nature:蛋白质测序技术突破:PASTOR单分子水平精准解读蛋白质突变...
这项技术不仅能够区分肽段和蛋白质,还能实时监测蛋白质-蛋白质和蛋白质-配体相互作用,并检测氨基酸和翻译后修饰(post-translationalmodifications,PTMs),如磷酸化(phosphorylation)和糖基化(glycosylation)。该研究中,研究者开发了一种基于纳米孔的长链蛋白质单分子读取方法,通过结合ClpX解折酶(unfoldase)的作用,使...
线粒体蛋白Sirtuin5去琥珀酰化修饰调节线粒体稳态介导椎间盘退变
琥珀酰化(Succinylation)是最近发现的蛋白质翻译后修饰,涉及可逆的蛋白质修饰过程,通常发生在赖氨酸残基上,琥珀酰辅酶A(succinyl-CoA)是赖氨酸琥珀酰化的辅因子。由于琥珀酰辅酶A是在线粒体中产生的,因此琥珀酰化是调节线粒体内关键代谢过程的基本生物学过程。越来越多的证据表明,靶向线粒体蛋白Sirtuin5(SIRT5)...
...锋团队揭示糖基化修饰影响P-糖蛋白介导的乳腺癌耐药的生物学功能
平分型GlcNAc修饰能够调控N-糖链的延伸及末端修饰,从而影响蛋白质的生物学功能。该研究发现,乳腺癌耐药患者中平分型GlcNAc修饰显著降低;提高平分型GlcNAc水平显著抑制乳腺癌的耐药过程;糖肽质谱检测发现,P-gp的Asn494位点具有平分型GlcNAc修饰,该修饰通过抑制Ezrin蛋白与P-gp蛋白的相互作用进而降低P-gp的膜定位及耐药能...
专家点评Nat Metab | 薛宇/贾大团队合作揭示生酮饮食发挥作用的新...
生酮饮食通过赖氨酸β-羟基丁酰化修饰调控多种细胞过程,包括糖酵解和三羧酸循环等。为了找到发挥重要功能的赖氨酸β-羟基丁酰化修饰位点,基于前沿人工智能技术,设计了新的分层学习框架(Hierarchicallearningframework)pFunK,是首个预测蛋白质修饰功能的语言模型。该框架采用分层思维,巧妙利用Transformer模型捕捉序列之间的...
JACS | 上海药物所开发蛋白质N端选择性的可逆修饰新策略
蛋白质的化学修饰通过模拟生物体内蛋白翻译后修饰过程,极大地促进了人们对蛋白质结构和功能特性的理解和调控,包括对于蛋白质药物的性质和功能的优化和拓展,如聚乙二醇化的蛋白质药物和抗体药物偶联物等(www.e993.com)2024年10月17日。其中,蛋白的可逆修饰是通过对蛋白结构进行可控的笼化/脱笼过程实现其功能更精确的操纵,在可逆共价抑制剂的开发、抗体...
线粒体蛋白Sirtuin5去琥珀酰化修饰介导压缩诱导的椎间盘退变
Sirt5是线粒体中重要的去琥珀酰化修饰酶,也是压缩下变化最显著的基因。进一步的蛋白质印迹试验表明,1.0MPa压缩也以时间依赖性方式显著抑制NP细胞中SIRT5的表达。通过收集不同Pfirrmann等级MRI图像的患者样本进一步确认IDD与SIRT5表达之间的关系,发现SIRT5表达与IDD严重程度呈负相关。这些结果...
蛋白质精氨酸甲基化修饰参与植物抗病毒的免疫机制
蛋白质精氨酸甲基化修饰是真核生物中广泛存在的、进化上保守的具有重要调控功能的蛋白质翻译后修饰之一,该修饰由蛋白质精氨酸甲基转移酶(ProteinArginineMethyltransferases,PRMTs)催化完成。依据催化类型的不同,PRMTs主要分为催化形成非对称性双甲基化的I型酶和催化形成对称性双甲基化的II型酶(图1)。I型和II型的...
Nature子刊:赵英明/张迪团队等开发区分蛋白质乳酰化修饰同分异构...
赖氨酸乳酰化修饰,自2019年首次被报道之后,便因其在调控多种生理和病理过程中的潜在作用而受到广泛关注。这一翻译后修饰不仅为乳酸的非代谢功能研究开辟了新的视角,而且提供了一种新的蛋白质调控机制。赖氨酸乳酰化修饰有三种同分异构体:L-乳酰化(KL-la)、D-乳酰化(KD-la)以及羧乙基化(Kce)。这三种修饰都可能...
...上海交大团队研发人工蛋白调节剂,可促进神经元蛋白质功能重编程
在生命系统中,蛋白质发挥着重要的生物功能。对于蛋白质的生物学功能来说,存在受到翻译后修饰调控的特点。其中,蛋白磷酸酶与激酶通过协同调控所发生的可逆磷酸化,是上述特点最主要的形式之一。然而,在病理微环境之中,蛋白磷酸酶的催化活性会受到损害,导致α-突触核蛋白和tau蛋白等神经元蛋白,发生不可逆的磷酸化...