IP与质谱方法比较:深度解读蛋白质组学样本
(1)蛋白质鉴定和定量:质谱方法可以鉴定样本中的蛋白质,并测量其相对丰度,从而了解样本中蛋白质的组成和表达水平。(2)蛋白质修饰研究:质谱方法可以鉴定和定量样本中的蛋白质修饰,如磷酸化、甲基化等,以研究其在生物过程中的功能和调控机制。(3)蛋白质亚细胞定位研究:通过质谱方法可以鉴定样本中的亚细胞定位蛋白质,...
手把手教你看高分辨质谱的色谱质谱图
离子丰度(Abundanceofions):检测器检测到的离子信号强度。离子相对丰度(Relativeabundanceofions):以质谱图中指定质荷比范围内最强峰为100%,其它离子峰对其归一化所得的强度。基峰(Basepeak):在质谱图中,指定质荷比范围内强度最大的离子峰叫作基峰。基峰的相对丰度为100%。总离子流图(Totalions...
iMeta | 东北林业大学冯富娟组发现丛枝菌根真菌诱导削弱镉的迁移
此外,最丰富的前45个属的相对丰度如图2B所示,其中优势属为Dyella(30.59%)、LWQ8(27.69%)、Burkholderia(23.83%)、Massilia(23.08%)、Rhodanobacter(16.65%)、Sphingomonas(16.44%)、Novosphingobium(13.39%)、Enterococcus(7.5%)、Bacillus(5.7%)和Micropepsis(4.8%)。较CK而言,Cd处理组中Dyella和Micropepsis的...
《食品科学》:长春中医药大学徐晓红教授等:蓝靛果多酚对免疫抑制...
从细菌门水平分析,如图4A所示,相对丰度最高的10个菌群分别为厚壁菌门(Firmicutes)、拟杆菌门(Bacteroidetes)、疣微菌门(Verrucomicrobia)、ε-变形菌纲(Epsilonbacteraeota)、软壁菌门(Tenericutes)、变形菌门(Proteobacteria)、脱铁杆菌门(Deferribacteria)、狄氏副拟杆菌(Patescibacteria)、放线菌门(Actinobacteria)...
蛋白质组学绝对定量和相对定量:拓展蛋白质组定量的新视野
相对定量是指通过测量蛋白质样品中蛋白质的相对丰度变化,来比较不同条件下的蛋白质表达水平。相对定量方法主要基于质谱技术,如定量蛋白质组学中的Label-Free方法和TMT(TandemMassTagging)方法。Label-Free方法通过测量样品中蛋白质的峰面积或峰高度来定量蛋白质的相对丰度。这种方法不需要额外的标记物,通过比较不同...
血浆蛋白新视角——低丰度小蛋白!
研究团队采用分组DDA方法采集质谱数据,与收录有42,325蛋白序列的Uniprot数据库进行比对,鉴定出900多个蛋白质和6000多个肽段(www.e993.com)2024年10月19日。4最终研究团队鉴定的已知小蛋白超过125种,还鉴定出一种新发现的人血浆蛋白——C5ORF46。应用SPEA方法与传统非富集方法鉴定到的蛋白丰度相似。
南昌大学预算1730万采购4套代谢/蛋白组学研究质谱(附详细技术指标)
项目名称:南昌大学食品学院发酵工程领域大型系列化研究设施(代谢组学研究质谱等)采购项目预算金额:1730.0000000万元(人民币)技术要求一、代谢组学研究质谱:1.基本配置要求:1.1四极杆-飞行时间质谱仪(配备独立ESI、APCI离子源):2套。1.2系统软件:2套,包括:质谱采集分析软件、高通量定量模块软件,定性处理...
这些科学家照亮同位素质谱发展之路
①绝对丰度:指某一同位素在所有各种稳定同位素总量中的相对份额。②相对丰度:指同一元素各同位素的相对含量。例如12C=98.892%,13C=1.108%。大多数元素由两种或两种以上同位素组成,少数元素为单同位素元素例如19F=100%4、R值和δ值①一般定义同位素比值R为某一元素的重同位素原子丰度与轻同位素原子丰度之比.例如...
气相色谱-质谱联用法测纺织品N-甲基吡咯烷酮
将提取液过滤于浓缩瓶中。残渣再用30mL乙酸乙酯超声提取20min,合并滤液,经旋转蒸发仪浓缩至近干,浓缩瓶置于30℃水浴中用旋转蒸发仪缓慢浓缩至近干,用乙酸乙酯定容至2mL,过0.45μm有机相滤膜后供气相色谱-质谱测定和确证。1.5样品中NMP含量的计算样品中NMP的含量计算公式如下:...
FSHW | NanoLC-Orbitrap质谱检测三种中国高油酸品种花生中的致敏...
结合PSMs值和丰度值,分别来自Arah1和Arah3的IVQIEAKPNTLVLPK、SSNPDIYNPQAGSLR、AQSENEYEYLAFK丰度高、质谱响应性好,可用作检测其他基质中致敏蛋白的特异性标记肽段。图23中高油酸品种花生中特异性肽段的相对丰度Conclusion本研究开发了一种稳健可行的基于OrbitrapFusion的质谱检测方法和特异性肽段筛选...