基因测序行业概况:技术创新引领未来,精准医疗与数据安全并行发展
政策层面给予大力支持,如《政府采购进口产品审核指导标准》要求测序仪(二代测序平台)100%国产采购,促进了国产基因测序仪的商业化进程。三、行业产业链基因测序产业链上游为基因测序设备和基因测序服务所需的试剂耗材的供应,包括基因测序仪器、配套的耗材及IVD试剂等,主要为基因测序技术提供基本所需的硬件设施和原材料。
中科院动物所金坚石组综述16S rRNA基因扩增子测序技术的前世今生
首先,16SrRNA基因扩增子测序实验方法的研发有以下几个重要的时间节点(图1)。1985年,Pace等人首次通过测序16SrRNA基因序列来分析细菌菌群的组成。他们针对16SrRNA基因的可变区之间的保守区域设计了DNA探针并通过探针杂交进行16SrRNA基因的纯化富集,然后通过DNA克隆扩增和Sanger测序进行测序分析;中间无需培养细菌。
中国智造让基因测序技术突破受制于人困境
据了解,DNBSEQTM测序技术主要包括:DNA单链环化和DNB制备、规则阵列芯片、DNB加载、cPAS、双端测序技术、碱基识别算法等。在DNBSEQTM测序技术中,仪器气液系统会先将DNA纳米球泵入到规则阵列芯片并加以固定,然后泵入测序模板及测序试剂,最终获得待测样本的碱基序列信息。目前,cPAS已经广泛被应用于华大智造开发的BGISEQ-...
利用DNA和RNA测序组合方法鉴定非小细胞肺癌靶向治疗的基因变异特征
注:图1A.覆盖前述所有驱动基因的DNA组测序(769个基因)用于EGFR、KRAS、HER2和BRAF基因的SNV/indel检测;图1B.MET和HER2基因的CNV;图1A,B.NSCLC队列中EGFR的SNV/indel数为201例(52.1%),MET的CNV数为16例(4.1%);图1C.通过DNA和RNA面板测序检测ALK、ROS1、RET、NTRK和METex14的基因融合。02...
华大智造获得发明专利授权:“基因测序反应设备、基因测序系统和...
专利摘要:一种基因测序反应设备、基因测序系统和基因测序反应方法。基因测序反应设备包括支撑平台(8);浸泡容器,设置于所述支撑平台(8)上,所述浸泡容器具有浸泡反应区,所述浸泡反应区用于盛放基因测序反应用化学试剂并用于将表面具有DNA样品加载结构且已加载有DNA样品的测序芯片(2)浸泡于所述化学试剂中进行基因测序反应...
Nature重磅综述 |关于RNA-seq,你想知道的都在这
图一:short-read,long-read和directRNA-seq技术和工作流程图一:A3种RNA测序方式的建库方法概览:short-read测序(黑色),long-readcDNA测序(绿色)和long-readdirectRNA-seq(蓝色)(www.e993.com)2024年10月19日。根据不同的应用目的,文库构建的复杂性和偏好性不同。short-read和long-readcDNA的建库方案在很多步骤是一样的,比如在所有...
Nature Genetics | 高通量空间转录组技术推动器官发生研究:MAGIC...
测序深度和基因数量的饱和曲线:图d展示了不同空间转录组方法在不同测序深度下检测到的基因数量饱和曲线,MAGIC-seq在同等测序深度下检测到的基因数量明显高于其他方法,显示出其更高的测序效率。采集面积和成本的比较:图e和图f展示了MAGIC-seq与其他方法在采集面积、采集点数量和每个采集点的成本方面的比较,MAGIC-seq...
北航李春燕团队全面总结组学技术在增强子研究中的应用
转录组方法可以直接检测基因或增强子的表达。在增强子研究中,常用的方法包括RNA-seq、微阵列和STARR-seq。RNA-seq是一种广泛应用于转录组研究的测序技术,可全面分析基因表达水平。微阵列技术则通过检测基因组中的基因表达水平,揭示增强子与基因表达的关系。STARR-seq是一种针对增强子活性开发的测序方法,通过大规模并行的...
基于宏基因组二代测序快速诊断儿童人细小病毒B19脑膜炎
进一步通过传统PCR扩增法以HPVB19特异性基因片段设计引物进行特异性扩增并将扩增产物利用二代测序技术进行测序比对,与HPVB19基因片段完全匹配(见图4和图5)。打开网易新闻查看精彩图片Lane1:50bpDNALadder;Lane2~5:HPVB19;Lane6~7:β-Actin;Lane8:DL2000...
一文解析中标数持续增长的热点:可变剪切
每个基因(Fn1-SE,Nrp2-SE,Sp7-SE,Sirt2-SE,和Spp1-SE)都有相应的图表:蓝色条代表基因的编码区域,即外显子;红色峰值表示YBX1蛋白在RNA上的结合位点,其强度反映了结合的密集程度。分析方法:识别重要区域:每张图中虚线区域表示外显子跳跃的位置...