在渔业养殖中,微生物对环境影响严重,如何治理水体中细菌群落?
2024年2月15日 - 网易
使用FAPROTAX对细菌群落功能进行预测应用Manteltest分析检验相关性及其显著性水平,基于Bray-Curtis距离进行NMDS分析,并采用相似度分析(ANOSIM)来评估不同组间细菌群落的差异性.以上结果绘图在R语言(R.4.1.2)中完成.采用随机矩阵原理构建不同环境样品细菌共现网络,根据模块内连接度(Zi)和模块间连接度(Pi)确定各ASV的...
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宏基因组学技术与微生物群落多样性分析方法
2022年4月20日 - 网易
由于使用样本间两两成对不相似性矩阵,PCoA的排序轴与原始变量间并不存在直接关系,但其方差解释度还是能够通过校正后的不相似性矩阵特征值给出。非度量多维尺度分析(NMDS)是一种特殊的排序方法,进行分析时往往会进行多次迭代排序,以求取得尽量小的胁迫值(原的样品间不相似性被改的程度的量化指标),一般认为胁迫值小...
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最新科研 | 上交瑞金医院&吉林大学:多组学研究表明短双歧杆菌M...
2022年3月30日 - 健康界
最内环是物种水平;对照组为红色,PS组为绿色,M-16V组为绿色;(B)通过LEfSe计算细菌类群的相对丰度;每个条表示特定分类单元效应大小的log10(LDAscore);较高的LDA值表示为较长的条形图;绿色代表比对照更丰富的细菌类群,反之亦然;(C)在属水平上的物种丰富度聚类热图;颜色代表物种丰富度,从蓝色到红色的颜色渐变表明...
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